RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497425.1

TTC21B-208, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 21B, human

TSL 3

Gene TTC21B, Length 617 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC21B-208	ENST00000497425	LIPH	Q8WWY8	451 aa		3.17	□□□□□ -1.9
TTC21B-208	ENST00000497425	PKP2	Q99959	881 aa		3.17	□□□□□ -1.9
TTC21B-208	ENST00000497425	FUNDC2	Q9BWH2	189 aa		3.17	□□□□□ -1.9
TTC21B-208	ENST00000497425	WWP1	Q9H0M0	922 aa		3.17	□□□□□ -1.9
TTC21B-208	ENST00000497425	UPF3A	Q9H1J1	476 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
TTC21B-208	ENST00000497425	SLC26A1	Q9H2B4	701 aa		3.17	□□□□□ -1.9
TTC21B-208	ENST00000497425	GAN	Q9H2C0	597 aa		3.17	□□□□□ -1.9
TTC21B-208	ENST00000497425	IL1RAP	Q9NPH3	570 aa		3.17	□□□□□ -1.9
TTC21B-208	ENST00000497425	ACOXL	Q9NUZ1	547 aa		3.17	□□□□□ -1.9
TTC21B-208	ENST00000497425	TEX10	Q9NXF1	929 aa	Predicted RBP	3.17	□□□□□ -1.9
TTC21B-208	ENST00000497425	THEG	Q9P2T0	379 aa		3.17	□□□□□ -1.9
TTC21B-208	ENST00000497425	FAM153A	Q9UHL3	310 aa		3.17	□□□□□ -1.9
TTC21B-208	ENST00000497425	NUDC	Q9Y266	331 aa		3.17	□□□□□ -1.9
TTC21B-208	ENST00000497425	LOC105371242	A0A075B767	164 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC21B-208	ENST00000497425	RNF103-CHMP3	A0A140T963	221 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC21B-208	ENST00000497425	BICDL2	A1A5D9	508 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC21B-208	ENST00000497425	OR5H15	A6NDH6	313 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC21B-208	ENST00000497425	YJEFN3	A6XGL0	299 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC21B-208	ENST00000497425		K7EQD1	137 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC21B-208	ENST00000497425	EEF2K	O00418	725 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
TTC21B-208	ENST00000497425	CCS	O14618	274 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC21B-208	ENST00000497425	NXPH4	O95158	308 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC21B-208	ENST00000497425	OR6A2	O95222	327 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC21B-208	ENST00000497425	PC	P11498	1178 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
TTC21B-208	ENST00000497425	GLRA1	P23415	457 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC21B-208	ENST00000497425	MARCKS	P29966	332 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
TTC21B-208	ENST00000497425	SFN	P31947	248 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC21B-208	ENST00000497425	ID1	P41134	155 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC21B-208	ENST00000497425	TMEM50B	P56557	158 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC21B-208	ENST00000497425	KRTAP10-12	P60413	245 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC21B-208	ENST00000497425	CCZ1B	P86790	482 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC21B-208	ENST00000497425	CCZ1	P86791	482 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
TTC21B-208	ENST00000497425	PMP22	Q01453	160 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC21B-208	ENST00000497425	IL1RL1	Q01638	556 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC21B-208	ENST00000497425	MFGE8	Q08431	387 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
TTC21B-208	ENST00000497425	OR1C1	Q15619	314 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC21B-208	ENST00000497425	CARTPT	Q16568	116 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC21B-208	ENST00000497425	CCDC40	Q4G0X9	1142 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC21B-208	ENST00000497425	TAF1B	Q53T94	588 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
TTC21B-208	ENST00000497425	CMPK2	Q5EBM0	449 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC21B-208	ENST00000497425	RTL6	Q6ICC9	239 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC21B-208	ENST00000497425	OR6B2	Q6IFH4	312 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC21B-208	ENST00000497425	C3P1	Q6ZMU1	363 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC21B-208	ENST00000497425	ZNF730	Q6ZMV8	503 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC21B-208	ENST00000497425	OR4N5	Q8IXE1	308 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC21B-208	ENST00000497425	METTL4	Q8N3J2	472 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC21B-208	ENST00000497425	AQP11	Q8NBQ7	271 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC21B-208	ENST00000497425	OR6M1	Q8NGM8	313 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC21B-208	ENST00000497425	OR10G7	Q8NGN6	311 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC21B-208	ENST00000497425	MRPL24	Q96A35	216 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
TTC21B-208	ENST00000497425	ESAM	Q96AP7	390 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC21B-208	ENST00000497425	CDHR1	Q96JP9	859 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC21B-208	ENST00000497425	RPGRIP1	Q96KN7	1286 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC21B-208	ENST00000497425	NSMCE3	Q96MG7	304 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC21B-208	ENST00000497425	GPR137	Q96N19	417 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC21B-208	ENST00000497425	AGAP4	Q96P64	663 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC21B-208	ENST00000497425	TRPV6	Q9H1D0	765 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC21B-208	ENST00000497425	CXXC4	Q9H2H0	198 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC21B-208	ENST00000497425	GDF3	Q9NR23	364 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC21B-208	ENST00000497425	TECR	Q9NZ01	308 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
TTC21B-208	ENST00000497425	NINJ2	Q9NZG7	142 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC21B-208	ENST00000497425	KCNN3	Q9UGI6	736 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC21B-208	ENST00000497425	DNPEP	Q9ULA0	475 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC21B-208	ENST00000497425	MRPS2	Q9Y399	296 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
TTC21B-208	ENST00000497425	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC21B-208	ENST00000497425	IGHV3-20	A0A0C4DH32	117 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	MEX3A	A1L020	520 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	CFAP73	A6NFT4	308 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	TMCO5B	A8MYB1	307 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	NEDD8-MDP1	E9PL57	170 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	CHEK1	O14757	476 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	TFEC	O14948	347 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	KIAA0513	O60268	411 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	STAM2	O75886	525 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	ANXA9	O76027	345 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	MT-ATP6	P00846	226 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	PGK2	P07205	417 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	ETS1	P14921	441 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	CD1D	P15813	335 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	MAPK3	P27361	379 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	PKLR	P30613	574 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	RPL9	P32969	192 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	TNFRSF4	P43489	277 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	CLK1	P49759	484 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	NDST2	P52849	883 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	LIMK2	P53671	638 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	PEX3	P56589	373 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	BPIFB3	P59826	476 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	ABCE1	P61221	599 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	KIAA0141	Q14154	515 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	MEF2D	Q14814	521 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	FASTKD3	Q14CZ7	662 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	GPAT3	Q53EU6	434 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	MPPE1	Q53F39	396 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	DCAF12	Q5T6F0	453 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	NKAIN2	Q5VXU1	208 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	ADAM5	Q6NVV9	412 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	NEPRO	Q6NW34	567 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	ISLR2	Q6UXK2	745 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	GDPGP1	Q6ZNW5	385 aa		3.15	□□□□□ -1.91

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