RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481231.5

SMARCE1-210, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 695 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-210ENST00000481231 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa8.71□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 ACOT7O00154 380 aa8.71□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 CYR61O00622 381 aa8.71□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 CLDN4O14493 209 aa8.71□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 B3GALT2O43825 422 aa8.71□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 IGHG3P01860 377 aa8.71□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 IFNA16P05015 189 aa8.71□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa8.71□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 GNAZP19086 355 aa8.71□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 CERS1P27544 350 aa8.71□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 ELK3P41970 407 aa8.71□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 GDF5P43026 501 aa8.71□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 HNMTP50135 292 aa8.71□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 PLA2G16P53816 162 aa8.71□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 CDKL1Q00532 357 aa8.71□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF460Q14592 562 aa8.71□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 TSNQ15631 228 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 STEAP4Q687X5 459 aa8.71□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 ADNP2Q6IQ32 1131 aa8.71□□□□□ -1.02
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SMARCE1-210ENST00000481231 HSDL2Q6YN16 418 aa8.71□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 RGS9BPQ6ZS82 235 aa8.71□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 VN1R5Q7Z5H4 357 aa8.71□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa8.71□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 SLC22A16Q86VW1 577 aa8.71□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa8.71□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 TMEM251Q8N6I4 163 aa8.71□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 TTLQ8NG68 377 aa8.71□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 ACTRT1Q8TDG2 376 aa8.71□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 CCT6BQ92526 530 aa8.71□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 EGFL8Q99944 293 aa8.71□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 SH3GL2Q99962 352 aa8.71□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 CHMP2BQ9UQN3 213 aa8.71□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 OARD1Q9Y530 152 aa8.71□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa8.71□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 A0A088AWK7 358 aa8.7□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 OR14I1A6ND48 311 aa8.7□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 FIGNL2A6NMB9 653 aa8.7□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 CLCA1A8K7I4 914 aa8.7□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 SYT5O00445 386 aa8.7□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 BCKDKO14874 412 aa8.7□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 PRAMEF4O60810 478 aa8.7□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 SMPD2O60906 423 aa8.7□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 CTNSO60931 367 aa8.7□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
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SMARCE1-210ENST00000481231 WDR47O94967 919 aa8.7□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 CELA3AP09093 270 aa8.7□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 IVDP26440 423 aa8.7□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 GSTM2P28161 218 aa8.7□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 MAGEA5P43359 124 aa8.7□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 HK2P52789 917 aa8.7□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 LIM2P55344 173 aa8.7□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 TAS2R39P59534 338 aa8.7□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 KRTAP1-1Q07627 177 aa8.7□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 FOXO1Q12778 655 aa8.7□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 BMPR2Q13873 1038 aa8.7□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF750Q32MQ0 723 aa8.7□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 ADPRMQ3LIE5 342 aa8.7□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa8.7□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa8.7□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 ABHD17CQ6PCB6 329 aa8.7□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 PODNL1Q6PEZ8 512 aa8.7□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 RTL4Q6ZR62 310 aa8.7□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 GK5Q6ZS86 529 aa8.7□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 TRILQ7L0X0 811 aa8.7□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
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SMARCE1-210ENST00000481231 PDIK1LQ8N165 341 aa8.7□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 FAM109AQ8N4B1 249 aa8.7□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF321PQ8N8H1 164 aa8.7□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 OR2L5Q8NG80 312 aa8.7□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 OR14A16Q8NHC5 309 aa8.7□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 LINC01560Q8TB33 94 aa8.7□□□□□ -1.02
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SMARCE1-210ENST00000481231 ANKRD49Q8WVL7 239 aa8.7□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 ANKRD7Q92527 254 aa8.7□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 RHBDF1Q96CC6 855 aa8.7□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 PERPQ96FX8 193 aa8.7□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 SCYL1Q96KG9 808 aa8.7□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 OSBPL9Q96SU4 736 aa8.7□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 FAM173AQ9BQD7 235 aa8.7□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 OR8D2Q9GZM6 311 aa8.7□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 IL1RL2Q9HB29 575 aa8.7□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa8.7□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 VTI1BQ9UEU0 232 aa8.7□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 A0A1B0GVC2 190 aa8.69□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa8.69□□□□□ -1.02
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