RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559557.1

MRPS11-208, Transcript of mitochondrial ribosomal protein S11, human

TSL 3

Gene MRPS11, Length 447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPS11-208	ENST00000559557	WSCD2	Q2TBF2	565 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	MYLK3	Q32MK0	819 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	SLC9B2	Q86UD5	537 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	ZNF677	Q86XU0	584 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	PHF13	Q86YI8	300 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	ARHGAP12	Q8IWW6	846 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	DSEL	Q8IZU8	1212 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	RYBP	Q8N488	228 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	SCCPDH	Q8NBX0	429 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	ZNF248	Q8NDW4	579 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	CCL4L1	Q8NHW4	92 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	OR1E3	Q8WZA6	343 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	TSACC	Q96A04	125 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	NTAN1	Q96AB6	310 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	RAB7B	Q96AH8	199 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	CELF6	Q96J87	481 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	GDAP1L1	Q96MZ0	367 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	ZNF578	Q96N58	590 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	CD180	Q99467	661 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	CCDC3	Q9BQI4	270 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	BARHL1	Q9BZE3	327 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	PDCL3	Q9H2J4	239 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	POLR1B	Q9H9Y6	1135 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	NOD2	Q9HC29	1040 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	FGF22	Q9HCT0	170 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	MRPL40	Q9NQ50	206 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	ALKBH4	Q9NXW9	302 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	CISD1	Q9NZ45	108 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	ADAM22	Q9P0K1	906 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	OR1A2	Q9Y585	309 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	CSNK1G3	Q9Y6M4	447 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	LRRK2	Q5S007	2527 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	CSMD2	Q7Z408	3487 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557		A0A0U1RQS6	177 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	CXorf51A	A0A1B0GTR3	108 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	TMEM202	A6NGA9	273 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	SIGLEC16	A6NMB1	481 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	ERI2	A8K979	691 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557		D6RAR5	112 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	SOCS6	O14544	535 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	TRAFD1	O14545	582 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	RRP8	O43159	456 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	KLK10	O43240	276 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	BUB1	O43683	1085 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	CREB3	O43889	395 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	PRAMEF11	O60813	436 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	NDUFS7	O75251	213 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	TM7SF2	O76062	418 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	POP4	O95707	220 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	IGSF6	O95976	241 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	PCCB	P05166	539 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	CFC1B	P0CG36	223 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	CFC1	P0CG37	223 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	ALPPL2	P10696	532 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	KRT3	P12035	628 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	ITIH1	P19827	911 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	TNFAIP3	P21580	790 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	SERPINB3	P29508	390 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	RYK	P34925	604 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	ETV5	P41161	510 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	NSF	P46459	744 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	FUT6	P51993	359 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	TERF1	P54274	439 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	SNX16	P57768	344 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	ERVPABLB-1	P60509	514 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	RHOA	P61586	193 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	SLC20A2	Q08357	652 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	SGCG	Q13326	291 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	DPYS	Q14117	519 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	IHH	Q14623	411 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	BRD3	Q15059	726 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	TGIF1	Q15583	401 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	CTF1	Q16619	201 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	TMEM52B	Q4KMG9	183 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	FAM182A	Q5T1J6	154 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	TXNRD3NB	Q6F5E7	133 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	DNAJC24	Q6P3W2	148 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	WDR73	Q6P4I2	378 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	CLEC17A	Q6ZS10	378 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	SLFN11	Q7Z7L1	901 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	MCOLN2	Q8IZK6	566 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	UMODL1-AS1	Q8N2C9	162 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	MSANTD4	Q8NCY6	345 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	CXorf40A	Q8TE69	158 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	SNRNP27	Q8WVK2	155 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	KCNE4	Q8WWG9	221 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	RAB40A	Q8WXH6	277 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	ERGIC1	Q969X5	290 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	SMIM14	Q96QK8	99 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	ERGIC2	Q96RQ1	377 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	IL12RB2	Q99665	862 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	AGPAT1	Q99943	283 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	SNRNP25	Q9BV90	132 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	SLC39A8	Q9C0K1	460 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	SYNDIG1	Q9H7V2	258 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	SMYD2	Q9NRG4	433 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	ETNK2	Q9NVF9	386 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	CHMP5	Q9NZZ3	219 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	TAAR2	Q9P1P5	351 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MRPS11-208	ENST00000559557	SPAST	Q9UBP0	616 aa		4.19	□□□□□ -1.74

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