RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524325.5

TSNARE1-208, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,963 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-208ENST00000524325 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
TSNARE1-208ENST00000524325 MAOAP21397 527 aa21.4■■□□□ 1.02
TSNARE1-208ENST00000524325 AGXTP21549 392 aa21.4■■□□□ 1.02
TSNARE1-208ENST00000524325 JAK1P23458 1154 aa21.4■■□□□ 1.02
TSNARE1-208ENST00000524325 ATP4BP51164 291 aa21.4■■□□□ 1.02
TSNARE1-208ENST00000524325 PHC1P78364 1004 aa21.4■■□□□ 1.02
TSNARE1-208ENST00000524325 MPEG1Q2M385 716 aa21.4■■□□□ 1.02
TSNARE1-208ENST00000524325 NIPAL1Q6NVV3 410 aa21.4■■□□□ 1.02
TSNARE1-208ENST00000524325 PARP9Q8IXQ6 854 aa21.4■■□□□ 1.02
TSNARE1-208ENST00000524325 STT3BQ8TCJ2 826 aa21.4■■□□□ 1.02
TSNARE1-208ENST00000524325 DOK4Q8TEW6 326 aa21.4■■□□□ 1.02
TSNARE1-208ENST00000524325 FAIM2Q9BWQ8 316 aa21.4■■□□□ 1.02
TSNARE1-208ENST00000524325 CLMPQ9H6B4 373 aa21.4■■□□□ 1.02
TSNARE1-208ENST00000524325 LANCL2Q9NS86 450 aa21.4■■□□□ 1.02
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
TSNARE1-208ENST00000524325 UTS2RQ9UKP6 389 aa21.4■■□□□ 1.02
TSNARE1-208ENST00000524325 CES1P1Q9UKY3 287 aa21.4■■□□□ 1.02
TSNARE1-208ENST00000524325 CDRT15L2A8MXV6 281 aa21.39■■□□□ 1.02
TSNARE1-208ENST00000524325 TGFBR3LH3BV60 316 aa21.39■■□□□ 1.02
TSNARE1-208ENST00000524325 FGF17O60258 216 aa21.39■■□□□ 1.02
TSNARE1-208ENST00000524325 DCTN3O75935 186 aa21.39■■□□□ 1.02
TSNARE1-208ENST00000524325 TGIF1Q15583 401 aa21.39■■□□□ 1.02
TSNARE1-208ENST00000524325 VPS26BQ4G0F5 336 aa21.39■■□□□ 1.02
TSNARE1-208ENST00000524325 FAM198BQ6UWH4 519 aa21.39■■□□□ 1.02
TSNARE1-208ENST00000524325 IKBIPQ70UQ0 350 aa21.39■■□□□ 1.02
TSNARE1-208ENST00000524325 OVCH1Q7RTY7 1134 aa21.39■■□□□ 1.02
TSNARE1-208ENST00000524325 DNAJB14Q8TBM8 379 aa21.39■■□□□ 1.02
TSNARE1-208ENST00000524325 PPCDCQ96CD2 204 aa21.39■■□□□ 1.02
TSNARE1-208ENST00000524325 LRFN5Q96NI6 719 aa21.39■■□□□ 1.02
TSNARE1-208ENST00000524325 MS4A12Q9NXJ0 267 aa21.39■■□□□ 1.02
TSNARE1-208ENST00000524325 PADI1Q9ULC6 663 aa21.39■■□□□ 1.02
TSNARE1-208ENST00000524325 CAPN7Q9Y6W3 813 aa21.39■■□□□ 1.02
TSNARE1-208ENST00000524325 SPACA6W5XKT8 324 aa21.39■■□□□ 1.02
TSNARE1-208ENST00000524325 FER1L5A0AVI2 2057 aa21.39■■□□□ 1.02
TSNARE1-208ENST00000524325 GUCY1B2O75343 617 aa21.39■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 HPCAL1P37235 193 aa21.39■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 FEN1P39748 380 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 DUSP2Q05923 314 aa21.39■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 TIGD2Q4W5G0 525 aa21.39■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 FAAH2Q6GMR7 532 aa21.39■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 OR4F3Q6IEY1 312 aa21.39■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 ANKRD46Q86W74 232 aa21.39■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 KLHL29Q96CT2 875 aa21.39■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 NRSN2Q9GZP1 204 aa21.39■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa21.39■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 C1orf226A1L170 272 aa21.38■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 ZGLP1P0C6A0 271 aa21.38■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 FOLH1Q04609 750 aa21.38■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 SLC13A2Q13183 592 aa21.38■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 NKG7Q16617 165 aa21.38■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 CPTPQ5TA50 214 aa21.38■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 SLC48A1Q6P1K1 146 aa21.38■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 TSLPQ969D9 159 aa21.38■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 ZBTB18Q99592 522 aa21.38■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 MKL2Q9ULH7 1088 aa21.38■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 DRD2P14416 443 aa21.37■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 CAPN3P20807 821 aa21.37■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 RPS18P62269 152 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 OCA2Q04671 838 aa21.37■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 PDE7AQ13946 482 aa21.37■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 AMER2Q8N7J2 671 aa21.37■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 CT55Q8WUE5 264 aa21.37■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 WDR41Q9HAD4 459 aa21.37■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 SLAMF7Q9NQ25 335 aa21.37■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa21.37■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 ATP6V1HQ9UI12 483 aa21.37■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 CAPN14A8MX76 684 aa21.37■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 CCNYL3P0C7X3 344 aa21.37■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 TCN2P20062 427 aa21.37■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 PPP2R1BP30154 601 aa21.37■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa21.37■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 SNX32Q86XE0 403 aa21.37■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 MIEF2Q96C03 454 aa21.37■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 VN1R1Q9GZP7 353 aa21.37■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 NECTIN3Q9NQS3 549 aa21.37■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 ARL8BQ9NVJ2 186 aa21.37■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa21.37■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 FAM234BA2RU67 622 aa21.36■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 STMND1H3BQB6 276 aa21.36■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 RAD1O60671 282 aa21.36■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 F8A1P23610 371 aa21.36■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 RTP5Q14D33 572 aa21.36■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 OR52E8Q6IFG1 317 aa21.36■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa21.36■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 NLGN4XQ8N0W4 816 aa21.36■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 SLC52A3Q9NQ40 469 aa21.36■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 CROTQ9UKG9 612 aa21.36■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 CLDN16Q9Y5I7 305 aa21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.4 ms