RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417536.5

SH3BP1-202, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP17.81■□□□□ 0.44
SH3BP1-202ENST00000417536 LRIT3Q3SXY7 679 aa17.81■□□□□ 0.44
SH3BP1-202ENST00000417536 GDPD3Q7L5L3 318 aa17.81■□□□□ 0.44
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP17.81■□□□□ 0.44
SH3BP1-202ENST00000417536 PSD4Q8NDX1 1056 aa17.81■□□□□ 0.44
SH3BP1-202ENST00000417536 SIAEQ9HAT2 523 aa17.81■□□□□ 0.44
SH3BP1-202ENST00000417536 C14orf119Q9NWQ9 140 aa17.81■□□□□ 0.44
SH3BP1-202ENST00000417536 EHD3Q9NZN3 535 aa17.81■□□□□ 0.44
SH3BP1-202ENST00000417536 GULP1Q9UBP9 304 aa17.81■□□□□ 0.44
SH3BP1-202ENST00000417536 WASH3PC4AMC7 463 aa17.81■□□□□ 0.44
SH3BP1-202ENST00000417536 ARHGAP33O14559 1287 aa17.81■□□□□ 0.44
SH3BP1-202ENST00000417536 KLHL18O94889 574 aa17.81■□□□□ 0.44
SH3BP1-202ENST00000417536 IFNA14P01570 189 aa17.81■□□□□ 0.44
SH3BP1-202ENST00000417536 IL3P08700 152 aa17.81■□□□□ 0.44
SH3BP1-202ENST00000417536 FEN1P39748 380 aaKnown RBP17.81■□□□□ 0.44
SH3BP1-202ENST00000417536 CRISP1P54107 249 aa17.81■□□□□ 0.44
SH3BP1-202ENST00000417536 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP17.81■□□□□ 0.44
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM71E1Q6IPT2 247 aa17.81■□□□□ 0.44
SH3BP1-202ENST00000417536 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa17.81■□□□□ 0.44
SH3BP1-202ENST00000417536 CLN6Q9NWW5 311 aa17.81■□□□□ 0.44
SH3BP1-202ENST00000417536 FTSJ1Q9UET6 329 aa17.81■□□□□ 0.44
SH3BP1-202ENST00000417536 ANGPT4Q9Y264 503 aa17.81■□□□□ 0.44
SH3BP1-202ENST00000417536 EFCAB10A6NFE3 127 aa17.8■□□□□ 0.44
SH3BP1-202ENST00000417536 KMOO15229 486 aa17.8■□□□□ 0.44
SH3BP1-202ENST00000417536 SSX4O60224 188 aa17.8■□□□□ 0.44
SH3BP1-202ENST00000417536 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa17.8■□□□□ 0.44
SH3BP1-202ENST00000417536 ARAFP10398 606 aa17.8■□□□□ 0.44
SH3BP1-202ENST00000417536 RPS26P62854 115 aaKnown RBP17.8■□□□□ 0.44
SH3BP1-202ENST00000417536 PDE7AQ13946 482 aa17.8■□□□□ 0.44
SH3BP1-202ENST00000417536 GRIN2CQ14957 1233 aa17.8■□□□□ 0.44
SH3BP1-202ENST00000417536 DEPDC1Q5TB30 811 aa17.8■□□□□ 0.44
SH3BP1-202ENST00000417536 FRMPD2BQ6IN97 320 aa17.8■□□□□ 0.44
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa17.8■□□□□ 0.44
SH3BP1-202ENST00000417536 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa17.8■□□□□ 0.44
SH3BP1-202ENST00000417536 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP17.8■□□□□ 0.44
SH3BP1-202ENST00000417536 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa17.8■□□□□ 0.44
SH3BP1-202ENST00000417536 CDCA4Q9BXL8 241 aa17.8■□□□□ 0.44
SH3BP1-202ENST00000417536 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP17.8■□□□□ 0.44
SH3BP1-202ENST00000417536 ERVK13-1Q9NX77 482 aa17.8■□□□□ 0.44
SH3BP1-202ENST00000417536 ZAR1LA6NP61 321 aa17.8■□□□□ 0.44
SH3BP1-202ENST00000417536 A8MVJ9 347 aa17.8■□□□□ 0.44
SH3BP1-202ENST00000417536 CCRL2O00421 344 aa17.8■□□□□ 0.44
SH3BP1-202ENST00000417536 LINC01565O15544 149 aa17.8■□□□□ 0.44
SH3BP1-202ENST00000417536 RECKO95980 971 aa17.8■□□□□ 0.44
SH3BP1-202ENST00000417536 IFNW1P05000 195 aa17.8■□□□□ 0.44
SH3BP1-202ENST00000417536 RCVRNP35243 200 aa17.8■□□□□ 0.44
SH3BP1-202ENST00000417536 HMGA2P52926 109 aa17.8■□□□□ 0.44
SH3BP1-202ENST00000417536 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP17.8■□□□□ 0.44
SH3BP1-202ENST00000417536 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP17.8■□□□□ 0.44
SH3BP1-202ENST00000417536 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa17.8■□□□□ 0.44
SH3BP1-202ENST00000417536 ATCAYQ86WG3 371 aa17.8■□□□□ 0.44
