RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486840.1

CCZ1B-211, Transcript of CCZ1 homolog B, vacuolar protein trafficking and biogenesis associated, humanhuman

TSL 2

Gene CCZ1B, Length 545 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCZ1B-211ENST00000486840 CFAP157Q5JU67 520 aa25.06■■□□□ 1.6
CCZ1B-211ENST00000486840 ZNF678Q5SXM1 525 aa25.06■■□□□ 1.6
CCZ1B-211ENST00000486840 CCNYL1Q8N7R7 359 aa25.06■■□□□ 1.6
CCZ1B-211ENST00000486840 TMEM178AQ8NBL3 297 aa25.06■■□□□ 1.6
CCZ1B-211ENST00000486840 FAR1Q8WVX9 515 aa25.06■■□□□ 1.6
CCZ1B-211ENST00000486840 NCLNQ969V3 563 aa25.06■■□□□ 1.6
CCZ1B-211ENST00000486840 VTI1BQ9UEU0 232 aa25.06■■□□□ 1.6
CCZ1B-211ENST00000486840 MID2Q9UJV3 735 aa25.06■■□□□ 1.6
CCZ1B-211ENST00000486840 SLC12A4Q9UP95 1085 aa25.06■■□□□ 1.6
CCZ1B-211ENST00000486840 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa25.06■■□□□ 1.6
CCZ1B-211ENST00000486840 SCN2AQ99250 2005 aa25.05■■□□□ 1.6
CCZ1B-211ENST00000486840 ESPNB1AK53 854 aa25.05■■□□□ 1.6
CCZ1B-211ENST00000486840 AGFG2O95081 481 aa25.05■■□□□ 1.6
CCZ1B-211ENST00000486840 CD96P40200 585 aa25.05■■□□□ 1.6
CCZ1B-211ENST00000486840 CYB561P49447 251 aa25.05■■□□□ 1.6
CCZ1B-211ENST00000486840 PRKAA2P54646 552 aa25.05■■□□□ 1.6
CCZ1B-211ENST00000486840 VSNL1P62760 191 aa25.05■■□□□ 1.6
CCZ1B-211ENST00000486840 TNFRSF17Q02223 184 aa25.05■■□□□ 1.6
CCZ1B-211ENST00000486840 TUBA3CQ13748 450 aa25.05■■□□□ 1.6
CCZ1B-211ENST00000486840 OR1C1Q15619 314 aa25.05■■□□□ 1.6
CCZ1B-211ENST00000486840 EMBQ6PCB8 327 aa25.05■■□□□ 1.6
CCZ1B-211ENST00000486840 TUBA3EQ6PEY2 450 aa25.05■■□□□ 1.6
CCZ1B-211ENST00000486840 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa25.05■■□□□ 1.6
CCZ1B-211ENST00000486840 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
CCZ1B-211ENST00000486840 TMEM156Q8N614 296 aa25.05■■□□□ 1.6
CCZ1B-211ENST00000486840 MORN4Q8NDC4 146 aa25.05■■□□□ 1.6
CCZ1B-211ENST00000486840 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
CCZ1B-211ENST00000486840 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
CCZ1B-211ENST00000486840 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
CCZ1B-211ENST00000486840 LRFN1Q9P244 771 aa25.05■■□□□ 1.6
CCZ1B-211ENST00000486840 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa25.04■■□□□ 1.6
CCZ1B-211ENST00000486840 C17orf105B2RV13 164 aa25.04■■□□□ 1.6
CCZ1B-211ENST00000486840 OR10H2O60403 315 aa25.04■■□□□ 1.6
CCZ1B-211ENST00000486840 CRCPO75575 148 aa25.04■■□□□ 1.6
CCZ1B-211ENST00000486840 SBK3P0C264 359 aa25.04■■□□□ 1.6
CCZ1B-211ENST00000486840 NR2F6P10588 404 aa25.04■■□□□ 1.6
CCZ1B-211ENST00000486840 UQCRFS1P47985 274 aa25.04■■□□□ 1.6
CCZ1B-211ENST00000486840 PLIN5Q00G26 463 aa25.04■■□□□ 1.6
CCZ1B-211ENST00000486840 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa25.04■■□□□ 1.6
CCZ1B-211ENST00000486840 HSDL2Q6YN16 418 aa25.04■■□□□ 1.6
CCZ1B-211ENST00000486840 TMEM151AQ8N4L1 468 aa25.04■■□□□ 1.6
CCZ1B-211ENST00000486840 AMER2Q8N7J2 671 aa25.04■■□□□ 1.6
CCZ1B-211ENST00000486840 DNAJB8Q8NHS0 232 aa25.04■■□□□ 1.6
CCZ1B-211ENST00000486840 METTL6Q8TCB7 284 aa25.04■■□□□ 1.6
CCZ1B-211ENST00000486840 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
CCZ1B-211ENST00000486840 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
CCZ1B-211ENST00000486840 OR8D2Q9GZM6 311 aa25.04■■□□□ 1.6
CCZ1B-211ENST00000486840 OR4F21O95013 312 aa25.03■■□□□ 1.6
CCZ1B-211ENST00000486840 EDN3P14138 238 aa25.03■■□□□ 1.6
