RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428120.5

FAAP20-209, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene FAAP20, Length 2,313 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-209ENST00000428120 A0A1W2PS29 197 aa21.99■■□□□ 1.11
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FAAP20-209ENST00000428120 TAF8Q7Z7C8 310 aa21.99■■□□□ 1.11
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF687Q8N1G0 1237 aa21.99■■□□□ 1.11
FAAP20-209ENST00000428120 SLC22A18Q96BI1 424 aa21.99■■□□□ 1.11
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FAAP20-209ENST00000428120 SLC6A18Q96N87 628 aa21.99■■□□□ 1.11
FAAP20-209ENST00000428120 GLIPR2Q9H4G4 154 aa21.99■■□□□ 1.11
FAAP20-209ENST00000428120 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa21.99■■□□□ 1.11
FAAP20-209ENST00000428120 A0A0J9YVX5 310 aa21.98■■□□□ 1.11
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FAAP20-209ENST00000428120 AIFM1O95831 613 aa21.98■■□□□ 1.11
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FAAP20-209ENST00000428120 IL1RL1Q01638 556 aa21.98■■□□□ 1.11
FAAP20-209ENST00000428120 KIR2DS3Q14952 304 aa21.98■■□□□ 1.11
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FAAP20-209ENST00000428120 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
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FAAP20-209ENST00000428120 ACTR10Q9NZ32 417 aa21.98■■□□□ 1.11
FAAP20-209ENST00000428120 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
FAAP20-209ENST00000428120 C8orf89P0DMQ9 161 aa21.98■■□□□ 1.11
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FAAP20-209ENST00000428120 GSTM5P46439 218 aa21.98■■□□□ 1.11
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FAAP20-209ENST00000428120 FBXO42Q6P3S6 717 aa21.98■■□□□ 1.11
FAAP20-209ENST00000428120 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
FAAP20-209ENST00000428120 CYP4Z1Q86W10 505 aa21.98■■□□□ 1.11
FAAP20-209ENST00000428120 SLC37A2Q8TED4 501 aa21.98■■□□□ 1.11
FAAP20-209ENST00000428120 AMDHD1Q96NU7 426 aa21.98■■□□□ 1.11
FAAP20-209ENST00000428120 GSDMCQ9BYG8 508 aa21.98■■□□□ 1.11
FAAP20-209ENST00000428120 RUBCNLQ9H714 662 aa21.98■■□□□ 1.11
FAAP20-209ENST00000428120 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
FAAP20-209ENST00000428120 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
FAAP20-209ENST00000428120 RAB23Q9ULC3 237 aa21.98■■□□□ 1.11
FAAP20-209ENST00000428120 SDK1Q7Z5N4 2213 aa21.98■■□□□ 1.11
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FAAP20-209ENST00000428120 GPC1P35052 558 aa21.97■■□□□ 1.11
FAAP20-209ENST00000428120 CCT3P49368 545 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
FAAP20-209ENST00000428120 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
FAAP20-209ENST00000428120 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
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FAAP20-209ENST00000428120 FOXQ1Q9C009 403 aa21.97■■□□□ 1.11
FAAP20-209ENST00000428120 REEP1Q9H902 201 aa21.97■■□□□ 1.11
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FAAP20-209ENST00000428120 COL6A3P12111 3177 aa21.97■■□□□ 1.11
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FAAP20-209ENST00000428120 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa21.97■■□□□ 1.11
FAAP20-209ENST00000428120 SLC38A5Q8WUX1 472 aa21.97■■□□□ 1.11
FAAP20-209ENST00000428120 RDH12Q96NR8 316 aa21.97■■□□□ 1.11
FAAP20-209ENST00000428120 BBS4Q96RK4 519 aa21.97■■□□□ 1.11
FAAP20-209ENST00000428120 ORAI3Q9BRQ5 295 aa21.97■■□□□ 1.11
FAAP20-209ENST00000428120 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
FAAP20-209ENST00000428120 TAS2R7Q9NYW3 318 aa21.97■■□□□ 1.11
FAAP20-209ENST00000428120 DMTF1Q9Y222 760 aa21.97■■□□□ 1.11
FAAP20-209ENST00000428120 TMEM265A0A087WTH1 108 aa21.96■■□□□ 1.11
FAAP20-209ENST00000428120 A0A1W2PPC4 97 aa21.96■■□□□ 1.11
FAAP20-209ENST00000428120 OR2A25A4D2G3 310 aa21.96■■□□□ 1.11
FAAP20-209ENST00000428120 P2RX6O15547 441 aa21.96■■□□□ 1.11
FAAP20-209ENST00000428120 IGFBP5P24593 272 aa21.96■■□□□ 1.11
FAAP20-209ENST00000428120 NR1H2P55055 460 aa21.96■■□□□ 1.11
FAAP20-209ENST00000428120 DUSP2Q05923 314 aa21.96■■□□□ 1.11
FAAP20-209ENST00000428120 FCRL6Q6DN72 434 aa21.96■■□□□ 1.11
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF555Q8NEP9 628 aa21.96■■□□□ 1.11
FAAP20-209ENST00000428120 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
FAAP20-209ENST00000428120 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa21.96■■□□□ 1.11
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FAAP20-209ENST00000428120 SERHL2Q9H4I8 314 aa21.96■■□□□ 1.11
FAAP20-209ENST00000428120 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
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FAAP20-209ENST00000428120 ANGPT4Q9Y264 503 aa21.96■■□□□ 1.11
FAAP20-209ENST00000428120 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa21.96■■□□□ 1.11
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FAAP20-209ENST00000428120 CYP4B1P13584 511 aa21.96■■□□□ 1.11
FAAP20-209ENST00000428120 CTSEP14091 401 aa21.96■■□□□ 1.11
FAAP20-209ENST00000428120 ETS2P15036 469 aa21.96■■□□□ 1.11
FAAP20-209ENST00000428120 RRM2P31350 389 aa21.96■■□□□ 1.11
FAAP20-209ENST00000428120 FEN1P39748 380 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
FAAP20-209ENST00000428120 DAPP51397 102 aa21.96■■□□□ 1.11
FAAP20-209ENST00000428120 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
FAAP20-209ENST00000428120 CNPY1Q3B7I2 92 aa21.96■■□□□ 1.11
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