RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409985.5

PMS1-205, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

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Gene PMS1, Length 1,882 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-205ENST00000409985 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.22
PMS1-205ENST00000409985 ITPKCQ96DU7 683 aa22.64■■□□□ 1.22
PMS1-205ENST00000409985 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa22.64■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 TRBC2A0A5B9 178 aa22.64■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 GPR89AB7ZAQ6 455 aa22.64■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa22.64■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 PRAMEF10O60809 474 aa22.64■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 GPR89BP0CG08 455 aa22.64■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 CTSKP43235 329 aa22.64■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 OR1E2P47887 323 aa22.64■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 CDC42P60953 191 aa22.64■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 NCS1P62166 190 aa22.64■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 MLC1Q15049 377 aa22.64■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 GAB4Q2WGN9 574 aa22.64■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 TRIM16LQ309B1 348 aa22.64■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 FAM78AQ5JUQ0 283 aa22.64■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa22.64■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa22.64■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 ZNF740Q8NDX6 193 aa22.64■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 OR5K2Q8NHB8 316 aa22.64■■□□□ 1.21
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PMS1-205ENST00000409985 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa22.64■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 RLIMQ9NVW2 624 aa22.64■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 EFCAB10A6NFE3 127 aa22.63■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 M0R082 166 aa22.63■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 PLPP1O14494 284 aa22.63■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 CD40LGP29965 261 aa22.63■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
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PMS1-205ENST00000409985 ZBTB46Q86UZ6 589 aa22.63■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 CCDC103Q8IW40 242 aa22.63■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 RNF217Q8TC41 542 aa22.63■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 TM4SF18Q96CE8 201 aa22.63■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 RIPOR3Q96MK2 946 aa22.63■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 ASB16Q96NS5 453 aa22.63■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 CXorf36Q9H7Y0 433 aa22.63■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 IMPAD1Q9NX62 359 aa22.63■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 ACSL6Q9UKU0 697 aa22.63■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 FCARP24071 287 aa22.62■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 SOAT1P35610 550 aa22.62■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 BSGP35613 385 aa22.62■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 SLC19A1P41440 591 aa22.62■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 VIPR2P41587 438 aa22.62■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 ALDH9A1P49189 494 aa22.62■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 REEP5Q00765 189 aa22.62■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 ATP1A4Q13733 1029 aa22.62■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 INAQ16352 499 aa22.62■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 TIGD6Q17RP2 521 aa22.62■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 COLEC12Q5KU26 742 aa22.62■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 IER5LQ5T953 404 aa22.62■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 METRNLQ641Q3 311 aa22.62■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 USP43Q70EL4 1123 aa22.62■■□□□ 1.21
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PMS1-205ENST00000409985 KLK4Q9Y5K2 254 aa22.62■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 ZAR1LA6NP61 321 aa22.62■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 AIREO43918 545 aa22.62■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 TNFRSF1BP20333 461 aa22.62■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 CDH3P22223 829 aa22.62■■□□□ 1.21
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PMS1-205ENST00000409985 MAPK12P53778 367 aa22.62■■□□□ 1.21
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PMS1-205ENST00000409985 TAS2R7Q9NYW3 318 aa22.62■■□□□ 1.21
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PMS1-205ENST00000409985 PNCKQ6P2M8 343 aa22.61■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 LACC1Q8IV20 430 aa22.61■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 OR52J3Q8NH60 311 aa22.61■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 OR5AK3PQ8NH89 298 aa22.61■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 ZNF675Q8TD23 568 aa22.61■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 DCSTAMPQ9H295 470 aa22.61■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
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