RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483765.5

RPL21-208, Transcript of ribosomal protein L21, human

TSL 3

Gene RPL21, Length 453 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPL21-208	ENST00000483765	ACAT1	P24752	427 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
RPL21-208	ENST00000483765	ELAVL4	P26378	380 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
RPL21-208	ENST00000483765	GYG1	P46976	350 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RPL21-208	ENST00000483765	CCL23	P55773	120 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RPL21-208	ENST00000483765	XG	P55808	180 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RPL21-208	ENST00000483765	CACNG1	Q06432	222 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RPL21-208	ENST00000483765	NFATC2	Q13469	925 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RPL21-208	ENST00000483765	CAMK2D	Q13557	499 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RPL21-208	ENST00000483765	CDH18	Q13634	790 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RPL21-208	ENST00000483765	NONO	Q15233	471 aa	Known RBP eCLIP	3.88	□□□□□ -1.79
RPL21-208	ENST00000483765	MOGAT2	Q3SYC2	334 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RPL21-208	ENST00000483765	EPC2	Q52LR7	807 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RPL21-208	ENST00000483765	TAF1B	Q53T94	588 aa	Predicted RBP	3.88	□□□□□ -1.79
RPL21-208	ENST00000483765	C6orf136	Q5SQH8	315 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RPL21-208	ENST00000483765	TATDN1	Q6P1N9	297 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RPL21-208	ENST00000483765	CCDC60	Q8IWA6	550 aa	Predicted RBP	3.88	□□□□□ -1.79
RPL21-208	ENST00000483765	NUP37	Q8NFH4	326 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RPL21-208	ENST00000483765	METTL21A	Q8WXB1	218 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RPL21-208	ENST00000483765	KLHL5	Q96PQ7	755 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RPL21-208	ENST00000483765	OVOL2	Q9BRP0	275 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RPL21-208	ENST00000483765	UBXN6	Q9BZV1	441 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RPL21-208	ENST00000483765	ALDH8A1	Q9H2A2	487 aa	Predicted RBP	3.88	□□□□□ -1.79
RPL21-208	ENST00000483765	STAU2	Q9NUL3	570 aa	Known RBP eCLIP	3.88	□□□□□ -1.79
RPL21-208	ENST00000483765	TEX10	Q9NXF1	929 aa	Predicted RBP	3.88	□□□□□ -1.79
RPL21-208	ENST00000483765	NDE1	Q9NXR1	346 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RPL21-208	ENST00000483765	SELENOK	Q9Y6D0	94 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RPL21-208	ENST00000483765	NOTCH2	Q04721	2471 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RPL21-208	ENST00000483765		A0A1B0GUL6	1792 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RPL21-208	ENST00000483765	GRIN2D	O15399	1336 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RPL21-208	ENST00000483765	IL16	Q14005	1332 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RPL21-208	ENST00000483765	MYH3	P11055	1940 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RPL21-208	ENST00000483765		A0A087WV48	116 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RPL21-208	ENST00000483765	IGKV3D-20	A0A0C4DH25	116 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RPL21-208	ENST00000483765	DIAPH2	O60879	1101 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RPL21-208	ENST00000483765	PDGFB	P01127	241 aa	Predicted RBP	3.87	□□□□□ -1.79
RPL21-208	ENST00000483765	CD59	P13987	128 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RPL21-208	ENST00000483765	SOX3	P41225	446 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RPL21-208	ENST00000483765	ZNF41	P51814	821 aa	Predicted RBP	3.87	□□□□□ -1.79
RPL21-208	ENST00000483765	MTCP1	P56278	107 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RPL21-208	ENST00000483765	TMEM50B	P56557	158 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RPL21-208	ENST00000483765	MZT1	Q08AG7	82 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RPL21-208	ENST00000483765	TRA2A	Q13595	282 aa	Known RBP eCLIP	3.87	□□□□□ -1.79
RPL21-208	ENST00000483765	LY6D	Q14210	128 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RPL21-208	ENST00000483765	ZNF273	Q14593	569 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RPL21-208	ENST00000483765	MTF1	Q14872	753 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RPL21-208	ENST00000483765	TMEM132D	Q14C87	1099 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RPL21-208	ENST00000483765	SNAI3	Q3KNW1	292 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RPL21-208	ENST00000483765	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	3.87	□□□□□ -1.79
