RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472032.1

BBX-222, Transcript of BBX, HMG-box containing, human

TSL 4

Gene BBX, Length 549 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBX-222	ENST00000472032	ABR	Q12979	859 aa		3.88	□□□□□ -1.79
BBX-222	ENST00000472032	MLLT11	Q13015	90 aa	Predicted RBP	3.88	□□□□□ -1.79
BBX-222	ENST00000472032	MRPL28	Q13084	256 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
BBX-222	ENST00000472032	SLC14A1	Q13336	389 aa		3.88	□□□□□ -1.79
BBX-222	ENST00000472032	TP53BP2	Q13625	1128 aa		3.88	□□□□□ -1.79
BBX-222	ENST00000472032	GTF2H2	Q13888	395 aa		3.88	□□□□□ -1.79
BBX-222	ENST00000472032	KCNC3	Q14003	757 aa		3.88	□□□□□ -1.79
BBX-222	ENST00000472032	VEZF1	Q14119	521 aa		3.88	□□□□□ -1.79
BBX-222	ENST00000472032	ZNF267	Q14586	743 aa	Predicted RBP	3.88	□□□□□ -1.79
BBX-222	ENST00000472032	IHH	Q14623	411 aa		3.88	□□□□□ -1.79
BBX-222	ENST00000472032	PTGR1	Q14914	329 aa		3.88	□□□□□ -1.79
BBX-222	ENST00000472032	VEPH1	Q14D04	833 aa		3.88	□□□□□ -1.79
BBX-222	ENST00000472032	ABRAXAS2	Q15018	415 aa		3.88	□□□□□ -1.79
BBX-222	ENST00000472032	SF3A2	Q15428	464 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
BBX-222	ENST00000472032	SMAD2	Q15796	467 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
BBX-222	ENST00000472032	GRIK4	Q16099	956 aa		3.88	□□□□□ -1.79
BBX-222	ENST00000472032	TAF12	Q16514	161 aa		3.88	□□□□□ -1.79
BBX-222	ENST00000472032	LY6K	Q17RY6	165 aa		3.88	□□□□□ -1.79
BBX-222	ENST00000472032	PRSS53	Q2L4Q9	553 aa		3.88	□□□□□ -1.79
BBX-222	ENST00000472032	VMAC	Q2NL98	169 aa		3.88	□□□□□ -1.79
BBX-222	ENST00000472032	WSCD2	Q2TBF2	565 aa		3.88	□□□□□ -1.79
BBX-222	ENST00000472032	PTCHD3	Q3KNS1	767 aa		3.88	□□□□□ -1.79
BBX-222	ENST00000472032	USP39	Q53GS9	565 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
BBX-222	ENST00000472032	ZNF628	Q5EBL2	1059 aa		3.88	□□□□□ -1.79
BBX-222	ENST00000472032	PDZK1	Q5T2W1	519 aa		3.88	□□□□□ -1.79
BBX-222	ENST00000472032	DDI2	Q5TDH0	399 aa		3.88	□□□□□ -1.79
BBX-222	ENST00000472032	GARNL3	Q5VVW2	1013 aa		3.88	□□□□□ -1.79
BBX-222	ENST00000472032	MEDAG	Q5VYS4	303 aa		3.88	□□□□□ -1.79
BBX-222	ENST00000472032	RNLS	Q5VYX0	342 aa		3.88	□□□□□ -1.79
BBX-222	ENST00000472032	SHE	Q5VZ18	495 aa		3.88	□□□□□ -1.79
BBX-222	ENST00000472032	PLAG1	Q6DJT9	500 aa		3.88	□□□□□ -1.79
BBX-222	ENST00000472032	GPR139	Q6DWJ6	353 aa		3.88	□□□□□ -1.79
BBX-222	ENST00000472032	NADSYN1	Q6IA69	706 aa		3.88	□□□□□ -1.79
BBX-222	ENST00000472032	TYW3	Q6IPR3	259 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
BBX-222	ENST00000472032	RETSAT	Q6NUM9	610 aa		3.88	□□□□□ -1.79
BBX-222	ENST00000472032	ANKRD54	Q6NXT1	300 aa		3.88	□□□□□ -1.79
BBX-222	ENST00000472032	GTF2H2C	Q6P1K8	395 aa		3.88	□□□□□ -1.79
BBX-222	ENST00000472032	METTL2B	Q6P1Q9	378 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
BBX-222	ENST00000472032	MSANTD2	Q6P1R3	559 aa		3.88	□□□□□ -1.79
BBX-222	ENST00000472032	SLC27A1	Q6PCB7	646 aa		3.88	□□□□□ -1.79
BBX-222	ENST00000472032	BRAT1	Q6PJG6	821 aa		3.88	□□□□□ -1.79
BBX-222	ENST00000472032	TEX261	Q6UWH6	196 aa		3.88	□□□□□ -1.79
BBX-222	ENST00000472032	ARSK	Q6UWY0	536 aa		3.88	□□□□□ -1.79
BBX-222	ENST00000472032	FAM131A	Q6UXB0	335 aa		3.88	□□□□□ -1.79
BBX-222	ENST00000472032	PAMR1	Q6UXH9	720 aa		3.88	□□□□□ -1.79
BBX-222	ENST00000472032		Q6ZPB1	254 aa	Predicted RBP	3.88	□□□□□ -1.79
BBX-222	ENST00000472032	PLEKHM3	Q6ZWE6	761 aa		3.88	□□□□□ -1.79
BBX-222	ENST00000472032	TRIM46	Q7Z4K8	759 aa		3.88	□□□□□ -1.79
BBX-222	ENST00000472032	VTCN1	Q7Z7D3	282 aa		3.88	□□□□□ -1.79
BBX-222	ENST00000472032	COMMD7	Q86VX2	200 aa		3.88	□□□□□ -1.79
BBX-222	ENST00000472032	PTOV1	Q86YD1	416 aa		3.88	□□□□□ -1.79
BBX-222	ENST00000472032	RASAL3	Q86YV0	1011 aa		3.88	□□□□□ -1.79
BBX-222	ENST00000472032	LAS2	Q8IYD9	372 aa		3.88	□□□□□ -1.79
BBX-222	ENST00000472032	FAM9C	Q8IZT9	166 aa		3.88	□□□□□ -1.79
BBX-222	ENST00000472032	UMODL1-AS1	Q8N2C9	162 aa		3.88	□□□□□ -1.79
BBX-222	ENST00000472032	KRTCAP2	Q8N6L1	136 aa		3.88	□□□□□ -1.79
BBX-222	ENST00000472032	ZNF680	Q8NEM1	530 aa		3.88	□□□□□ -1.79
BBX-222	ENST00000472032	B3GNT7	Q8NFL0	401 aa		3.88	□□□□□ -1.79
BBX-222	ENST00000472032	OR4F6	Q8NGB9	312 aa		3.88	□□□□□ -1.79
BBX-222	ENST00000472032	OR10G2	Q8NGC3	310 aa		3.88	□□□□□ -1.79
BBX-222	ENST00000472032	OR8H1	Q8NGG4	311 aa		3.88	□□□□□ -1.79
BBX-222	ENST00000472032	OR10Q1	Q8NGQ4	319 aa		3.88	□□□□□ -1.79
BBX-222	ENST00000472032	OR13C4	Q8NGS5	318 aa		3.88	□□□□□ -1.79
BBX-222	ENST00000472032	OR4L1	Q8NH43	312 aa		3.88	□□□□□ -1.79
BBX-222	ENST00000472032	LILRB1	Q8NHL6	650 aa	Predicted RBP	3.88	□□□□□ -1.79
BBX-222	ENST00000472032	WDR36	Q8NI36	951 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
