RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000397396.5

TSPAN4-202, Transcript of tetraspanin 4, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TSPAN4, Length 1,332 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN4-202ENST00000397396 SLC52A3Q9NQ40 469 aa22.23■■□□□ 1.15
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TSPAN4-202ENST00000397396 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa22.23■■□□□ 1.15
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TSPAN4-202ENST00000397396 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
TSPAN4-202ENST00000397396 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
TSPAN4-202ENST00000397396 SPTBP11277 2137 aa22.19■■□□□ 1.14
TSPAN4-202ENST00000397396 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa22.18■■□□□ 1.14
TSPAN4-202ENST00000397396 GLOD5A6NK44 160 aa22.18■■□□□ 1.14
TSPAN4-202ENST00000397396 C9J4A7 227 aa22.18■■□□□ 1.14
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