RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516530.1

RNU6-1061P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1061, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1061P, Length 99 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1061P-201ENST00000516530 BET1O15155 118 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1061P-201ENST00000516530 KIF5CO60282 957 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1061P-201ENST00000516530 PLOD3O60568 738 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1061P-201ENST00000516530 SERPING1P05155 500 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1061P-201ENST00000516530 LAMP2P13473 410 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1061P-201ENST00000516530 RNH1P13489 461 aaKnown RBP-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1061P-201ENST00000516530 HSD17B1P14061 328 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1061P-201ENST00000516530 ACP1P24666 158 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1061P-201ENST00000516530 MFAP4P55083 255 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1061P-201ENST00000516530 CASP6P55212 293 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1061P-201ENST00000516530 BACE1P56817 501 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1061P-201ENST00000516530 GIT2Q14161 759 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1061P-201ENST00000516530 TMEM211Q6ICI0 200 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1061P-201ENST00000516530 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1061P-201ENST00000516530 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1061P-201ENST00000516530 NLRP14Q86W24 1093 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1061P-201ENST00000516530 CADM2Q8N3J6 435 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1061P-201ENST00000516530 CCDC26Q8TAB7 109 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1061P-201ENST00000516530 C8orf46Q8TAG6 207 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1061P-201ENST00000516530 ZNF671Q8TAW3 534 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1061P-201ENST00000516530 SEPT1Q8WYJ6 367 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1061P-201ENST00000516530 MARC2Q969Z3 335 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1061P-201ENST00000516530 FAM210BQ96KR6 192 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1061P-201ENST00000516530 TSNARE1Q96NA8 513 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1061P-201ENST00000516530 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1061P-201ENST00000516530 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1061P-201ENST00000516530 DPEP3Q9H4B8 488 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1061P-201ENST00000516530 GORASP2Q9H8Y8 452 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1061P-201ENST00000516530 PREBQ9HCU5 417 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1061P-201ENST00000516530 TBC1D22BQ9NU19 505 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1061P-201ENST00000516530 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1061P-201ENST00000516530 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1061P-201ENST00000516530 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1061P-201ENST00000516530 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1061P-201ENST00000516530 LTBP4Q8N2S1 1624 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1061P-201ENST00000516530 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1061P-201ENST00000516530 ZNF878C9JN71 531 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1061P-201ENST00000516530 AP3D1O14617 1153 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1061P-201ENST00000516530 PRB1P04280 392 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1061P-201ENST00000516530 LINGO3P0C6S8 592 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1061P-201ENST00000516530 IL2RGP31785 369 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1061P-201ENST00000516530 ACVR1BP36896 505 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1061P-201ENST00000516530 PSMD8P48556 350 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1061P-201ENST00000516530 TUBP50607 506 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1061P-201ENST00000516530 ARHGDIAP52565 204 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1061P-201ENST00000516530 SERTAD2Q14140 314 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1061P-201ENST00000516530 SLC10A1Q14973 349 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1061P-201ENST00000516530 RBBP7Q16576 425 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1061P-201ENST00000516530 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1061P-201ENST00000516530 ABCA11PQ4W5N1 156 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1061P-201ENST00000516530 PLPP4Q5VZY2 271 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1061P-201ENST00000516530 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1061P-201ENST00000516530 PXKQ7Z7A4 578 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1061P-201ENST00000516530 CPLX4Q7Z7G2 160 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1061P-201ENST00000516530 C6orf223Q8N319 242 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1061P-201ENST00000516530 ESX1Q8N693 406 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1061P-201ENST00000516530 CD99L2Q8TCZ2 262 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1061P-201ENST00000516530 SCFD2Q8WU76 684 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1061P-201ENST00000516530 CRYGNQ8WXF5 182 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1061P-201ENST00000516530 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1061P-201ENST00000516530 LPGAT1Q92604 370 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1061P-201ENST00000516530 SLC25A38Q96DW6 304 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1061P-201ENST00000516530 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1061P-201ENST00000516530 FEVQ99581 238 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1061P-201ENST00000516530 NICN1Q9BSH3 213 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1061P-201ENST00000516530 DPH7Q9BTV6 452 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1061P-201ENST00000516530 OR51J1Q9H342 316 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1061P-201ENST00000516530 JMJD4Q9H9V9 463 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1061P-201ENST00000516530 APMAPQ9HDC9 416 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1061P-201ENST00000516530 MMP26Q9NRE1 261 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1061P-201ENST00000516530 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1061P-201ENST00000516530 RAI14Q9P0K7 980 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1061P-201ENST00000516530 CIDEBQ9UHD4 219 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1061P-201ENST00000516530 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1061P-201ENST00000516530 A0A096LNJ9 63 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1061P-201ENST00000516530 OR5H15A6NDH6 313 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1061P-201ENST00000516530 USP27XA6NNY8 438 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1061P-201ENST00000516530 TMCO5BA8MYB1 307 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1061P-201ENST00000516530 SLC17A2O00624 439 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1061P-201ENST00000516530 ABCD4O14678 606 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1061P-201ENST00000516530 RIPK2O43353 540 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1061P-201ENST00000516530 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1061P-201ENST00000516530 BBOX1O75936 387 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1061P-201ENST00000516530 IGHV4-34P06331 123 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1061P-201ENST00000516530 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1061P-201ENST00000516530 CLTBP09497 229 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1061P-201ENST00000516530 CT45A10P0DMU9 189 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1061P-201ENST00000516530 EEF2P13639 858 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1061P-201ENST00000516530 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1061P-201ENST00000516530 KIR3DL2P43630 455 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1061P-201ENST00000516530 OR3A4PP47883 348 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1061P-201ENST00000516530 OR3A3P47888 321 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1061P-201ENST00000516530 CDH13P55290 713 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1061P-201ENST00000516530 CNTN1Q12860 1018 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1061P-201ENST00000516530 UNC119Q13432 240 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1061P-201ENST00000516530 PRSS8Q16651 343 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1061P-201ENST00000516530 CBWD6Q4V339 395 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1061P-201ENST00000516530 CBWD3Q5JTY5 395 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1061P-201ENST00000516530 DCST2Q5T1A1 773 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1061P-201ENST00000516530 GALNT17Q6IS24 598 aa-0.04□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.5 ms