RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531908.5

RPS13-208, Transcript of ribosomal protein S13, human

TSL 2

Gene RPS13, Length 746 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS13-208	ENST00000531908	GTF3C4	Q9UKN8	822 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	MROH7	Q68CQ1	1323 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908		A0A087WYN8	130 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	IGLV9-49	A0A0B4J1Y8	123 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	CCDC188	H7C350	402 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	DNM1L	O00429	736 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	ATP6V0E1	O15342	81 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	TIMM44	O43615	452 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	OR10H2	O60403	315 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	ERLIN1	O75477	346 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	ERLIN2	O94905	339 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	LSM8	O95777	96 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	EML2	O95834	649 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	WDPCP	O95876	746 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	FYN	P06241	537 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	PAEP	P09466	180 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	ERVK-10	P10266	1014 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	CYBA	P13498	195 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	ERCC2	P18074	760 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	TCEA1	P23193	301 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	CTNNA2	P26232	953 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	MNDA	P41218	407 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	SLC1A1	P43005	524 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	ASCL1	P50553	236 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	CRYBB1	P53674	252 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	RBP5	P82980	135 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	BEX3	Q00994	111 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	MESD	Q14696	234 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	KYNU	Q16719	465 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	ZNF628	Q5EBL2	1059 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	MFSD14C	Q5VZR4	134 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	CENPV	Q7Z7K6	275 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	RPAIN	Q86UA6	219 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	MFN1	Q8IWA4	741 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	ZNF595	Q8IYB9	648 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	FAM76A	Q8TAV0	307 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	HPDL	Q96IR7	371 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	ZMAT2	Q96NC0	199 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	NUP85	Q9BW27	656 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	BARHL1	Q9BZE3	327 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	SDCBP2	Q9H190	292 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	UPF3A	Q9H1J1	476 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	S1PR5	Q9H228	398 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	CXCL16	Q9H2A7	254 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	CNOT10	Q9H9A5	744 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	GDF3	Q9NR23	364 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	CACNG4	Q9UBN1	327 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	KIAA1257	Q9ULG3	409 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	ABT1	Q9ULW3	272 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	DOCK3	Q8IZD9	2030 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	PLXNA1	Q9UIW2	1896 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	PLXNB2	O15031	1838 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	SI	P14410	1827 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	ZNF236	Q9UL36	1845 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	GIMAP1-GIMAP5	A0A087WTJ2	511 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	LOC101059948	A0A1B0GTJ6	334 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	NEMP2	A6NFY4	417 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	TMEM221	A6NGB7	291 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	PGRMC1	O00264	195 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	PIR	O00625	290 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	TADA2A	O75478	443 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	PROSC	O94903	275 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	CLPTM1	O96005	669 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	RAB40AL	P0C0E4	278 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	PRSS56	P0CW18	603 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	KCNE1	P15382	129 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	CPT2	P23786	658 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	CTNNA1	P35221	906 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	NSF	P46459	744 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	YWHAE	P62258	255 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	CASP8	Q14790	479 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	TMEM132D	Q14C87	1099 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	ODF4	Q2M2E3	257 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	ZNF699	Q32M78	642 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	DCAF4L1	Q3SXM0	396 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	LIN9	Q5TKA1	542 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	PRR27	Q6MZM9	219 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	NOTUM	Q6P988	496 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	ZBTB49	Q6ZSB9	765 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	CATSPER4	Q7RTX7	472 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	ERICH1	Q86X53	443 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	IFT20	Q8IY31	132 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	ZNF611	Q8N823	705 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	ZNF383	Q8NA42	475 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	TDRD5	Q8NAT2	981 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	SLC4A11	Q8NBS3	891 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	TMEM35B	Q8NCS4	154 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	NPEPL1	Q8NDH3	523 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	FGFBP3	Q8TAT2	258 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	ZNF564	Q8TBZ8	553 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	GRHL3	Q8TE85	626 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	AEN	Q8WTP8	325 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	DGCR8	Q8WYQ5	773 aa	Known RBP eCLIP	4.55	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	SUSD6	Q92537	303 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	KRT35	Q92764	455 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	MOB3A	Q96BX8	217 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	RMDN1	Q96DB5	314 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	GIMAP5	Q96F15	307 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	THOC1	Q96FV9	657 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	KRT12	Q99456	494 aa		4.55	□□□□□ -1.68

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