RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470201.5

RABGGTB-207, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 848 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-207ENST00000470201 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-207ENST00000470201 KLHL30Q0D2K2 578 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-207ENST00000470201 SNX1Q13596 522 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-207ENST00000470201 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-207ENST00000470201 KRT81Q14533 505 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-207ENST00000470201 PDIA5Q14554 519 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-207ENST00000470201 WSCD2Q2TBF2 565 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-207ENST00000470201 C1orf189Q5VU69 101 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-207ENST00000470201 IL23RQ5VWK5 629 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-207ENST00000470201 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-207ENST00000470201 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-207ENST00000470201 CHMP1BQ7LBR1 199 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-207ENST00000470201 BNIPLQ7Z465 357 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-207ENST00000470201 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-207ENST00000470201 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-207ENST00000470201 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-207ENST00000470201 SLC22A16Q86VW1 577 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-207ENST00000470201 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-207ENST00000470201 HSCBQ8IWL3 235 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-207ENST00000470201 LMNTD2Q8IXW0 634 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-207ENST00000470201 LRRC17Q8N6Y2 441 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-207ENST00000470201 MINDY2Q8NBR6 621 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-207ENST00000470201 FAM71CQ8NEG0 241 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-207ENST00000470201 OR5M9Q8NGP3 310 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-207ENST00000470201 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-207ENST00000470201 TMEM190Q8WZ59 177 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-207ENST00000470201 HIST1H2ACQ93077 130 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-207ENST00000470201 MAGED4Q96JG8 741 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-207ENST00000470201 CTAGE1Q96RT6 745 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-207ENST00000470201 CBWD1Q9BRT8 395 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-207ENST00000470201 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-207ENST00000470201 CCSER1Q9C0I3 900 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-207ENST00000470201 ECT2Q9H8V3 914 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-207ENST00000470201 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-207ENST00000470201 HPS4Q9NQG7 708 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-207ENST00000470201 VPS54Q9P1Q0 977 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-207ENST00000470201 ANKMY1Q9P2S6 941 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-207ENST00000470201 IL20RAQ9UHF4 553 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-207ENST00000470201 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-207ENST00000470201 DISP3Q9P2K9 1392 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-207ENST00000470201 YJEFN3A6XGL0 299 aa4□□□□□ -1.77
RABGGTB-207ENST00000470201 CEACAM4O75871 244 aa4□□□□□ -1.77
RABGGTB-207ENST00000470201 PATE4P0C8F1 98 aa4□□□□□ -1.77
RABGGTB-207ENST00000470201 GNB3P16520 340 aa4□□□□□ -1.77
RABGGTB-207ENST00000470201 EDNRAP25101 427 aa4□□□□□ -1.77
RABGGTB-207ENST00000470201 TSFMP43897 325 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
RABGGTB-207ENST00000470201 FHITP49789 147 aa4□□□□□ -1.77
RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF131P52739 623 aa4□□□□□ -1.77
RABGGTB-207ENST00000470201 LIMK2P53671 638 aa4□□□□□ -1.77
RABGGTB-207ENST00000470201 MYBPC1Q00872 1141 aa4□□□□□ -1.77
RABGGTB-207ENST00000470201 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
RABGGTB-207ENST00000470201 NME3Q13232 169 aa4□□□□□ -1.77
RABGGTB-207ENST00000470201 SCGB2A2Q13296 93 aa4□□□□□ -1.77
RABGGTB-207ENST00000470201 TRADDQ15628 312 aa4□□□□□ -1.77
RABGGTB-207ENST00000470201 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
RABGGTB-207ENST00000470201 ARSKQ6UWY0 536 aa4□□□□□ -1.77
RABGGTB-207ENST00000470201 Q6ZSR9 355 aa4□□□□□ -1.77
RABGGTB-207ENST00000470201 TMEM26Q6ZUK4 368 aa4□□□□□ -1.77
RABGGTB-207ENST00000470201 Q71RC1 249 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
RABGGTB-207ENST00000470201 WDR49Q8IV35 697 aa4□□□□□ -1.77
RABGGTB-207ENST00000470201 PARP8Q8N3A8 854 aa4□□□□□ -1.77
RABGGTB-207ENST00000470201 C9orf106Q8NAJ2 232 aa4□□□□□ -1.77
RABGGTB-207ENST00000470201 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
RABGGTB-207ENST00000470201 PCED1BQ96HM7 432 aa4□□□□□ -1.77
RABGGTB-207ENST00000470201 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
RABGGTB-207ENST00000470201 F2RL3Q96RI0 385 aa4□□□□□ -1.77
RABGGTB-207ENST00000470201 RAB40CQ96S21 281 aa4□□□□□ -1.77
RABGGTB-207ENST00000470201 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
RABGGTB-207ENST00000470201 PINK1Q9BXM7 581 aa4□□□□□ -1.77
RABGGTB-207ENST00000470201 NACA2Q9H009 215 aa4□□□□□ -1.77
RABGGTB-207ENST00000470201 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
RABGGTB-207ENST00000470201 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
RABGGTB-207ENST00000470201 ERVK-18Q9QC07 812 aa4□□□□□ -1.77
RABGGTB-207ENST00000470201 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa4□□□□□ -1.77
RABGGTB-207ENST00000470201 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
RABGGTB-207ENST00000470201 ICAM5Q9UMF0 924 aa4□□□□□ -1.77
RABGGTB-207ENST00000470201 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa4□□□□□ -1.77
RABGGTB-207ENST00000470201 ENTPD4Q9Y227 616 aa4□□□□□ -1.77
RABGGTB-207ENST00000470201 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa4□□□□□ -1.77
RABGGTB-207ENST00000470201 SHISA7A6NL88 538 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-207ENST00000470201 CLDN3O15551 220 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-207ENST00000470201 ADAM12O43184 909 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-207ENST00000470201 KIAA0513O60268 411 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-207ENST00000470201 IGHEP01854 428 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-207ENST00000470201 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-207ENST00000470201 LYNP07948 512 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-207ENST00000470201 MDH1P40925 334 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-207ENST00000470201 MAGEA4P43358 317 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-207ENST00000470201 ACADSBP45954 432 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-207ENST00000470201 SLC6A8P48029 635 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-207ENST00000470201 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-207ENST00000470201 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-207ENST00000470201 CDKL1Q00532 357 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-207ENST00000470201 PDZK1IP1Q13113 114 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-207ENST00000470201 LIPJQ5W064 366 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-207ENST00000470201 GALNT17Q6IS24 598 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-207ENST00000470201 AFTPHQ6ULP2 937 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-207ENST00000470201 Q6ZRG5 221 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-207ENST00000470201 ZER1Q7Z7L7 766 aa3.99□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.4 ms