RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490677.1

HOXB3-211, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB3, Length 1,109 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-211ENST00000490677 PEX1O43933 1283 aa25.82■■□□□ 1.72
HOXB3-211ENST00000490677 ETHE1O95571 254 aa25.82■■□□□ 1.72
HOXB3-211ENST00000490677 IFNA16P05015 189 aa25.82■■□□□ 1.72
HOXB3-211ENST00000490677 ECHS1P30084 290 aa25.82■■□□□ 1.72
HOXB3-211ENST00000490677 PIK3CBP42338 1070 aa25.82■■□□□ 1.72
HOXB3-211ENST00000490677 SSR4P51571 173 aa25.82■■□□□ 1.72
HOXB3-211ENST00000490677 HK2P52789 917 aa25.82■■□□□ 1.72
HOXB3-211ENST00000490677 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
HOXB3-211ENST00000490677 STX4Q12846 297 aa25.82■■□□□ 1.72
HOXB3-211ENST00000490677 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP25.82■■□□□ 1.72
HOXB3-211ENST00000490677 CMPK2Q5EBM0 449 aa25.82■■□□□ 1.72
HOXB3-211ENST00000490677 TECRLQ5HYJ1 363 aa25.82■■□□□ 1.72
HOXB3-211ENST00000490677 OR4C11Q6IEV9 310 aa25.82■■□□□ 1.72
HOXB3-211ENST00000490677 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP25.82■■□□□ 1.72
HOXB3-211ENST00000490677 CHSY3Q70JA7 882 aa25.82■■□□□ 1.72
HOXB3-211ENST00000490677 DOLPP1Q86YN1 238 aa25.82■■□□□ 1.72
HOXB3-211ENST00000490677 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
HOXB3-211ENST00000490677 SLC2A12Q8TD20 617 aa25.82■■□□□ 1.72
HOXB3-211ENST00000490677 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP25.82■■□□□ 1.72
HOXB3-211ENST00000490677 RASL10BQ96S79 203 aa25.82■■□□□ 1.72
HOXB3-211ENST00000490677 CCDC77Q9BR77 488 aa25.82■■□□□ 1.72
HOXB3-211ENST00000490677 CSMD2Q7Z408 3487 aa25.82■■□□□ 1.72
HOXB3-211ENST00000490677 FGF17O60258 216 aa25.81■■□□□ 1.72
HOXB3-211ENST00000490677 OR6B1O95007 311 aa25.81■■□□□ 1.72
HOXB3-211ENST00000490677 SSR2P43308 183 aa25.81■■□□□ 1.72
HOXB3-211ENST00000490677 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP25.81■■□□□ 1.72
HOXB3-211ENST00000490677 CASP6P55212 293 aa25.81■■□□□ 1.72
HOXB3-211ENST00000490677 GPR85P60893 370 aa25.81■■□□□ 1.72
HOXB3-211ENST00000490677 SERTAD2Q14140 314 aa25.81■■□□□ 1.72
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP25.81■■□□□ 1.72
HOXB3-211ENST00000490677 AP5B1Q2VPB7 878 aa25.81■■□□□ 1.72
HOXB3-211ENST00000490677 LIPJQ5W064 366 aa25.81■■□□□ 1.72
HOXB3-211ENST00000490677 MMGT1Q8N4V1 131 aa25.81■■□□□ 1.72
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF721Q8TF20 911 aa25.81■■□□□ 1.72
HOXB3-211ENST00000490677 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP25.81■■□□□ 1.72
HOXB3-211ENST00000490677 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP25.81■■□□□ 1.72
HOXB3-211ENST00000490677 PLSCR2Q9NRY7 297 aa25.81■■□□□ 1.72
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF358Q9NW07 568 aa25.81■■□□□ 1.72
HOXB3-211ENST00000490677 ADGRE2Q9UHX3 823 aa25.81■■□□□ 1.72
HOXB3-211ENST00000490677 EXPH5Q8NEV8 1989 aa25.81■■□□□ 1.72
HOXB3-211ENST00000490677 PINLYPA6NC86 204 aa25.8■■□□□ 1.72
HOXB3-211ENST00000490677 C17orf105B2RV13 164 aa25.8■■□□□ 1.72
HOXB3-211ENST00000490677 H0YIV9 168 aa25.8■■□□□ 1.72
HOXB3-211ENST00000490677 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa25.8■■□□□ 1.72
HOXB3-211ENST00000490677 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP25.8■■□□□ 1.72
HOXB3-211ENST00000490677 AGAP20933 346 aa25.8■■□□□ 1.72
HOXB3-211ENST00000490677 SOX3P41225 446 aa25.8■■□□□ 1.72
HOXB3-211ENST00000490677 SERPINB8P50452 374 aa25.8■■□□□ 1.72
HOXB3-211ENST00000490677 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
