RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000407997.3

APOBEC3G-201, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3G, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene APOBEC3G, Length 1,834 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3G-201ENST00000407997 UGT2B10P36537 528 aa9.52□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 GNPDA1P46926 289 aa9.52□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 METAP1P53582 386 aa9.52□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 KCNK10P57789 538 aa9.52□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 NXPH1P58417 271 aa9.52□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 ABATP80404 500 aa9.52□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 ZNF45Q02386 682 aa9.52□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 IRF8Q02556 426 aa9.52□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 CHRNB3Q05901 458 aa9.52□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 E2F2Q14209 437 aa9.52□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 PTCHD3Q3KNS1 767 aa9.52□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 VPS26BQ4G0F5 336 aa9.52□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 XKR7Q5GH72 579 aa9.52□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 SYVN1Q86TM6 617 aa9.52□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 TTLQ8NG68 377 aa9.52□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 OR4F6Q8NGB9 312 aa9.52□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 ANGPTL6Q8NI99 470 aa9.52□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 FAR1Q8WVX9 515 aa9.52□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 TMBIM1Q969X1 311 aa9.52□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 WDR34Q96EX3 536 aa9.52□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 CCDC115Q96NT0 180 aa9.52□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 BTBD2Q9BX70 525 aa9.52□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 UGT2B28Q9BY64 529 aa9.52□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 TOR3AQ9H497 397 aa9.52□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 SATB2Q9UPW6 733 aa9.52□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa9.52□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 TRPM6Q9BX84 2022 aa9.52□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 NOTOA8MTQ0 251 aa9.52□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 ARHGEF33A8MVX0 844 aa9.52□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 H0YIV9 168 aa9.52□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 PIP5K1BO14986 540 aa9.52□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 B4GAT1O43505 415 aa9.52□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 MAN1A2O60476 641 aa9.52□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 PRMT3O60678 531 aa9.52□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 OR4F21O95013 312 aa9.52□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 SNX4O95219 450 aa9.52□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 KRT8P05787 483 aa9.52□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 CAPN1P07384 714 aa9.52□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 ANXA6P08133 673 aa9.52□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 PRR35P0CG20 571 aa9.52□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 ITGAMP11215 1152 aa9.52□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 IL7RP16871 459 aa9.52□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 CA5AP35218 305 aa9.52□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 RPL3P39023 403 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 ST13P50502 369 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 PGGT1BP53609 377 aa9.52□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 DEFA1P59665 94 aa9.52□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 DEFA3P59666 94 aa9.52□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 PFN3P60673 137 aa9.52□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 PPP2R2BQ00005 443 aa9.52□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 TRAF3Q13114 568 aa9.52□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 DPY19L1Q2PZI1 675 aa9.52□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 ADPRMQ3LIE5 342 aa9.52□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 PYCR3Q53H96 274 aa9.52□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 CCDC157Q569K6 752 aa9.52□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 MFSD4BQ5TF39 518 aa9.52□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 ZNF691Q5VV52 312 aa9.52□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 GRHL2Q6ISB3 625 aa9.52□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 TBPL2Q6SJ96 375 aa9.52□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 C11orf96Q7Z7L8 435 aa9.52□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 PEX5LQ8IYB4 626 aa9.52□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 SYTL1Q8IYJ3 562 aa9.52□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa9.52□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 DPP10Q8N608 796 aa9.52□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 SMPDL3AQ92484 453 aa9.52□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 USP7Q93009 1102 aa9.52□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 DGCR6LQ9BY27 220 aa9.52□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 GSDMCQ9BYG8 508 aa9.52□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 BRINP2Q9C0B6 783 aa9.52□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 NT5DC2Q9H857 520 aa9.52□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa9.52□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 AHSPQ9NZD4 102 aa9.52□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 OSGIN1Q9UJX0 560 aa9.52□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 RAXQ9Y2V3 346 aa9.52□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 TPRKBQ9Y3C4 175 aa9.52□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 PKD1L2Q7Z442 2459 aa9.51□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 PRSS38A1L453 326 aa9.51□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 CCDC154A6NI56 674 aa9.51□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 K7ESM1 405 aa9.51□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 PLK4O00444 970 aa9.51□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 OR7A17O14581 309 aa9.51□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 ALX3O95076 343 aa9.51□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 RASGRP1O95267 797 aa9.51□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 WNT1P04628 370 aa9.51□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 CEACAM5P06731 702 aa9.51□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 TRAPPC2P0DI81 140 aa9.51□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 TRAPPC2BP0DI82 140 aa9.51□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 ERGP11308 486 aa9.51□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 IGFALSP35858 605 aa9.51□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 TRPC1P48995 793 aa9.51□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 75.6 ms