RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000447402.7

SELENBP1-208, Transcript of selenium binding protein 1, human

TSL 2 BASIC

Gene SELENBP1, Length 1,530 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SELENBP1-208	ENST00000447402	EMX2	Q04743	252 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SELENBP1-208	ENST00000447402	C2orf80	Q0P641	193 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SELENBP1-208	ENST00000447402	STX4	Q12846	297 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SELENBP1-208	ENST00000447402	HEPACAM	Q14CZ8	416 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SELENBP1-208	ENST00000447402	CCDC81	Q6ZN84	652 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SELENBP1-208	ENST00000447402	OR4N5	Q8IXE1	308 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SELENBP1-208	ENST00000447402	MMP21	Q8N119	569 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SELENBP1-208	ENST00000447402	CEP70	Q8NHQ1	597 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SELENBP1-208	ENST00000447402	RFWD2	Q8NHY2	731 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SELENBP1-208	ENST00000447402	CHMP6	Q96FZ7	201 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SELENBP1-208	ENST00000447402	SLC45A3	Q96JT2	553 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SELENBP1-208	ENST00000447402	OR52B2	Q96RD2	323 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SELENBP1-208	ENST00000447402	FAM107B	Q9H098	131 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SELENBP1-208	ENST00000447402	PRDM9	Q9NQV7	894 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SELENBP1-208	ENST00000447402	SEMA3G	Q9NS98	782 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SELENBP1-208	ENST00000447402	NOP53	Q9NZM5	478 aa	Known RBP	12.88	□□□□□ -0.35
SELENBP1-208	ENST00000447402	G3BP2	Q9UN86	482 aa	Known RBP	12.88	□□□□□ -0.35
SELENBP1-208	ENST00000447402	CCDC88C	Q9P219	2028 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SELENBP1-208	ENST00000447402	C1orf226	A1L170	272 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SELENBP1-208	ENST00000447402	CDC14C	A4D256	554 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SELENBP1-208	ENST00000447402	NKX2-8	O15522	239 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SELENBP1-208	ENST00000447402	EFS	O43281	561 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SELENBP1-208	ENST00000447402	AKAP10	O43572	662 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SELENBP1-208	ENST00000447402	CTNS	O60931	367 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SELENBP1-208	ENST00000447402	ALOX12B	O75342	701 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SELENBP1-208	ENST00000447402	RECK	O95980	971 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SELENBP1-208	ENST00000447402	C8orf89	P0DMQ9	161 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SELENBP1-208	ENST00000447402	WT1	P19544	449 aa	Predicted RBP	12.88	□□□□□ -0.35
SELENBP1-208	ENST00000447402	LSP1	P33241	339 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SELENBP1-208	ENST00000447402	SEC24C	P53992	1094 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SELENBP1-208	ENST00000447402	HSD17B7	P56937	341 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SELENBP1-208	ENST00000447402	RHAG	Q02094	409 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SELENBP1-208	ENST00000447402	ID2	Q02363	134 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SELENBP1-208	ENST00000447402	IL10RA	Q13651	578 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SELENBP1-208	ENST00000447402	QSOX2	Q6ZRP7	698 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SELENBP1-208	ENST00000447402	ACTRT2	Q8TDY3	377 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SELENBP1-208	ENST00000447402	TANK	Q92844	425 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SELENBP1-208	ENST00000447402	TSLP	Q969D9	159 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SELENBP1-208	ENST00000447402	RILP	Q96NA2	401 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZNF317	Q96PQ6	595 aa	Predicted RBP	12.88	□□□□□ -0.35
SELENBP1-208	ENST00000447402	EBF4	Q9BQW3	602 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SELENBP1-208	ENST00000447402	TCF7L2	Q9NQB0	619 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SELENBP1-208	ENST00000447402	NECTIN3	Q9NQS3	549 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SELENBP1-208	ENST00000447402	C5AR2	Q9P296	337 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZFHX4	Q86UP3	3567 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SELENBP1-208	ENST00000447402	DMXL2	Q8TDJ6	3036 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SELENBP1-208	ENST00000447402	BLACE	A4D250	179 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZNF891	A8MT65	544 aa	Predicted RBP	12.87	□□□□□ -0.35
SELENBP1-208	ENST00000447402	ERAL1	O75616	437 aa	Known RBP	12.87	□□□□□ -0.35
SELENBP1-208	ENST00000447402	IGHE	P01854	428 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SELENBP1-208	ENST00000447402	PRR35	P0CG20	571 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SELENBP1-208	ENST00000447402	G6PD	P11413	515 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SELENBP1-208	ENST00000447402	PRPS2	P11908	318 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SELENBP1-208	ENST00000447402	DRD2	P14416	443 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SELENBP1-208	ENST00000447402	ALOX15	P16050	662 aa	Predicted RBP	12.87	□□□□□ -0.35
SELENBP1-208	ENST00000447402	MMP11	P24347	488 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SELENBP1-208	ENST00000447402	GSTM5	P46439	218 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SELENBP1-208	ENST00000447402	EFNA3	P52797	238 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SELENBP1-208	ENST00000447402	DIO3	P55073	304 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SELENBP1-208	ENST00000447402	FOLH1	Q04609	750 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SELENBP1-208	ENST00000447402	TLE3	Q04726	772 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SELENBP1-208	ENST00000447402	ACTN3	Q08043	901 aa	Predicted RBP	12.87	□□□□□ -0.35
SELENBP1-208	ENST00000447402	SMU1	Q2TAY7	513 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SELENBP1-208	ENST00000447402	LSM12	Q3MHD2	195 aa	Known RBP	12.87	□□□□□ -0.35
SELENBP1-208	ENST00000447402	ATP1A1-AS1	Q5TC04	95 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SELENBP1-208	ENST00000447402	OR52E8	Q6IFG1	317 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SELENBP1-208	ENST00000447402	LANCL3	Q6ZV70	420 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SELENBP1-208	ENST00000447402	SPATA19	Q7Z5L4	167 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SELENBP1-208	ENST00000447402	RAB43	Q86YS6	212 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SELENBP1-208	ENST00000447402	KDF1	Q8NAX2	398 aa	Predicted RBP	12.87	□□□□□ -0.35
SELENBP1-208	ENST00000447402	PLPP5	Q8NEB5	264 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SELENBP1-208	ENST00000447402	C8orf44	Q96CB5	159 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SELENBP1-208	ENST00000447402	MAEL	Q96JY0	434 aa	Known RBP	12.87	□□□□□ -0.35
SELENBP1-208	ENST00000447402	FCRL1	Q96LA6	429 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SELENBP1-208	ENST00000447402	ALOXE3	Q9BYJ1	711 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SELENBP1-208	ENST00000447402	CPNE5	Q9HCH3	593 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SELENBP1-208	ENST00000447402	MYNN	Q9NPC7	610 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SELENBP1-208	ENST00000447402	MIEF1	Q9NQG6	463 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SELENBP1-208	ENST00000447402	HEY2	Q9UBP5	337 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SELENBP1-208	ENST00000447402	PSME2	Q9UL46	239 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SELENBP1-208	ENST00000447402	MMACHC	Q9Y4U1	282 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SELENBP1-208	ENST00000447402	PCDHA9	Q9Y5H5	950 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SELENBP1-208	ENST00000447402	GMNC	A6NCL1	334 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SELENBP1-208	ENST00000447402		E9PBE3	544 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SELENBP1-208	ENST00000447402	FGF17	O60258	216 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SELENBP1-208	ENST00000447402	KLHL41	O60662	606 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SELENBP1-208	ENST00000447402	IFNA16	P05015	189 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SELENBP1-208	ENST00000447402	PIK3R1	P27986	724 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SELENBP1-208	ENST00000447402	PPP2R1B	P30154	601 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SELENBP1-208	ENST00000447402	ASMT	P46597	345 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SELENBP1-208	ENST00000447402	NME5	P56597	212 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SELENBP1-208	ENST00000447402	PTGR1	Q14914	329 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SELENBP1-208	ENST00000447402	RPS6KA2	Q15349	733 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SELENBP1-208	ENST00000447402	TMEM198	Q66K66	360 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SELENBP1-208	ENST00000447402	FAM71E1	Q6IPT2	247 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SELENBP1-208	ENST00000447402	FAM180B	Q6P0A1	224 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SELENBP1-208	ENST00000447402	CPLX4	Q7Z7G2	160 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SELENBP1-208	ENST00000447402	PARP9	Q8IXQ6	854 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SELENBP1-208	ENST00000447402	OR4K14	Q8NGD5	310 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SELENBP1-208	ENST00000447402	DNAJB14	Q8TBM8	379 aa		12.86	□□□□□ -0.35

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.3 ms