RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403441.1

PRAME-204, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene PRAME, Length 567 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-204ENST00000403441 FAM153CQ494X1 144 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 SULT1C3Q6IMI6 304 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 NXPE4Q6UWF7 544 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 GK5Q6ZS86 529 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 SLC22A16Q86VW1 577 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 SCUBE1Q8IWY4 988 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 MYRIPQ8NFW9 859 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 TTLQ8NG68 377 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 STAG3L4Q8TBR4 150 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 CREB3L4Q8TEY5 395 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 GAL3ST3Q96A11 431 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 NXNL1Q96CM4 212 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 EGFL8Q99944 293 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 RHOXF2Q9BQY4 288 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 DEFB127Q9H1M4 99 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 ADAP2Q9NPF8 381 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 NUDT4Q9NZJ9 180 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 HRH3Q9Y5N1 445 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 A0A096LPK6 155 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 OR14I1A6ND48 311 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 C4orf51C9J302 202 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 NPIPA2E9PIF3 369 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 NPIPA3F8WFD2 350 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 BCKDKO14874 412 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 ERI3O43414 337 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 B3GALT2O43825 422 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 WDR47O94967 919 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 KLHL2O95198 593 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 SMIM10L1P0DMW3 83 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 GNAZP19086 355 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 ACVR2AP27037 513 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 GSTM2P28161 218 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 CASP2P42575 452 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 NUP107P57740 925 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 ACAP2Q15057 778 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 ADGRD1Q6QNK2 874 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 RAPH1Q70E73 1250 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP11.46□□□□□ -0.575e-7■■■□□ 17.6
PRAME-204ENST00000403441 ZNF595Q8IYB9 648 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 RPRMLQ8N4K4 120 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 FAM47BQ8NA70 645 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 OR2M7Q8NG81 312 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 KCTD4Q8WVF5 259 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP11.46□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 CCT6BQ92526 530 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 SMIM10Q96HG1 83 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 CAPS2Q9BXY5 557 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 CD244Q9BZW8 370 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 ALG9Q9H6U8 611 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 NT5DC2Q9H857 520 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 DEPPQ9NTK1 212 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 MYOTQ9UBF9 498 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 RNF112Q9ULX5 631 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 HCFC1P51610 2035 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 STK16O75716 305 aa11.45□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 OR6B1O95007 311 aa11.45□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 NADKO95544 446 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 IFNA16P05015 189 aa11.45□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 INHBAP08476 426 aa11.45□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa11.45□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 COL6A2P12110 1019 aa11.45□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 PPP2R1BP30154 601 aa11.45□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 RAB38P57729 211 aa11.45□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 RCN2Q14257 317 aa11.45□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 TBCCQ15814 346 aa11.45□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 FAM83EQ2M2I3 478 aa11.45□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 TECRLQ5HYJ1 363 aa11.45□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 EMC4Q5J8M3 183 aa11.45□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 IL20RBQ6UXL0 311 aa11.45□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa11.45□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 HSDL2Q6YN16 418 aa11.45□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 TIFABQ6ZNK6 161 aa11.45□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 RTL4Q6ZR62 310 aa11.45□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa11.45□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa11.45□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 OR5M9Q8NGP3 310 aa11.45□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 SMC6Q96SB8 1091 aa11.45□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 FAM173AQ9BQD7 235 aa11.45□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 TTTY12Q9BZ98 90 aa11.45□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 AICDAQ9GZX7 198 aa11.45□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.9 ms