RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000414253.5

FAAP20-206, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 2

Gene FAAP20, Length 2,216 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-206ENST00000414253 GCNT6Q5T4J0 391 aa23.41■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 OR56A3Q8NH54 315 aa23.41■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 OR2A14Q96R47 310 aa23.41■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 FAM129BQ96TA1 746 aa23.41■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa23.41■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 SGK2Q9HBY8 427 aa23.41■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa23.41■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 J3KTA2 159 aa23.4■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 MPZL2O60487 215 aa23.4■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 KRT75O95678 551 aa23.4■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 POU2F1P14859 743 aa23.4■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 SLC6A11P48066 632 aa23.4■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 RBBP4Q09028 425 aa23.4■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 ZNF852Q6ZMS4 543 aa23.4■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa23.4■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 OR8H2Q8N162 312 aa23.4■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 FOPNLQ96NB1 174 aa23.4■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 SNX18Q96RF0 628 aa23.4■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 SMURF1Q9HCE7 757 aa23.4■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 DYRK4Q9NR20 520 aa23.4■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 ACER3Q9NUN7 267 aa23.4■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 RWDD3Q9Y3V2 267 aa23.4■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 PCDH17O14917 1159 aa23.4■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 SH3BGRLO75368 114 aa23.4■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 GPX5O75715 221 aa23.4■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 LIMS1P48059 325 aa23.4■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 CASP9P55211 416 aa23.4■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 PCDH1Q08174 1060 aa23.4■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 PLAG1Q6DJT9 500 aa23.4■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 LILRB4Q8NHJ6 448 aa23.4■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 EPHX3Q9H6B9 360 aa23.4■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 C5orf67F2Z3F1 127 aa23.39■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 K7ESM1 405 aa23.39■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 CCNB2O95067 398 aa23.39■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 CBLP22681 906 aa23.39■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 MAPK9P45984 424 aa23.39■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 XCR1P46094 333 aa23.39■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 HMGA2P52926 109 aa23.39■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 GPR50Q13585 617 aa23.39■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 ZNF385BQ569K4 471 aa23.39■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 SPIN4Q56A73 249 aa23.39■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 PRR23CQ6ZRP0 262 aa23.39■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 NRARPQ7Z6K4 114 aa23.39■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 OR52N2Q8NGI0 321 aa23.39■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 NFKBIDQ8NI38 313 aa23.39■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa23.39■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 ARRDC3Q96B67 414 aa23.39■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 ZFYVE19Q96K21 471 aa23.39■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 PIP5K1AQ99755 562 aa23.39■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 CLN6Q9NWW5 311 aa23.39■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 ZAR1LA6NP61 321 aa23.39■■□□□ 1.33
FAAP20-206ENST00000414253 GRXCR1A8MXD5 290 aa23.39■■□□□ 1.33
FAAP20-206ENST00000414253 H3BM21 787 aa23.39■■□□□ 1.33
FAAP20-206ENST00000414253 UGT2B17O75795 530 aa23.39■■□□□ 1.33
FAAP20-206ENST00000414253 ALDH9A1P49189 494 aa23.39■■□□□ 1.33
FAAP20-206ENST00000414253 HBA1P69905 142 aa23.39■■□□□ 1.33
FAAP20-206ENST00000414253 FCHO2Q0JRZ9 810 aa23.39■■□□□ 1.33
FAAP20-206ENST00000414253 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
FAAP20-206ENST00000414253 C9orf64Q5T6V5 341 aa23.39■■□□□ 1.33
FAAP20-206ENST00000414253 ADNP2Q6IQ32 1131 aa23.39■■□□□ 1.33
FAAP20-206ENST00000414253 PTCHD4Q6ZW05 846 aa23.39■■□□□ 1.33
FAAP20-206ENST00000414253 RNF130Q86XS8 419 aa23.39■■□□□ 1.33
FAAP20-206ENST00000414253 KRT73Q86Y46 540 aa23.39■■□□□ 1.33
FAAP20-206ENST00000414253 FTSJ1Q9UET6 329 aa23.39■■□□□ 1.33
FAAP20-206ENST00000414253 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa23.38■■□□□ 1.33
FAAP20-206ENST00000414253 REV3LO60673 3130 aa23.38■■□□□ 1.33
FAAP20-206ENST00000414253 CHMP24386 653 aa23.38■■□□□ 1.33
FAAP20-206ENST00000414253 ITGB7P26010 798 aa23.38■■□□□ 1.33
FAAP20-206ENST00000414253 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP23.38■■□□□ 1.33
FAAP20-206ENST00000414253 DOC2BQ14184 412 aa23.38■■□□□ 1.33
FAAP20-206ENST00000414253 NXNL2Q5VZ03 156 aa23.38■■□□□ 1.33
FAAP20-206ENST00000414253 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
FAAP20-206ENST00000414253 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
FAAP20-206ENST00000414253 CXorf40BQ96DE9 158 aa23.38■■□□□ 1.33
FAAP20-206ENST00000414253 SLC35A5Q9BS91 424 aa23.38■■□□□ 1.33
FAAP20-206ENST00000414253 TMEM38AQ9H6F2 299 aa23.38■■□□□ 1.33
FAAP20-206ENST00000414253 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
FAAP20-206ENST00000414253 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
FAAP20-206ENST00000414253 LILRB5O75023 590 aa23.37■■□□□ 1.33
FAAP20-206ENST00000414253 PIPP12273 146 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
FAAP20-206ENST00000414253 CYP27C1Q4G0S4 372 aa23.37■■□□□ 1.33
FAAP20-206ENST00000414253 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
FAAP20-206ENST00000414253 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa23.37■■□□□ 1.33
FAAP20-206ENST00000414253 CFAP206Q8IYR0 622 aa23.37■■□□□ 1.33
FAAP20-206ENST00000414253 GPR156Q8NFN8 814 aa23.37■■□□□ 1.33
FAAP20-206ENST00000414253 OPALINQ96PE5 141 aa23.37■■□□□ 1.33
FAAP20-206ENST00000414253 ASPNQ9BXN1 380 aa23.37■■□□□ 1.33
FAAP20-206ENST00000414253 OR2AG1Q9H205 316 aa23.37■■□□□ 1.33
FAAP20-206ENST00000414253 ATP6V1HQ9UI12 483 aa23.37■■□□□ 1.33
FAAP20-206ENST00000414253 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa23.37■■□□□ 1.33
FAAP20-206ENST00000414253 MFN2O95140 757 aa23.37■■□□□ 1.33
FAAP20-206ENST00000414253 GADD45GO95257 159 aa23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.8 ms