RPL21-208	ENST00000483765	CTR9	Q6PD62	1173 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RPL21-208	ENST00000483765	TMED8	Q6PL24	325 aa	Predicted RBP	3.87	□□□□□ -1.79
RPL21-208	ENST00000483765	TMEM184A	Q6ZMB5	413 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RPL21-208	ENST00000483765	PPP1R21	Q6ZMI0	780 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RPL21-208	ENST00000483765	ABI3BP	Q7Z7G0	1075 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RPL21-208	ENST00000483765	AFAP1L1	Q8TED9	768 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RPL21-208	ENST00000483765	P2RX5	Q93086	422 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RPL21-208	ENST00000483765	FER1L6-AS2	Q96M78	137 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RPL21-208	ENST00000483765	PRICKLE1	Q96MT3	831 aa	Predicted RBP	3.87	□□□□□ -1.79
RPL21-208	ENST00000483765	FAM218A	Q96MZ4	157 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RPL21-208	ENST00000483765	BTBD9	Q96Q07	612 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RPL21-208	ENST00000483765	PYGO2	Q9BRQ0	406 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RPL21-208	ENST00000483765	RAVER2	Q9HCJ3	691 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
RPL21-208	ENST00000483765	MYO7A	Q13402	2215 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RPL21-208	ENST00000483765	COL4A4	P53420	1690 aa	Predicted RBP	3.87	□□□□□ -1.79
RPL21-208	ENST00000483765	CDK5RAP2	Q96SN8	1893 aa		3.86	□□□□□ -1.79
RPL21-208	ENST00000483765	IGHV3OR16-10	A0A075B7F0	116 aa		3.86	□□□□□ -1.79
RPL21-208	ENST00000483765	MTMR11	A4FU01	709 aa		3.86	□□□□□ -1.79
RPL21-208	ENST00000483765	C17orf105	B2RV13	164 aa		3.86	□□□□□ -1.79
RPL21-208	ENST00000483765	DKC1	O60832	514 aa	Known RBP eCLIP	3.86	□□□□□ -1.79	1e-323	■■■□□ 14.6
RPL21-208	ENST00000483765	KIN	O60870	393 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79
RPL21-208	ENST00000483765	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	3.86	□□□□□ -1.79
RPL21-208	ENST00000483765	LUC7L3	O95232	432 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79
RPL21-208	ENST00000483765	SNAI1	O95863	264 aa	Predicted RBP	3.86	□□□□□ -1.79
RPL21-208	ENST00000483765	SERPING1	P05155	500 aa		3.86	□□□□□ -1.79
RPL21-208	ENST00000483765	EPOR	P19235	508 aa		3.86	□□□□□ -1.79
RPL21-208	ENST00000483765	SP100	P23497	879 aa	Predicted RBP	3.86	□□□□□ -1.79
RPL21-208	ENST00000483765	PTAFR	P25105	342 aa		3.86	□□□□□ -1.79
RPL21-208	ENST00000483765	DEK	P35659	375 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79
RPL21-208	ENST00000483765	CETN2	P41208	172 aa		3.86	□□□□□ -1.79
RPL21-208	ENST00000483765	DCDC1	P59894	354 aa		3.86	□□□□□ -1.79
RPL21-208	ENST00000483765	LMO4	P61968	165 aa		3.86	□□□□□ -1.79
RPL21-208	ENST00000483765	ELAVL2	Q12926	359 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79
RPL21-208	ENST00000483765	GPM6B	Q13491	265 aa		3.86	□□□□□ -1.79
RPL21-208	ENST00000483765	SLC1A5	Q15758	541 aa		3.86	□□□□□ -1.79
RPL21-208	ENST00000483765	RBBP7	Q16576	425 aa		3.86	□□□□□ -1.79
RPL21-208	ENST00000483765	CCDC57	Q2TAC2	916 aa		3.86	□□□□□ -1.79
RPL21-208	ENST00000483765	FAM43B	Q6ZT52	329 aa	Predicted RBP	3.86	□□□□□ -1.79
RPL21-208	ENST00000483765	SLC24A5	Q71RS6	500 aa		3.86	□□□□□ -1.79
RPL21-208	ENST00000483765	CPEB2	Q7Z5Q1	589 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79
RPL21-208	ENST00000483765	LRTM2	Q8N967	370 aa		3.86	□□□□□ -1.79
RPL21-208	ENST00000483765	KIF18A	Q8NI77	898 aa		3.86	□□□□□ -1.79
RPL21-208	ENST00000483765	C9orf43	Q8TAL5	461 aa	Predicted RBP	3.86	□□□□□ -1.79
RPL21-208	ENST00000483765	ANKRD9	Q96BM1	317 aa	Predicted RBP	3.86	□□□□□ -1.79
RPL21-208	ENST00000483765	PYCR2	Q96C36	320 aa		3.86	□□□□□ -1.79
RPL21-208	ENST00000483765	ERP27	Q96DN0	273 aa		3.86	□□□□□ -1.79
RPL21-208	ENST00000483765	PGM2	Q96G03	612 aa		3.86	□□□□□ -1.79
RPL21-208	ENST00000483765	C2orf48	Q96LS8	159 aa		3.86	□□□□□ -1.79
RPL21-208	ENST00000483765	LRRC61	Q9BV99	259 aa		3.86	□□□□□ -1.79
RPL21-208	ENST00000483765	TRPV6	Q9H1D0	765 aa		3.86	□□□□□ -1.79
RPL21-208	ENST00000483765	MTHFD2L	Q9H903	347 aa	Predicted RBP	3.86	□□□□□ -1.79
RPL21-208	ENST00000483765	NUDT4	Q9NZJ9	180 aa		3.86	□□□□□ -1.79

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.6 ms