RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 METTL6Q8TCB7 284 aa19.58■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 CNDP1Q96KN2 507 aa19.58■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 HBEGFQ99075 208 aa19.58■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 RNF32Q9H0A6 362 aa19.58■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP19.58■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 ADAP2Q9NPF8 381 aa19.58■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 AHSPQ9NZD4 102 aa19.58■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 VTI1BQ9UEU0 232 aa19.58■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 TEKT2Q9UIF3 430 aa19.58■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 ADAM29Q9UKF5 820 aa19.58■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 SLC12A4Q9UP95 1085 aa19.58■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa19.58■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 A0A1W2PR48 441 aa19.57■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa19.57■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 FGF17O60258 216 aa19.57■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 SPAG7O75391 227 aa19.57■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP19.57■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 F10P00742 488 aa19.57■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 KRT6AP02538 564 aa19.57■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 KRT6BP04259 564 aa19.57■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 FAM58BPP0C7Q3 252 aa19.57■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 CREB1P16220 341 aa19.57■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 KRT6CP48668 564 aa19.57■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 HTR6P50406 440 aa19.57■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP19.57■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 ID2Q02363 134 aa19.57■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP19.57■□□□□ 0.72
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ACTB-211ENST00000480301 PCLAFQ15004 111 aa19.57■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 TLR1Q15399 786 aa19.57■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP19.57■□□□□ 0.72
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ACTB-211ENST00000480301 FRMD7Q6ZUT3 714 aa19.57■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 C10orf107Q8IVU9 208 aa19.57■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 OR4N5Q8IXE1 308 aa19.57■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 IQCKQ8N0W5 287 aa19.57■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP19.57■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 KCNA7Q96RP8 456 aa19.57■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 MID1IP1Q9NPA3 183 aa19.57■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 MID2Q9UJV3 735 aa19.57■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 TIMM22Q9Y584 194 aa19.57■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 DYTNA2CJ06 578 aa19.56■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 WASHC1A8K0Z3 465 aa19.56■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 ULK1O75385 1050 aa19.56■□□□□ 0.72
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ACTB-211ENST00000480301 KLK1P06870 262 aa19.56■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 CHN1P15882 459 aa19.56■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 HMOX2P30519 316 aa19.56■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP19.56■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP19.56■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 TNFSF10P50591 281 aa19.56■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 FOXA1P55317 472 aa19.56■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 TAS2R50P59544 299 aa19.56■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 SERTAD2Q14140 314 aa19.56■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP19.56■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 MEP1AQ16819 746 aa19.56■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 KRT71Q3SY84 523 aa19.56■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 LIPMQ5VYY2 423 aa19.56■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 SLC5A8Q8N695 610 aa19.56■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 TANKQ92844 425 aa19.56■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 UCN3Q969E3 161 aa19.56■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP19.56■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 FAM111AQ96PZ2 611 aa19.56■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP19.56■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 SLC17A7Q9P2U7 560 aa19.56■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP19.56■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 AIFM1O95831 613 aa19.55■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 IFNA16P05015 189 aa19.55■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 HSD3B1P14060 373 aa19.55■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 HSD3B2P26439 372 aa19.55■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 FOLH1Q04609 750 aa19.55■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 CFAP157Q5JU67 520 aa19.55■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 PAGE2Q7Z2X7 111 aa19.55■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 COMMD6Q7Z4G1 85 aa19.55■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP19.55■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 LGI4Q8N135 537 aa19.55■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 BEST3Q8N1M1 668 aa19.55■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa19.55■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP19.55■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 OR1N1Q8NGS0 311 aa19.55■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 TCP10LQ8TDR4 215 aa19.55■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 CHTF18Q8WVB6 975 aa19.55■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 NCLNQ969V3 563 aa19.55■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 C19orf60Q96EN9 201 aa19.55■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 SMC6Q96SB8 1091 aa19.55■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP19.55■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 CDCP1Q9H5V8 836 aa19.55■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 NMRK1Q9NWW6 199 aa19.55■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 VPS29Q9UBQ0 182 aa19.55■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 OR5H15A6NDH6 313 aa19.54■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 TRIM13O60858 407 aa19.54■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 NR2F6P10588 404 aa19.54■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 CLCN2P51788 898 aa19.54■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP19.54■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa19.54■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 ARMC10Q8N2F6 343 aa19.54■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP19.54■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 C7orf57Q8NEG2 295 aa19.54■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 VMP1Q96GC9 406 aa19.54■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 DEFB126Q9BYW3 111 aa19.54■□□□□ 0.72
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