RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546621.5

CS-204, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 1,513 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-204ENST00000546621 RAD51AP1Q96B01 352 aa7.43□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 REPS1Q96D71 796 aa7.43□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 SIPA1Q96FS4 1042 aa7.43□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 RNF170Q96K19 258 aa7.43□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 APOLD1Q96LR9 279 aa7.43□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 TSSK3Q96PN8 268 aa7.43□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 CITED4Q96RK1 184 aa7.43□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 C9orf16Q9BUW7 83 aa7.43□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 EFCAB11Q9BUY7 163 aa7.43□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP7.43□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 ALG2Q9H553 416 aa7.43□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 EPS8L2Q9H6S3 715 aa7.43□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 ADPRHL2Q9NX46 363 aa7.43□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 VPS29Q9UBQ0 182 aa7.43□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 ACSL5Q9ULC5 683 aa7.43□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 FZD4Q9ULV1 537 aa7.43□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 ATG2BQ96BY7 2078 aa7.43□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 TBC1D3EA0A087X179 549 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 A0A1W2PRG6 482 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 AQP12BA6NM10 295 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 TBC1D3LB9A6J9 549 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 AXIN1O15169 862 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 SSX5O60225 188 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 KCNK2O95069 426 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 APOC1P02654 83 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 CEACAM5P06731 702 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 SLC35G4P0C7Q5 338 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 TBC1D3HP0C7X1 549 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 ERGP11308 486 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 ACADMP11310 421 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 ACP5P13686 325 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 RAB3AP20336 220 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 TACR1P25103 407 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 ERP29P30040 261 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 GRIA3P42263 894 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 RAD23AP54725 363 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 RACK1P63244 317 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 ARHGAP19Q14CB8 494 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 ZNF124Q15973 351 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 MAPKAPK3Q16644 382 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 PAGE2BQ5JRK9 111 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 CATSPEREQ5SY80 951 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 LCN8Q6JVE9 175 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 ALKBH2Q6NS38 261 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 ZNF773Q6PK81 442 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 LCTLQ6UWM7 567 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 LYPD8Q6UX82 237 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 USP30Q70CQ3 517 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 RHOUQ7L0Q8 258 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 PRSS42Q7Z5A4 293 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 LYSMD2Q8IV50 215 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 AQP12AQ8IXF9 295 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 CCDC36Q8IYA8 594 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 LAS2Q8IYD9 372 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 SLC44A3Q8N4M1 653 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 SVOPQ8N4V2 548 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 ANKFN1Q8N957 763 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 FAM47BQ8NA70 645 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 OR7G3Q8NG95 312 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 OR8J3Q8NGG0 315 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 OR8K3Q8NH51 312 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 DNAJB8Q8NHS0 232 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 HUS1BQ8NHY5 278 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 ZFAND1Q8TCF1 268 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 ASB12Q8WXK4 309 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 UFD1Q92890 307 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 PTP4A1Q93096 173 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 TESCQ96BS2 214 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 TBC1D20Q96BZ9 403 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 PPM1MQ96MI6 270 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 TMEM74Q96NL1 305 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 IL17FQ96PD4 163 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 BBS4Q96RK4 519 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 PKP2Q99959 881 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 TIMM29Q9BSF4 260 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 EBPLQ9BY08 206 aa7.42□□□□□ -1.22
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