RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561685.1

RRN3-204, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, humanhuman

TSL 5

Gene RRN3, Length 615 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3-204ENST00000561685 Q6ZVH6 145 aa2.44□□□□□ -2.02
RRN3-204ENST00000561685 DET1Q7L5Y6 550 aa2.44□□□□□ -2.02
RRN3-204ENST00000561685 AVL9Q8NBF6 648 aa2.44□□□□□ -2.02
RRN3-204ENST00000561685 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa2.44□□□□□ -2.02
RRN3-204ENST00000561685 C11orf52Q96A22 123 aa2.44□□□□□ -2.02
RRN3-204ENST00000561685 LINC00167Q96N53 147 aa2.44□□□□□ -2.02
RRN3-204ENST00000561685 CCDC28BQ9BUN5 200 aa2.44□□□□□ -2.02
RRN3-204ENST00000561685 SLC2A11Q9BYW1 496 aa2.44□□□□□ -2.02
RRN3-204ENST00000561685 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
RRN3-204ENST00000561685 CLEC5AQ9NY25 188 aa2.44□□□□□ -2.02
RRN3-204ENST00000561685 KLK11Q9UBX7 282 aa2.44□□□□□ -2.02
RRN3-204ENST00000561685 DUOX1Q9NRD9 1551 aa2.44□□□□□ -2.02
RRN3-204ENST00000561685 SALL1Q9NSC2 1324 aa2.43□□□□□ -2.02
RRN3-204ENST00000561685 SCN9AQ15858 1988 aa2.43□□□□□ -2.02
RRN3-204ENST00000561685 C2CD3Q4AC94 2353 aa2.43□□□□□ -2.02
RRN3-204ENST00000561685 PSME4Q14997 1843 aa2.43□□□□□ -2.02
RRN3-204ENST00000561685 RLFQ13129 1914 aa2.43□□□□□ -2.02
RRN3-204ENST00000561685 A0A087WZ39 114 aa2.43□□□□□ -2.02
RRN3-204ENST00000561685 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa2.43□□□□□ -2.02
RRN3-204ENST00000561685 MTMR11A4FU01 709 aa2.43□□□□□ -2.02
RRN3-204ENST00000561685 E9PAM4 449 aa2.43□□□□□ -2.02
RRN3-204ENST00000561685 CLDN4O14493 209 aa2.43□□□□□ -2.02
RRN3-204ENST00000561685 HAT1O14929 419 aa2.43□□□□□ -2.02
RRN3-204ENST00000561685 SAP30O75446 220 aa2.43□□□□□ -2.02
RRN3-204ENST00000561685 GJB3O75712 270 aa2.43□□□□□ -2.02
RRN3-204ENST00000561685 BBOX1O75936 387 aa2.43□□□□□ -2.02
RRN3-204ENST00000561685 ACSL3O95573 720 aa2.43□□□□□ -2.02
RRN3-204ENST00000561685 RENP00797 406 aa2.43□□□□□ -2.02
RRN3-204ENST00000561685 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP2.43□□□□□ -2.02
RRN3-204ENST00000561685 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP2.43□□□□□ -2.02
RRN3-204ENST00000561685 ADORA3P0DMS8 318 aa2.43□□□□□ -2.02
RRN3-204ENST00000561685 PORP16435 677 aaPredicted RBP2.43□□□□□ -2.02
RRN3-204ENST00000561685 C4BPBP20851 252 aa2.43□□□□□ -2.02
RRN3-204ENST00000561685 ZBTB25P24278 435 aa2.43□□□□□ -2.02
RRN3-204ENST00000561685 ELK3P41970 407 aa2.43□□□□□ -2.02
RRN3-204ENST00000561685 RPL34P49207 117 aaKnown RBP2.43□□□□□ -2.02
RRN3-204ENST00000561685 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP2.43□□□□□ -2.02
RRN3-204ENST00000561685 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP2.43□□□□□ -2.02
RRN3-204ENST00000561685 ACY1Q03154 408 aa2.43□□□□□ -2.02
RRN3-204ENST00000561685 SIGLEC14Q08ET2 396 aa2.43□□□□□ -2.02
RRN3-204ENST00000561685 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa2.43□□□□□ -2.02
RRN3-204ENST00000561685 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP2.43□□□□□ -2.02
RRN3-204ENST00000561685 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP2.43□□□□□ -2.02
RRN3-204ENST00000561685 MEA1Q16626 185 aa2.43□□□□□ -2.02
RRN3-204ENST00000561685 DUSP5Q16690 384 aa2.43□□□□□ -2.02
RRN3-204ENST00000561685 Q1RN00 199 aa2.43□□□□□ -2.02
RRN3-204ENST00000561685 VWC2Q2TAL6 325 aa2.43□□□□□ -2.02
RRN3-204ENST00000561685 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa2.43□□□□□ -2.02
RRN3-204ENST00000561685 C9orf66Q5T8R8 295 aa2.43□□□□□ -2.02
