RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542324.6

CS-202, Transcript of citrate synthase, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene CS, Length 1,893 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-202ENST00000542324 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
CS-202ENST00000542324 CFL1P23528 166 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
CS-202ENST00000542324 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
CS-202ENST00000542324 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
CS-202ENST00000542324 XKP51811 444 aa10.06□□□□□ -0.8
CS-202ENST00000542324 DAB2P98082 770 aa10.06□□□□□ -0.8
CS-202ENST00000542324 MAB21L1Q13394 359 aa10.06□□□□□ -0.8
CS-202ENST00000542324 TPBGQ13641 420 aa10.06□□□□□ -0.8
CS-202ENST00000542324 HEPACAMQ14CZ8 416 aa10.06□□□□□ -0.8
CS-202ENST00000542324 ARHGEF6Q15052 776 aa10.06□□□□□ -0.8
CS-202ENST00000542324 TATDN3Q17R31 274 aa10.06□□□□□ -0.8
CS-202ENST00000542324 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP10.06□□□□□ -0.82e-6■□□□□ 8.3
CS-202ENST00000542324 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa10.06□□□□□ -0.8
CS-202ENST00000542324 KLHL22Q53GT1 634 aa10.06□□□□□ -0.8
CS-202ENST00000542324 TRIQKQ629K1 86 aa10.06□□□□□ -0.8
CS-202ENST00000542324 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa10.06□□□□□ -0.8
CS-202ENST00000542324 ZNF852Q6ZMS4 543 aa10.06□□□□□ -0.8
CS-202ENST00000542324 ZNF730Q6ZMV8 503 aa10.06□□□□□ -0.8
CS-202ENST00000542324 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
CS-202ENST00000542324 QSOX2Q6ZRP7 698 aa10.06□□□□□ -0.8
CS-202ENST00000542324 USP45Q70EL2 814 aa10.06□□□□□ -0.8
CS-202ENST00000542324 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
CS-202ENST00000542324 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP10.06□□□□□ -0.8
CS-202ENST00000542324 ELMOD2Q8IZ81 293 aa10.06□□□□□ -0.8
CS-202ENST00000542324 LINC00471Q8N535 108 aa10.06□□□□□ -0.8
CS-202ENST00000542324 C19orf18Q8NEA5 215 aa10.06□□□□□ -0.8
CS-202ENST00000542324 NLGN2Q8NFZ4 835 aa10.06□□□□□ -0.8
CS-202ENST00000542324 DEDD2Q8WXF8 326 aa10.06□□□□□ -0.8
CS-202ENST00000542324 SNAPC3Q92966 411 aa10.06□□□□□ -0.8
CS-202ENST00000542324 SLC6A18Q96N87 628 aa10.06□□□□□ -0.8
CS-202ENST00000542324 IL4I1Q96RQ9 567 aa10.06□□□□□ -0.8
CS-202ENST00000542324 FAM83CQ9BQN1 747 aa10.06□□□□□ -0.8
CS-202ENST00000542324 GPR62Q9BZJ7 368 aa10.06□□□□□ -0.8
CS-202ENST00000542324 ATG10Q9H0Y0 220 aa10.06□□□□□ -0.8
CS-202ENST00000542324 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
CS-202ENST00000542324 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa10.06□□□□□ -0.8
CS-202ENST00000542324 C11orf16Q9NQ32 467 aa10.06□□□□□ -0.8
CS-202ENST00000542324 TOR4AQ9NXH8 423 aa10.06□□□□□ -0.8
CS-202ENST00000542324 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa10.06□□□□□ -0.8
CS-202ENST00000542324 CLEC2DQ9UHP7 191 aa10.06□□□□□ -0.8
CS-202ENST00000542324 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
CS-202ENST00000542324 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa10.06□□□□□ -0.8
CS-202ENST00000542324 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa10.06□□□□□ -0.8
CS-202ENST00000542324 ALG5Q9Y673 324 aa10.06□□□□□ -0.8
CS-202ENST00000542324 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-202ENST00000542324 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-202ENST00000542324 TMEM129A0AVI4 362 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-202ENST00000542324 PRR23AA6NEV1 266 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-202ENST00000542324 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
CS-202ENST00000542324 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
CS-202ENST00000542324 QSOX1O00391 747 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-202ENST00000542324 SLC30A4O14863 429 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-202ENST00000542324 ORC5O43913 435 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-202ENST00000542324 OR2B3O76000 313 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-202ENST00000542324 SLCO2B1O94956 709 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-202ENST00000542324 ETHE1O95571 254 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-202ENST00000542324 RECKO95980 971 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-202ENST00000542324 FURINP09958 794 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-202ENST00000542324 FAM157BP0CG42 384 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-202ENST00000542324 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
CS-202ENST00000542324 IFNA8P32881 189 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-202ENST00000542324 STK19P49842 368 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
CS-202ENST00000542324 DSTNP60981 165 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-202ENST00000542324 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
CS-202ENST00000542324 BTG1P62324 171 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-202ENST00000542324 COX10Q12887 443 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-202ENST00000542324 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
CS-202ENST00000542324 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
CS-202ENST00000542324 ESCO2Q56NI9 601 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-202ENST00000542324 DCST1Q5T197 706 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-202ENST00000542324 REEP3Q6NUK4 255 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-202ENST00000542324 FUT10Q6P4F1 479 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-202ENST00000542324 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
CS-202ENST00000542324 CD300LDQ6UXZ3 194 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-202ENST00000542324 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-202ENST00000542324 LAPTM4BQ86VI4 370 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-202ENST00000542324 VRK3Q8IV63 474 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-202ENST00000542324 CAMKK1Q8N5S9 505 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-202ENST00000542324 OR7G3Q8NG95 312 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-202ENST00000542324 OR56A3Q8NH54 315 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-202ENST00000542324 PPCDCQ96CD2 204 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-202ENST00000542324 ECHDC3Q96DC8 303 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-202ENST00000542324 ASIC4Q96FT7 647 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-202ENST00000542324 SCRN2Q96FV2 425 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-202ENST00000542324 MARVELD1Q9BSK0 173 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-202ENST00000542324 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-202ENST00000542324 TRIM39Q9HCM9 518 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-202ENST00000542324 A4GALTQ9NPC4 353 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-202ENST00000542324 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
CS-202ENST00000542324 GKN1Q9NS71 199 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-202ENST00000542324 MARCH5Q9NX47 278 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-202ENST00000542324 RNF181Q9P0P0 153 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-202ENST00000542324 ADAM30Q9UKF2 790 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-202ENST00000542324 A0A0X1KG70 313 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-202ENST00000542324 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-202ENST00000542324 A0A1W2PQ67 120 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-202ENST00000542324 UPK3BL1B0FP48 263 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-202ENST00000542324 UPK3BL2E5RIL1 263 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-202ENST00000542324 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
CS-202ENST00000542324 NR2F6P10588 404 aa10.04□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.1 ms