RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534348.5

NEDD8-MDP1-202, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene NEDD8-MDP1, Length 595 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C3orf56Q8N813 242 aa9.27□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZPLD1Q8TCW7 415 aa9.27□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ATL1Q8WXF7 558 aa9.27□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PLPPR2Q96GM1 343 aa9.27□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF597Q96LX8 424 aa9.27□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HS6ST2Q96MM7 605 aa9.27□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa9.27□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KRT12Q99456 494 aa9.27□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FAM129AQ9BZQ8 928 aa9.27□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 L2HGDHQ9H9P8 463 aa9.27□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 INTUQ9ULD6 942 aa9.27□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NENFQ9UMX5 172 aa9.27□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MAPRE3Q9UPY8 281 aa9.27□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CRYL1Q9Y2S2 319 aa9.27□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CLDN16Q9Y5I7 305 aa9.27□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MED12Q93074 2177 aa9.27□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FREM1Q5H8C1 2179 aa9.26□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SERINC4A6NH21 518 aa9.26□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C17orf105B2RV13 164 aa9.26□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C4orf51C9J302 202 aa9.26□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GOLGA8KD6RF30 607 aa9.26□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 E5RI56 91 aa9.26□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GOLGA8TH3BQL2 631 aa9.26□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OVOL3O00110 214 aa9.26□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MSTNO14793 375 aa9.26□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KLF4O43474 513 aa9.26□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TCF21O43680 179 aa9.26□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZBTB14O43829 449 aa9.26□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TMCC2O75069 709 aa9.26□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GAS8O95995 478 aa9.26□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HPNP05981 417 aa9.26□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TMEM253P0C7T8 217 aa9.26□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SAT1P21673 171 aa9.26□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ADRA1DP25100 572 aa9.26□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ATP5DP30049 168 aa9.26□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GRIA1P42261 906 aa9.26□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC1A1P43005 524 aa9.26□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RPL21P46778 160 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MASP1P48740 699 aa9.26□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SIRPAP78324 504 aa9.26□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GAB1Q13480 694 aa9.26□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PWP1Q13610 501 aa9.26□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa9.26□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 BEX5Q5H9J7 111 aa9.26□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NIPAL1Q6NVV3 410 aa9.26□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa9.26□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa9.26□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LRRC6Q86X45 466 aa9.26□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa9.26□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RCOR2Q8IZ40 523 aa9.26□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FAM71DQ8N9W8 422 aa9.26□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MORN4Q8NDC4 146 aa9.26□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC2A12Q8TD20 617 aa9.26□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DIO2Q92813 273 aa9.26□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 WNT2BQ93097 391 aa9.26□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PYCR2Q96C36 320 aa9.26□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 STARD4Q96DR4 205 aa9.26□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PGM2Q96G03 612 aa9.26□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZFP3Q96NJ6 502 aa9.26□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 BIRC8Q96P09 236 aa9.26□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC39A3Q9BRY0 314 aa9.26□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CNIH4Q9P003 139 aa9.26□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC35F4A4IF30 521 aa9.25□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KIAA0513O60268 411 aa9.25□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TGM6O95932 706 aa9.25□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 THBDP07204 575 aa9.25□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CREB1P16220 341 aa9.25□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP9.25□□□□□ -0.932e-15■■■□□ 16.4
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MSH2P43246 934 aa9.25□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CCR8P51685 355 aa9.25□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HSD17B7P56937 341 aa9.25□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 VLDLRP98155 873 aa9.25□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ID2Q02363 134 aa9.25□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ACVR1Q04771 509 aa9.25□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CDH17Q12864 832 aa9.25□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NAE1Q13564 534 aa9.25□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RUNX2Q13950 521 aa9.25□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NHSL2Q5HYW2 709 aa9.25□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa9.25□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TMEM64Q6YI46 380 aa9.25□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DNM1P46Q6ZS02 220 aa9.25□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 WFDC8Q8IUA0 241 aa9.25□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa9.25□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PRELID2Q8N945 189 aa9.25□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR14A16Q8NHC5 309 aa9.25□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DOK4Q8TEW6 326 aa9.25□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 UCN3Q969E3 161 aa9.25□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa9.25□□□□□ -0.93
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