RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560424.1

SMAD3-215, Transcript of SMAD family member 3, humanhuman

TSL 3

Gene SMAD3, Length 775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3-215ENST00000560424 ASZ1Q8WWH4 475 aa8.7□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 STON2Q8WXE9 905 aa8.7□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 RAD51AP1Q96B01 352 aa8.7□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 LPAR4Q99677 370 aa8.7□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 GPR21Q99679 349 aa8.7□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 SIKE1Q9BRV8 207 aa8.7□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 MENTQ9BUN1 341 aa8.7□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 VN1R1Q9GZP7 353 aa8.7□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 CDCP1Q9H5V8 836 aa8.7□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 MMP25Q9NPA2 562 aa8.7□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 DMRT3Q9NQL9 472 aa8.7□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 THAP1Q9NVV9 213 aa8.7□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 CRIM1Q9NZV1 1036 aa8.7□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 XPR1Q9UBH6 696 aa8.7□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 HAO1Q9UJM8 370 aa8.7□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 TMCO1Q9UM00 188 aa8.7□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 FN1P02751 2386 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 SYCE1LA8MT33 242 aa8.69□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 RNF212BA8MTL3 300 aa8.69□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 INAFM1C9JVW0 142 aa8.69□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa8.69□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 E5RI56 91 aa8.69□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 NPIPA2E9PIF3 369 aa8.69□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 NPIPA3F8WFD2 350 aa8.69□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 H0YGG7 62 aa8.69□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 FCHO1O14526 889 aa8.69□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 MAN1A2O60476 641 aa8.69□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 KERAO60938 352 aa8.69□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 NIPSNAP2O75323 286 aa8.69□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 ATE1O95260 518 aa8.69□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 MYL2P10916 166 aa8.69□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 CHRM3P20309 590 aa8.69□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 SAT1P21673 171 aa8.69□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 ACVR2AP27037 513 aa8.69□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 RGS4P49798 205 aa8.69□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 HK2P52789 917 aa8.69□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 DLX5P56178 289 aa8.69□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 IL2P60568 153 aa8.69□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 DCAF7P61962 342 aa8.69□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 ZNF460Q14592 562 aa8.69□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 HKDC1Q2TB90 917 aa8.69□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 PRTGQ2VWP7 1150 aa8.69□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 TTLL9Q3SXZ7 439 aa8.69□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 FLYWCH1Q4VC44 716 aa8.69□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 CDKL4Q5MAI5 379 aa8.69□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 ZNF585AQ6P3V2 769 aa8.69□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa8.69□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 SLC22A15Q8IZD6 547 aa8.69□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 ANKS4BQ8N8V4 417 aa8.69□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 CCDC63Q8NA47 563 aa8.69□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 STAG3L4Q8TBR4 150 aa8.69□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 CREB3L4Q8TEY5 395 aa8.69□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 ATOH8Q96SQ7 321 aa8.69□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 PLCD4Q9BRC7 762 aa8.69□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 DPH7Q9BTV6 452 aa8.69□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa8.69□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 ATG10Q9H0Y0 220 aa8.69□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa8.69□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 HRH3Q9Y5N1 445 aa8.69□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 PRSS21Q9Y6M0 314 aa8.69□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 ACOT7O00154 380 aa8.68□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 PEX1O43933 1283 aa8.68□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 NRP2O60462 931 aa8.68□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 DLX3O60479 287 aa8.68□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 NPHS1O60500 1241 aa8.68□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 MTHFD2P13995 350 aa8.68□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 BGNP21810 368 aa8.68□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 AOAHP28039 575 aa8.68□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 PLGLB1Q02325 96 aa8.68□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 BST1Q10588 318 aa8.68□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 STX3Q13277 289 aa8.68□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 CHI3L2Q15782 390 aa8.68□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 CMPK2Q5EBM0 449 aa8.68□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 OTOAQ7RTW8 1153 aa8.68□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 ADCK2Q7Z695 626 aa8.68□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 ANKRD37Q7Z713 158 aa8.68□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa8.68□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 C10orf107Q8IVU9 208 aa8.68□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 SULF2Q8IWU5 870 aa8.68□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 HOMEZQ8IX15 550 aa8.68□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 OR5M9Q8NGP3 310 aa8.68□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 MAGEC3Q8TD91 643 aa8.68□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 FAM222BQ8WU58 562 aa8.68□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 L3HYPDHQ96EM0 354 aa8.68□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms