RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445369.2

CLDN9-201, Transcript of claudin 9, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene CLDN9, Length 2,050 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9-201ENST00000445369 GDE1Q9NZC3 331 aa16.95■□□□□ 0.3
CLDN9-201ENST00000445369 SELENONQ9NZV5 590 aa16.95■□□□□ 0.3
CLDN9-201ENST00000445369 C5AR2Q9P296 337 aa16.95■□□□□ 0.3
CLDN9-201ENST00000445369 ADAM29Q9UKF5 820 aa16.95■□□□□ 0.3
CLDN9-201ENST00000445369 WDR37Q9Y2I8 494 aa16.95■□□□□ 0.3
CLDN9-201ENST00000445369 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa16.95■□□□□ 0.3
CLDN9-201ENST00000445369 GPR89AB7ZAQ6 455 aa16.94■□□□□ 0.3
CLDN9-201ENST00000445369 CBFA2T3O75081 653 aa16.94■□□□□ 0.3
CLDN9-201ENST00000445369 GPR89BP0CG08 455 aa16.94■□□□□ 0.3
CLDN9-201ENST00000445369 DDX5P17844 614 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
CLDN9-201ENST00000445369 DMPKQ09013 629 aa16.94■□□□□ 0.3
CLDN9-201ENST00000445369 HSPB3Q12988 150 aa16.94■□□□□ 0.3
CLDN9-201ENST00000445369 CST6Q15828 149 aa16.94■□□□□ 0.3
CLDN9-201ENST00000445369 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP16.94■□□□□ 0.3
CLDN9-201ENST00000445369 UBE3DQ7Z6J8 389 aa16.94■□□□□ 0.3
CLDN9-201ENST00000445369 C7orf61Q8IZ16 206 aa16.94■□□□□ 0.3
CLDN9-201ENST00000445369 CENPSQ8N2Z9 138 aa16.94■□□□□ 0.3
CLDN9-201ENST00000445369 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa16.94■□□□□ 0.3
CLDN9-201ENST00000445369 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
CLDN9-201ENST00000445369 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
CLDN9-201ENST00000445369 SLC38A4Q969I6 547 aa16.94■□□□□ 0.3
CLDN9-201ENST00000445369 RGMAQ96B86 450 aa16.94■□□□□ 0.3
CLDN9-201ENST00000445369 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
CLDN9-201ENST00000445369 WDR26Q9H7D7 661 aa16.94■□□□□ 0.3
CLDN9-201ENST00000445369 HMG20AQ9NP66 347 aa16.94■□□□□ 0.3
CLDN9-201ENST00000445369 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP16.94■□□□□ 0.3
CLDN9-201ENST00000445369 ACSL5Q9ULC5 683 aa16.94■□□□□ 0.3
CLDN9-201ENST00000445369 OR1A2Q9Y585 309 aa16.94■□□□□ 0.3
CLDN9-201ENST00000445369 C5orf58C9J3I9 102 aa16.93■□□□□ 0.3
CLDN9-201ENST00000445369 M0R082 166 aa16.93■□□□□ 0.3
CLDN9-201ENST00000445369 TOR1BO14657 336 aa16.93■□□□□ 0.3
CLDN9-201ENST00000445369 NADKO95544 446 aaPredicted RBP16.93■□□□□ 0.3
CLDN9-201ENST00000445369 CA3P07451 260 aa16.93■□□□□ 0.3
CLDN9-201ENST00000445369 TEAD1P28347 426 aa16.93■□□□□ 0.3
CLDN9-201ENST00000445369 GRK3P35626 688 aa16.93■□□□□ 0.3
CLDN9-201ENST00000445369 LIPAP38571 399 aa16.93■□□□□ 0.3
CLDN9-201ENST00000445369 LIM2P55344 173 aa16.93■□□□□ 0.3
CLDN9-201ENST00000445369 CSNK1G2P78368 415 aa16.93■□□□□ 0.3
CLDN9-201ENST00000445369 IRF4Q15306 451 aa16.93■□□□□ 0.3
CLDN9-201ENST00000445369 MAPK11Q15759 364 aa16.93■□□□□ 0.3
CLDN9-201ENST00000445369 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP16.93■□□□□ 0.3
CLDN9-201ENST00000445369 DUSP6Q16828 381 aa16.93■□□□□ 0.3
CLDN9-201ENST00000445369 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP16.93■□□□□ 0.3
CLDN9-201ENST00000445369 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa16.93■□□□□ 0.3
CLDN9-201ENST00000445369 AQP11Q8NBQ7 271 aa16.93■□□□□ 0.3
CLDN9-201ENST00000445369 GPR32P1Q8NGA4 272 aa16.93■□□□□ 0.3
CLDN9-201ENST00000445369 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP16.93■□□□□ 0.3
CLDN9-201ENST00000445369 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP16.93■□□□□ 0.3
CLDN9-201ENST00000445369 ALPK1Q96QP1 1244 aa16.93■□□□□ 0.3
CLDN9-201ENST00000445369 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP16.93■□□□□ 0.3
CLDN9-201ENST00000445369 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP16.93■□□□□ 0.3
CLDN9-201ENST00000445369 AMBNQ9NP70 447 aa16.93■□□□□ 0.3
CLDN9-201ENST00000445369 SERGEFQ9UGK8 458 aa16.93■□□□□ 0.3
CLDN9-201ENST00000445369 ENOPH1Q9UHY7 261 aa16.93■□□□□ 0.3
CLDN9-201ENST00000445369 STON1Q9Y6Q2 735 aa16.93■□□□□ 0.3
CLDN9-201ENST00000445369 FFAR1O14842 300 aa16.93■□□□□ 0.3
CLDN9-201ENST00000445369 OR1F1O43749 312 aa16.93■□□□□ 0.3
CLDN9-201ENST00000445369 MFN2O95140 757 aa16.93■□□□□ 0.3
CLDN9-201ENST00000445369 POU2F1P14859 743 aa16.93■□□□□ 0.3
CLDN9-201ENST00000445369 TRIM23P36406 574 aa16.93■□□□□ 0.3
CLDN9-201ENST00000445369 SERPINB10P48595 397 aa16.93■□□□□ 0.3
CLDN9-201ENST00000445369 NUDT6P53370 316 aa16.93■□□□□ 0.3
CLDN9-201ENST00000445369 C6orf120Q7Z4R8 191 aa16.93■□□□□ 0.3
CLDN9-201ENST00000445369 BTLAQ7Z6A9 289 aa16.93■□□□□ 0.3
CLDN9-201ENST00000445369 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa16.93■□□□□ 0.3
CLDN9-201ENST00000445369 ZNF554Q86TJ5 538 aa16.93■□□□□ 0.3
CLDN9-201ENST00000445369 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa16.93■□□□□ 0.3
CLDN9-201ENST00000445369 PSMA8Q8TAA3 256 aa16.93■□□□□ 0.3
CLDN9-201ENST00000445369 S100ZQ8WXG8 99 aa16.93■□□□□ 0.3
CLDN9-201ENST00000445369 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP16.93■□□□□ 0.3
CLDN9-201ENST00000445369 LGALS12Q96DT0 336 aa16.93■□□□□ 0.3
CLDN9-201ENST00000445369 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP16.93■□□□□ 0.3
CLDN9-201ENST00000445369 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP16.93■□□□□ 0.3
CLDN9-201ENST00000445369 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP16.93■□□□□ 0.3
CLDN9-201ENST00000445369 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP16.93■□□□□ 0.3
CLDN9-201ENST00000445369 FBXO8Q9NRD0 319 aa16.93■□□□□ 0.3
CLDN9-201ENST00000445369 RHCGQ9UBD6 479 aa16.93■□□□□ 0.3
CLDN9-201ENST00000445369 FTSJ1Q9UET6 329 aa16.93■□□□□ 0.3
CLDN9-201ENST00000445369 NINQ8N4C6 2090 aa16.93■□□□□ 0.3
CLDN9-201ENST00000445369 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa16.92■□□□□ 0.3
CLDN9-201ENST00000445369 GRXCR1A8MXD5 290 aa16.92■□□□□ 0.3
CLDN9-201ENST00000445369 HMGN4O00479 90 aa16.92■□□□□ 0.3
CLDN9-201ENST00000445369 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
CLDN9-201ENST00000445369 FUCA1P04066 466 aa16.92■□□□□ 0.3
CLDN9-201ENST00000445369 ACP5P13686 325 aa16.92■□□□□ 0.3
CLDN9-201ENST00000445369 WASP42768 502 aa16.92■□□□□ 0.3
CLDN9-201ENST00000445369 ENPP2Q13822 863 aa16.92■□□□□ 0.3
CLDN9-201ENST00000445369 FGL2Q14314 439 aa16.92■□□□□ 0.3
CLDN9-201ENST00000445369 COLEC12Q5KU26 742 aa16.92■□□□□ 0.3
CLDN9-201ENST00000445369 KLHL17Q6TDP4 642 aa16.92■□□□□ 0.3
CLDN9-201ENST00000445369 AMER3Q8N944 861 aa16.92■□□□□ 0.3
CLDN9-201ENST00000445369 DOCK8Q8NF50 2099 aa16.92■□□□□ 0.3
CLDN9-201ENST00000445369 CREB3L4Q8TEY5 395 aa16.92■□□□□ 0.3
CLDN9-201ENST00000445369 C12orf66Q96MD2 445 aa16.92■□□□□ 0.3
CLDN9-201ENST00000445369 FERD3LQ96RJ6 166 aa16.92■□□□□ 0.3
CLDN9-201ENST00000445369 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa16.92■□□□□ 0.3
CLDN9-201ENST00000445369 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP16.92■□□□□ 0.3
CLDN9-201ENST00000445369 IMPAD1Q9NX62 359 aa16.92■□□□□ 0.3
CLDN9-201ENST00000445369 GPR83Q9NYM4 423 aa16.92■□□□□ 0.3
CLDN9-201ENST00000445369 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.7 ms