RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530309.1

CASP4-208, Transcript of caspase 4, human

TSL 2

Gene CASP4, Length 481 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CASP4-208	ENST00000530309	MIPOL1	Q8TD10	442 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CASP4-208	ENST00000530309	PCED1B	Q96HM7	432 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CASP4-208	ENST00000530309	NAP1L3	Q99457	506 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CASP4-208	ENST00000530309	RBM4B	Q9BQ04	359 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CASP4-208	ENST00000530309	WWP1	Q9H0M0	922 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CASP4-208	ENST00000530309	GAN	Q9H2C0	597 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CASP4-208	ENST00000530309	THAP9	Q9H5L6	903 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CASP4-208	ENST00000530309	WDR41	Q9HAD4	459 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CASP4-208	ENST00000530309	KCNMB3	Q9NPA1	279 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CASP4-208	ENST00000530309	DDX28	Q9NUL7	540 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CASP4-208	ENST00000530309	ACOXL	Q9NUZ1	547 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CASP4-208	ENST00000530309	AKAP7	Q9P0M2	348 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CASP4-208	ENST00000530309	IGLV4-3	A0A075B6K6	122 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	IGHV3OR16-10	A0A075B7F0	116 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	OR5H15	A6NDH6	313 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	KRTAP16-1	A8MUX0	517 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309		A8MXK9	166 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	ZNF749	O43361	778 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	KIAA0513	O60268	411 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	ATP6V1G1	O75348	118 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	MT-ND3	P03897	115 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	SFTPB	P07988	381 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	ABHD2	P08910	425 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	PC	P11498	1178 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	CD1D	P15813	335 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	GALK2	Q01415	458 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	HSPA14	Q0VDF9	509 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	RIG	Q13278	110 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	KRT31	Q15323	416 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	TEX35	Q5T0J7	233 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	ETFRF1	Q6IPR1	90 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	ZNF730	Q6ZMV8	503 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	CARM1	Q86X55	608 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	NPRL2	Q8WTW4	380 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	TCP11	Q8WWU5	503 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	ZNF560	Q96MR9	790 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	RAB40C	Q96S21	281 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	DCLRE1B	Q9H816	532 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	TECR	Q9NZ01	308 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	TRMT6	Q9UJA5	497 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	MRTO4	Q9UKD2	239 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	TMCO5B	A8MYB1	307 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	TLR4	O00206	839 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	CS	O75390	466 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	OR6A2	O95222	327 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	CXCL14	O95715	111 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	TXNDC12	O95881	172 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	TPBGL	P0DKB5	382 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	AREG	P15514	252 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	ATP6V1E1	P36543	226 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	CAPG	P40121	348 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	RPS27A	P62979	156 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	SRPX	P78539	464 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	ECSCR	Q19T08	205 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	WSCD2	Q2TBF2	565 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	GLIPR1L2	Q4G1C9	344 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	C1orf189	Q5VU69	101 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	CDHR3	Q6ZTQ4	885 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	STXBP4	Q6ZWJ1	553 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	MCM10	Q7L590	875 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	RABEPK	Q7Z6M1	372 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	WDR49	Q8IV35	697 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	MAPK1IP1L	Q8NDC0	245 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	OR6M1	Q8NGM8	313 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	CHPT1	Q8WUD6	406 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	PCNP	Q8WW12	178 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	SLCO4A1	Q96BD0	722 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	DTD2	Q96FN9	168 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	CXorf58	Q96LI9	332 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	TNFRSF13C	Q96RJ3	184 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	STRADB	Q9C0K7	418 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	DPEP3	Q9H4B8	488 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	PANK3	Q9H999	370 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	PIGV	Q9NUD9	493 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	MOB4	Q9Y3A3	225 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	TRBV2	A0A0J9YWF9	115 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	NTN3	O00634	580 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	FBP2	O00757	339 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	ZBTB14	O43829	449 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	POP4	O95707	220 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	FH	P07954	510 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	ZNF18	P17022	549 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	FCAR	P24071	287 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	OXTR	P30559	389 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	NSF	P46459	744 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	CNN1	P51911	297 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	NDUFV3	P56181	108 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	PEX3	P56589	373 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	HERV-K104	P63124	156 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	EPC2	Q52LR7	807 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	MPPE1	Q53F39	396 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	RNF130	Q86XS8	419 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	GVQW1	Q8N7I0	195 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	SSC4D	Q8WTU2	575 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	MRPL24	Q96A35	216 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	MRPL53	Q96EL3	112 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	SPAG8	Q99932	426 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	CHCHD5	Q9BSY4	110 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	TEX13A	Q9BXU3	409 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63

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