RRN3-204ENST00000561685 TMEM64Q6YI46 380 aa2.43□□□□□ -2.02
RRN3-204ENST00000561685 CAMKMTQ7Z624 323 aa2.43□□□□□ -2.02
RRN3-204ENST00000561685 ANKRD23Q86SG2 305 aa2.43□□□□□ -2.02
RRN3-204ENST00000561685 SERINC5Q86VE9 423 aa2.43□□□□□ -2.02
RRN3-204ENST00000561685 LRTM2Q8N967 370 aa2.43□□□□□ -2.02
RRN3-204ENST00000561685 OR4C15Q8NGM1 316 aa2.43□□□□□ -2.02
RRN3-204ENST00000561685 MRAPQ8TCY5 172 aa2.43□□□□□ -2.02
RRN3-204ENST00000561685 SSC4DQ8WTU2 575 aa2.43□□□□□ -2.02
RRN3-204ENST00000561685 CASP10Q92851 521 aa2.43□□□□□ -2.02
RRN3-204ENST00000561685 COG3Q96JB2 828 aa2.43□□□□□ -2.02
RRN3-204ENST00000561685 MUS81Q96NY9 551 aa2.43□□□□□ -2.02
RRN3-204ENST00000561685 ZIM3Q96PE6 472 aa2.43□□□□□ -2.02
RRN3-204ENST00000561685 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP2.43□□□□□ -2.02
RRN3-204ENST00000561685 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP2.43□□□□□ -2.02
RRN3-204ENST00000561685 SDF4Q9BRK5 362 aa2.43□□□□□ -2.02
RRN3-204ENST00000561685 DEFB129Q9H1M3 183 aa2.43□□□□□ -2.02
RRN3-204ENST00000561685 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP2.43□□□□□ -2.02
RRN3-204ENST00000561685 PDE7BQ9NP56 450 aa2.43□□□□□ -2.02
RRN3-204ENST00000561685 FBXL4Q9UKA2 621 aa2.43□□□□□ -2.02
RRN3-204ENST00000561685 PILRBQ9UKJ0 227 aa2.43□□□□□ -2.02
RRN3-204ENST00000561685 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP2.43□□□□□ -2.02
RRN3-204ENST00000561685 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP2.43□□□□□ -2.02
RRN3-204ENST00000561685 COL12A1Q99715 3063 aa2.43□□□□□ -2.02
RRN3-204ENST00000561685 ABCC12Q96J65 1359 aa2.43□□□□□ -2.02
RRN3-204ENST00000561685 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP2.43□□□□□ -2.02
RRN3-204ENST00000561685 SPTA1P02549 2419 aa2.43□□□□□ -2.02
RRN3-204ENST00000561685 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP2.43□□□□□ -2.02
RRN3-204ENST00000561685 FRMPD3Q5JV73 1810 aa2.42□□□□□ -2.02
RRN3-204ENST00000561685 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa2.42□□□□□ -2.02
RRN3-204ENST00000561685 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa2.42□□□□□ -2.02
RRN3-204ENST00000561685 FAM220BPB1ANY3 271 aa2.42□□□□□ -2.02
RRN3-204ENST00000561685 CCL24O00175 119 aa2.42□□□□□ -2.02
RRN3-204ENST00000561685 LY6G6DO95868 133 aa2.42□□□□□ -2.02
RRN3-204ENST00000561685 ANPEPP15144 967 aa2.42□□□□□ -2.02
RRN3-204ENST00000561685 ATP6V1B1P15313 513 aa2.42□□□□□ -2.02
RRN3-204ENST00000561685 SELEP16581 610 aa2.42□□□□□ -2.02
RRN3-204ENST00000561685 SFTPDP35247 375 aa2.42□□□□□ -2.02
RRN3-204ENST00000561685 CCR3P51677 355 aa2.42□□□□□ -2.02
RRN3-204ENST00000561685 LIMK1P53667 647 aa2.42□□□□□ -2.02
RRN3-204ENST00000561685 PRKG2Q13237 762 aa2.42□□□□□ -2.02
RRN3-204ENST00000561685 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP2.42□□□□□ -2.02
RRN3-204ENST00000561685 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP2.42□□□□□ -2.02
RRN3-204ENST00000561685 C6orf163Q5TEZ5 329 aa2.42□□□□□ -2.02
RRN3-204ENST00000561685 OR4C11Q6IEV9 310 aa2.42□□□□□ -2.02
RRN3-204ENST00000561685 CYB5D1Q6P9G0 228 aa2.42□□□□□ -2.02
RRN3-204ENST00000561685 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP2.42□□□□□ -2.02
RRN3-204ENST00000561685 CARM1Q86X55 608 aa2.42□□□□□ -2.02
RRN3-204ENST00000561685 C11orf42Q8N5U0 333 aa2.42□□□□□ -2.02
RRN3-204ENST00000561685 OR9Q2Q8NGE9 314 aa2.42□□□□□ -2.02
RRN3-204ENST00000561685 TEKT4Q8WW24 435 aa2.42□□□□□ -2.02
RRN3-204ENST00000561685 ROBO4Q8WZ75 1007 aa2.42□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms