RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504450.1

SH3BP2-209, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 844 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-209ENST00000504450 OR2A25A4D2G3 310 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 PRAMEF25A6NGN4 478 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 MYO1GB0I1T2 1018 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 ISM1B1AKI9 464 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 M0QX08 132 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 SLC16A6O15403 523 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 SP9P0CG40 484 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 SMIM10L1P0DMW3 83 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 NUDT1P36639 197 aa10.23□□□□□ -0.77
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SH3BP2-209ENST00000504450 CDK9P50750 372 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 CDK6Q00534 326 aa10.23□□□□□ -0.77
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SH3BP2-209ENST00000504450 PRRT3Q5FWE3 981 aa10.23□□□□□ -0.77
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SH3BP2-209ENST00000504450 TMEM26Q6ZUK4 368 aa10.23□□□□□ -0.77
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SH3BP2-209ENST00000504450 C1orf210Q8IVY1 113 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 OFCC1Q8IZS5 231 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 ARL10Q8N8L6 244 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 OR5AK3PQ8NH89 298 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 NFKBIDQ8NI38 313 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 FBLIM1Q8WUP2 373 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 SLC22A18Q96BI1 424 aa10.23□□□□□ -0.77
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SH3BP2-209ENST00000504450 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 SMIM10Q96HG1 83 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 MUS81Q96NY9 551 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 MACROD1Q9BQ69 325 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 C17orf62Q9BQA9 187 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 SRMSQ9H3Y6 488 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 A4GALTQ9NPC4 353 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 CES1P1Q9UKY3 287 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 PADI2Q9Y2J8 665 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 KLHL20Q9Y2M5 609 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
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SH3BP2-209ENST00000504450 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 A0A0G2JN53 185 aa10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 hCG_2039718K7EN88 272 aa10.22□□□□□ -0.77
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SH3BP2-209ENST00000504450 E2F6O75461 281 aa10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 OR6B1O95007 311 aa10.22□□□□□ -0.77
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SH3BP2-209ENST00000504450 SERPIND1P05546 499 aa10.22□□□□□ -0.77
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SH3BP2-209ENST00000504450 ITGAMP11215 1152 aa10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 ATP6V1B1P15313 513 aa10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 PAX7P23759 505 aa10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 SOAT1P35610 550 aa10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 MAGEA8P43361 318 aa10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 RXRGP48443 463 aa10.22□□□□□ -0.77
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SH3BP2-209ENST00000504450 DAPP51397 102 aa10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 MANFP55145 182 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
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SH3BP2-209ENST00000504450 CDH15P55291 814 aa10.22□□□□□ -0.77
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SH3BP2-209ENST00000504450 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
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SH3BP2-209ENST00000504450 SLAMF1Q13291 335 aa10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 KCNAB2Q13303 367 aa10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 IL18R1Q13478 541 aa10.22□□□□□ -0.77
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SH3BP2-209ENST00000504450 GAS6Q14393 721 aa10.22□□□□□ -0.77
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SH3BP2-209ENST00000504450 FCRL6Q6DN72 434 aa10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 FAM180BQ6P0A1 224 aa10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 FAHD1Q6P587 224 aa10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 THAP5Q7Z6K1 395 aa10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF786Q8N393 782 aa10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 HORMAD2Q8N7B1 307 aa10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 ACOT4Q8N9L9 421 aa10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 THAP11Q96EK4 314 aa10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 SHDQ96IW2 340 aa10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 AMDHD1Q96NU7 426 aa10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 KCNC2Q96PR1 638 aa10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 FAIM2Q9BWQ8 316 aa10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 GRIP2Q9C0E4 1043 aa10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 YIPF3Q9GZM5 350 aa10.22□□□□□ -0.77
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