SH3BP1-202ENST00000417536 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa17.8■□□□□ 0.44
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC6A16Q9GZN6 736 aa17.8■□□□□ 0.44
SH3BP1-202ENST00000417536 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP17.8■□□□□ 0.44
SH3BP1-202ENST00000417536 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa17.79■□□□□ 0.44
SH3BP1-202ENST00000417536 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa17.79■□□□□ 0.44
SH3BP1-202ENST00000417536 SOX14O95416 240 aa17.79■□□□□ 0.44
SH3BP1-202ENST00000417536 ELFN1P0C7U0 828 aa17.79■□□□□ 0.44
SH3BP1-202ENST00000417536 RHCEP18577 417 aa17.79■□□□□ 0.44
SH3BP1-202ENST00000417536 NR4A2P43354 598 aa17.79■□□□□ 0.44
SH3BP1-202ENST00000417536 EPHA5P54756 1037 aa17.79■□□□□ 0.44
SH3BP1-202ENST00000417536 E2F2Q14209 437 aa17.79■□□□□ 0.44
SH3BP1-202ENST00000417536 SSX1Q16384 188 aa17.79■□□□□ 0.44
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP17.79■□□□□ 0.44
SH3BP1-202ENST00000417536 UTS2BQ765I0 119 aa17.79■□□□□ 0.44
SH3BP1-202ENST00000417536 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP17.79■□□□□ 0.44
SH3BP1-202ENST00000417536 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP17.79■□□□□ 0.44
SH3BP1-202ENST00000417536 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP17.79■□□□□ 0.44
SH3BP1-202ENST00000417536 CEP19Q96LK0 163 aa17.79■□□□□ 0.44
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM83CQ9BQN1 747 aa17.79■□□□□ 0.44
SH3BP1-202ENST00000417536 EFCAB11Q9BUY7 163 aa17.79■□□□□ 0.44
SH3BP1-202ENST00000417536 MYNNQ9NPC7 610 aa17.79■□□□□ 0.44
SH3BP1-202ENST00000417536 MIEF1Q9NQG6 463 aa17.79■□□□□ 0.44
SH3BP1-202ENST00000417536 PSMD11O00231 422 aa17.79■□□□□ 0.44
SH3BP1-202ENST00000417536 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP17.79■□□□□ 0.44
SH3BP1-202ENST00000417536 GPX5O75715 221 aa17.79■□□□□ 0.44
SH3BP1-202ENST00000417536 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP17.79■□□□□ 0.44
SH3BP1-202ENST00000417536 CKMT1AP12532 417 aa17.79■□□□□ 0.44
SH3BP1-202ENST00000417536 PIK3CBP42338 1070 aa17.79■□□□□ 0.44
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC6A11P48066 632 aa17.79■□□□□ 0.44
SH3BP1-202ENST00000417536 PNLIPRP1P54315 467 aa17.79■□□□□ 0.44
SH3BP1-202ENST00000417536 LIM2P55344 173 aa17.79■□□□□ 0.44
SH3BP1-202ENST00000417536 DSTNP60981 165 aa17.79■□□□□ 0.44
SH3BP1-202ENST00000417536 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP17.79■□□□□ 0.44
SH3BP1-202ENST00000417536 BCL2A1Q16548 175 aa17.79■□□□□ 0.44
SH3BP1-202ENST00000417536 PLAG1Q6DJT9 500 aa17.79■□□□□ 0.44
SH3BP1-202ENST00000417536 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa17.79■□□□□ 0.44
SH3BP1-202ENST00000417536 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa17.79■□□□□ 0.44
SH3BP1-202ENST00000417536 CFL2Q9Y281 166 aa17.79■□□□□ 0.44
SH3BP1-202ENST00000417536 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa17.79■□□□□ 0.44
SH3BP1-202ENST00000417536 FFAR1O14842 300 aa17.78■□□□□ 0.44
SH3BP1-202ENST00000417536 ENTPD6O75354 484 aa17.78■□□□□ 0.44
SH3BP1-202ENST00000417536 KRT75O95678 551 aa17.78■□□□□ 0.44
SH3BP1-202ENST00000417536 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP17.78■□□□□ 0.44
SH3BP1-202ENST00000417536 CASP3P42574 277 aa17.78■□□□□ 0.44
SH3BP1-202ENST00000417536 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa17.78■□□□□ 0.44
SH3BP1-202ENST00000417536 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa17.78■□□□□ 0.44
SH3BP1-202ENST00000417536 LAS2Q8IYD9 372 aa17.78■□□□□ 0.44
SH3BP1-202ENST00000417536 CNPPD1Q9BV87 410 aa17.78■□□□□ 0.44
SH3BP1-202ENST00000417536 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 79.3 ms