RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449757.5

DDX39B-211, Transcript of DExD-box helicase 39B, humanhuman

TSL 3

Gene DDX39B, Length 591 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39B-211ENST00000449757 WWOXQ9NZC7 414 aa9.52□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa9.52□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 CHMP2BQ9UQN3 213 aa9.52□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 ATG4BQ9Y4P1 393 aa9.52□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 OARD1Q9Y530 152 aa9.52□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 CLDN16Q9Y5I7 305 aa9.52□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa9.51□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 A0A1B0GVC2 190 aa9.51□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 LRIT2A6NDA9 550 aa9.51□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 HSPB2A8KAH6 182 aa9.51□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 DVL2O14641 736 aa9.51□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 PROM1O43490 865 aa9.51□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 SUSD5O60279 629 aa9.51□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 HCN1O60741 890 aa9.51□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 SH3BGRLO75368 114 aa9.51□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 PEX19P40855 299 aa9.51□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 HNMTP50135 292 aa9.51□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 ASCL1P50553 236 aa9.51□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 ASPHQ12797 758 aa9.51□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 KEAP1Q14145 624 aa9.51□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP9.51□□□□□ -0.891e-6■■■□□ 18.3
DDX39B-211ENST00000449757 TSNQ15631 228 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 HSPB2Q16082 182 aa9.51□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 MSS51Q4VC12 460 aa9.51□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 FBXO48Q5FWF7 155 aa9.51□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa9.51□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 ADNP2Q6IQ32 1131 aa9.51□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 PAMR1Q6UXH9 720 aa9.51□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa9.51□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 TAOK1Q7L7X3 1001 aa9.51□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 GALNT7Q86SF2 657 aa9.51□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa9.51□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 FBXW8Q8N3Y1 598 aa9.51□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 QRFPRQ96P65 431 aa9.51□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 GAL3ST4Q96RP7 486 aa9.51□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 NAT9Q9BTE0 207 aa9.51□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 DAPP1Q9UN19 280 aa9.51□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 SPACA6W5XKT8 324 aa9.51□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 EXPH5Q8NEV8 1989 aa9.51□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa9.51□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa9.5□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 CYR61O00622 381 aa9.5□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 DYRK3O43781 588 aa9.5□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 CTNSO60931 367 aa9.5□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 CLEC3AO75596 197 aa9.5□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 FAM155BO75949 473 aa9.5□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 RAF1P04049 648 aa9.5□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 GDF1P27539 372 aa9.5□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 GSTM2P28161 218 aa9.5□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 ELK3P41970 407 aa9.5□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 MSH2P43246 934 aa9.5□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 KCNC1P48547 511 aa9.5□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 FNTAP49354 379 aa9.5□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 WNT3P56703 355 aa9.5□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 CDKL1Q00532 357 aa9.5□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 FOXO1Q12778 655 aa9.5□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 SERTAD2Q14140 314 aa9.5□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 ABHD17CQ6PCB6 329 aa9.5□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 IGDCC3Q8IVU1 814 aa9.5□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 ULK2Q8IYT8 1036 aa9.5□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 RASGEF1CQ8N431 466 aa9.5□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 OR8K3Q8NH51 312 aa9.5□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 EXT2Q93063 718 aa9.5□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 KIAA1191Q96A73 305 aa9.5□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 PBKQ96KB5 322 aa9.5□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 DGAT2Q96PD7 388 aa9.5□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 KCNC2Q96PR1 638 aa9.5□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 F2RL3Q96RI0 385 aa9.5□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 KRT12Q99456 494 aa9.5□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa9.5□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 DNAJC11Q9NVH1 559 aa9.5□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 VTI1BQ9UEU0 232 aa9.5□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 CBLCQ9ULV8 474 aa9.5□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 MED12Q93074 2177 aa9.49□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa9.49□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 RTCAO00442 366 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 ETHE1O95571 254 aa9.49□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 RFPL3SP0C7P2 107 aa9.49□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 PCNAP12004 261 aa9.49□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 CPN2P22792 545 aa9.49□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 SSR2P43308 183 aa9.49□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 SLC6A12P48065 614 aa9.49□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 HSPA7P48741 367 aa9.49□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 SLC12A2P55011 1212 aa9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.4 ms