HOXB3-211ENST00000490677 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
HOXB3-211ENST00000490677 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP25.8■■□□□ 1.72
HOXB3-211ENST00000490677 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa25.8■■□□□ 1.72
HOXB3-211ENST00000490677 XKRXQ6PP77 449 aa25.8■■□□□ 1.72
HOXB3-211ENST00000490677 HSDL2Q6YN16 418 aa25.8■■□□□ 1.72
HOXB3-211ENST00000490677 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa25.8■■□□□ 1.72
HOXB3-211ENST00000490677 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
HOXB3-211ENST00000490677 PSD4Q8NDX1 1056 aa25.8■■□□□ 1.72
HOXB3-211ENST00000490677 OR8K3Q8NH51 312 aa25.8■■□□□ 1.72
HOXB3-211ENST00000490677 SLC44A1Q8WWI5 657 aa25.8■■□□□ 1.72
HOXB3-211ENST00000490677 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
HOXB3-211ENST00000490677 DMRTA2Q96SC8 542 aa25.8■■□□□ 1.72
HOXB3-211ENST00000490677 OR8D2Q9GZM6 311 aa25.8■■□□□ 1.72
HOXB3-211ENST00000490677 HCFC1P51610 2035 aa25.8■■□□□ 1.72
HOXB3-211ENST00000490677 WWP2O00308 870 aa25.79■■□□□ 1.72
HOXB3-211ENST00000490677 HS6ST1O60243 411 aa25.79■■□□□ 1.72
HOXB3-211ENST00000490677 UGDHO60701 494 aa25.79■■□□□ 1.72
HOXB3-211ENST00000490677 URI1O94763 535 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
HOXB3-211ENST00000490677 GFAPP14136 432 aa25.79■■□□□ 1.72
HOXB3-211ENST00000490677 CPN2P22792 545 aa25.79■■□□□ 1.72
HOXB3-211ENST00000490677 TYK2P29597 1187 aa25.79■■□□□ 1.72
HOXB3-211ENST00000490677 RPS13P62277 151 aaKnown RBP25.79■■□□□ 1.72
HOXB3-211ENST00000490677 RNF4P78317 190 aa25.79■■□□□ 1.72
HOXB3-211ENST00000490677 SLAMF1Q13291 335 aa25.79■■□□□ 1.72
HOXB3-211ENST00000490677 GTF2H2Q13888 395 aa25.79■■□□□ 1.72
HOXB3-211ENST00000490677 C18orf63Q68DL7 685 aa25.79■■□□□ 1.72
HOXB3-211ENST00000490677 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP25.79■■□□□ 1.72
HOXB3-211ENST00000490677 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa25.79■■□□□ 1.72
HOXB3-211ENST00000490677 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa25.79■■□□□ 1.72
HOXB3-211ENST00000490677 OR4N5Q8IXE1 308 aa25.79■■□□□ 1.72
HOXB3-211ENST00000490677 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa25.79■■□□□ 1.72
HOXB3-211ENST00000490677 L3MBTL4Q8NA19 623 aa25.79■■□□□ 1.72
HOXB3-211ENST00000490677 WDR20Q8TBZ3 569 aa25.79■■□□□ 1.72
HOXB3-211ENST00000490677 AGAP11Q8TF27 550 aa25.79■■□□□ 1.72
HOXB3-211ENST00000490677 RGMAQ96B86 450 aa25.79■■□□□ 1.72
HOXB3-211ENST00000490677 ATG4BQ9Y4P1 393 aa25.79■■□□□ 1.72
HOXB3-211ENST00000490677 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa25.79■■□□□ 1.72
HOXB3-211ENST00000490677 HRH3Q9Y5N1 445 aa25.79■■□□□ 1.72
HOXB3-211ENST00000490677 NINQ8N4C6 2090 aa25.79■■□□□ 1.72
HOXB3-211ENST00000490677 FREM3P0C091 2139 aa25.79■■□□□ 1.72
HOXB3-211ENST00000490677 A0A0G2JMM0 328 aa25.78■■□□□ 1.72
HOXB3-211ENST00000490677 A0A1W2PPB8 328 aa25.78■■□□□ 1.72
HOXB3-211ENST00000490677 A0A1W2PRS3 328 aa25.78■■□□□ 1.72
HOXB3-211ENST00000490677 KIR3DP1A8MWS1 328 aa25.78■■□□□ 1.72
HOXB3-211ENST00000490677 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP25.78■■□□□ 1.72
HOXB3-211ENST00000490677 IGKV3-11P04433 115 aa25.78■■□□□ 1.72
HOXB3-211ENST00000490677 HTR1EP28566 365 aa25.78■■□□□ 1.72
HOXB3-211ENST00000490677 PHBP35232 272 aa25.78■■□□□ 1.72
HOXB3-211ENST00000490677 BSGP35613 385 aa25.78■■□□□ 1.72
HOXB3-211ENST00000490677 STT3AP46977 705 aa25.78■■□□□ 1.72
HOXB3-211ENST00000490677 ARFIP1P53367 373 aa25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.6 ms