BBX-222	ENST00000472032	ARRDC2	Q8TBH0	407 aa		3.88	□□□□□ -1.79
BBX-222	ENST00000472032	CD200R1	Q8TD46	325 aa		3.88	□□□□□ -1.79
BBX-222	ENST00000472032	UBTD2	Q8WUN7	234 aa		3.88	□□□□□ -1.79
BBX-222	ENST00000472032	BRI3BP	Q8WY22	251 aa		3.88	□□□□□ -1.79
BBX-222	ENST00000472032	AKAP1	Q92667	903 aa	Known RBP eCLIP	3.88	□□□□□ -1.79
BBX-222	ENST00000472032	HGD	Q93099	445 aa		3.88	□□□□□ -1.79
BBX-222	ENST00000472032	SLC25A46	Q96AG3	418 aa		3.88	□□□□□ -1.79
BBX-222	ENST00000472032	TESC	Q96BS2	214 aa		3.88	□□□□□ -1.79
BBX-222	ENST00000472032	UPRT	Q96BW1	309 aa		3.88	□□□□□ -1.79
BBX-222	ENST00000472032	VWCE	Q96DN2	955 aa		3.88	□□□□□ -1.79
BBX-222	ENST00000472032	LINGO1	Q96FE5	620 aa		3.88	□□□□□ -1.79
BBX-222	ENST00000472032	WDR89	Q96FK6	387 aa	Predicted RBP	3.88	□□□□□ -1.79
BBX-222	ENST00000472032	PDXP	Q96GD0	296 aa		3.88	□□□□□ -1.79
BBX-222	ENST00000472032	TMEM41A	Q96HV5	264 aa		3.88	□□□□□ -1.79
BBX-222	ENST00000472032	C7orf34	Q96L11	122 aa		3.88	□□□□□ -1.79
BBX-222	ENST00000472032	SPATA33	Q96N06	139 aa		3.88	□□□□□ -1.79
BBX-222	ENST00000472032	QRFPR	Q96P65	431 aa		3.88	□□□□□ -1.79
BBX-222	ENST00000472032	FANCD2OS	Q96PS1	177 aa		3.88	□□□□□ -1.79
BBX-222	ENST00000472032	PPP1R16B	Q96T49	567 aa		3.88	□□□□□ -1.79
BBX-222	ENST00000472032	INPP5K	Q9BT40	448 aa		3.88	□□□□□ -1.79
BBX-222	ENST00000472032	MED10	Q9BTT4	135 aa		3.88	□□□□□ -1.79
BBX-222	ENST00000472032	CNPPD1	Q9BV87	410 aa		3.88	□□□□□ -1.79
BBX-222	ENST00000472032	KATNAL1	Q9BW62	490 aa		3.88	□□□□□ -1.79
BBX-222	ENST00000472032	SLC29A3	Q9BZD2	475 aa		3.88	□□□□□ -1.79
BBX-222	ENST00000472032	SIK2	Q9H0K1	926 aa		3.88	□□□□□ -1.79
BBX-222	ENST00000472032	PPA2	Q9H2U2	334 aa		3.88	□□□□□ -1.79
BBX-222	ENST00000472032	PIGU	Q9H490	435 aa		3.88	□□□□□ -1.79
BBX-222	ENST00000472032	HEXA-AS1	Q9H8Q6	139 aa		3.88	□□□□□ -1.79
BBX-222	ENST00000472032	TRIM45	Q9H8W5	580 aa	Predicted RBP	3.88	□□□□□ -1.79
BBX-222	ENST00000472032	ANKRA2	Q9H9E1	313 aa		3.88	□□□□□ -1.79
BBX-222	ENST00000472032	ERVMER34-1	Q9H9K5	563 aa		3.88	□□□□□ -1.79
BBX-222	ENST00000472032	SP110	Q9HB58	689 aa		3.88	□□□□□ -1.79
BBX-222	ENST00000472032	FOLH1B	Q9HBA9	442 aa		3.88	□□□□□ -1.79
BBX-222	ENST00000472032	LRTM1	Q9HBL6	345 aa		3.88	□□□□□ -1.79

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.9 ms