CCZ1B-211ENST00000486840 KRT4P19013 534 aa25.03■■□□□ 1.6
CCZ1B-211ENST00000486840 MLF1P58340 268 aa25.03■■□□□ 1.6
CCZ1B-211ENST00000486840 ID2Q02363 134 aa25.03■■□□□ 1.6
CCZ1B-211ENST00000486840 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
CCZ1B-211ENST00000486840 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
CCZ1B-211ENST00000486840 UNC50Q53HI1 259 aa25.03■■□□□ 1.6
CCZ1B-211ENST00000486840 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
CCZ1B-211ENST00000486840 CDYL2Q8N8U2 506 aa25.03■■□□□ 1.6
CCZ1B-211ENST00000486840 OR5L2Q8NGL0 311 aa25.03■■□□□ 1.6
CCZ1B-211ENST00000486840 ART5Q96L15 291 aa25.03■■□□□ 1.6
CCZ1B-211ENST00000486840 TMEM237Q96Q45 408 aa25.03■■□□□ 1.6
CCZ1B-211ENST00000486840 ZNF382Q96SR6 550 aa25.03■■□□□ 1.6
CCZ1B-211ENST00000486840 BRF2Q9HAW0 419 aa25.03■■□□□ 1.6
CCZ1B-211ENST00000486840 KLHL1Q9NR64 748 aa25.03■■□□□ 1.6
CCZ1B-211ENST00000486840 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP25.03■■□□□ 1.6
CCZ1B-211ENST00000486840 ADAM29Q9UKF5 820 aa25.03■■□□□ 1.6
CCZ1B-211ENST00000486840 ATG4BQ9Y4P1 393 aa25.03■■□□□ 1.6
CCZ1B-211ENST00000486840 NBASA2RRP1 2371 aa25.02■■□□□ 1.6
CCZ1B-211ENST00000486840 PROM1O43490 865 aa25.02■■□□□ 1.6
CCZ1B-211ENST00000486840 ULK1O75385 1050 aa25.02■■□□□ 1.6
CCZ1B-211ENST00000486840 EEDO75530 441 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
CCZ1B-211ENST00000486840 KLK1P06870 262 aa25.02■■□□□ 1.6
CCZ1B-211ENST00000486840 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
CCZ1B-211ENST00000486840 BSGP35613 385 aa25.02■■□□□ 1.6
CCZ1B-211ENST00000486840 PKNOX1P55347 436 aa25.02■■□□□ 1.6
CCZ1B-211ENST00000486840 LCP2Q13094 533 aa25.02■■□□□ 1.6
CCZ1B-211ENST00000486840 C6orf163Q5TEZ5 329 aa25.02■■□□□ 1.6
CCZ1B-211ENST00000486840 LETMD1Q6P1Q0 360 aa25.02■■□□□ 1.6
CCZ1B-211ENST00000486840 OR4N5Q8IXE1 308 aa25.02■■□□□ 1.6
CCZ1B-211ENST00000486840 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa25.02■■□□□ 1.6
CCZ1B-211ENST00000486840 RDH11Q8TC12 318 aa25.02■■□□□ 1.6
CCZ1B-211ENST00000486840 MZB1Q8WU39 189 aa25.02■■□□□ 1.6
CCZ1B-211ENST00000486840 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa25.02■■□□□ 1.6
CCZ1B-211ENST00000486840 A0A0A6YYD5 115 aa25.01■■□□□ 1.59
CCZ1B-211ENST00000486840 CBX6O95503 412 aa25.01■■□□□ 1.59
CCZ1B-211ENST00000486840 PDYNP01213 254 aa25.01■■□□□ 1.59
CCZ1B-211ENST00000486840 GBAP04062 536 aa25.01■■□□□ 1.59
CCZ1B-211ENST00000486840 ENO1P06733 434 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
CCZ1B-211ENST00000486840 CRHR1P34998 444 aa25.01■■□□□ 1.59
CCZ1B-211ENST00000486840 MAPK12P53778 367 aa25.01■■□□□ 1.59
CCZ1B-211ENST00000486840 FOLH1Q04609 750 aa25.01■■□□□ 1.59
CCZ1B-211ENST00000486840 MAPKAPK3Q16644 382 aa25.01■■□□□ 1.59
CCZ1B-211ENST00000486840 C18orf63Q68DL7 685 aa25.01■■□□□ 1.59
CCZ1B-211ENST00000486840 SPINK14Q6IE38 97 aa25.01■■□□□ 1.59
CCZ1B-211ENST00000486840 WDR93Q6P2C0 686 aa25.01■■□□□ 1.59
CCZ1B-211ENST00000486840 ZYG11AQ6WRX3 759 aa25.01■■□□□ 1.59
CCZ1B-211ENST00000486840 APCDD1LQ8NCL9 501 aa25.01■■□□□ 1.59
CCZ1B-211ENST00000486840 L3HYPDHQ96EM0 354 aa25.01■■□□□ 1.59
CCZ1B-211ENST00000486840 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP25.01■■□□□ 1.59
CCZ1B-211ENST00000486840 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
CCZ1B-211ENST00000486840 ERVK-11Q9UQG0 969 aa25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.4 ms