RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394202.8

CNN3-202, Transcript of calponin 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CNN3, Length 1,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3-202ENST00000394202 DHRS13Q6UX07 377 aa21.96■■□□□ 1.11
CNN3-202ENST00000394202 HACD2Q6Y1H2 254 aa21.96■■□□□ 1.11
CNN3-202ENST00000394202 DHDDSQ86SQ9 333 aa21.96■■□□□ 1.11
CNN3-202ENST00000394202 AGBL5Q8NDL9 886 aa21.96■■□□□ 1.11
CNN3-202ENST00000394202 DNAJB14Q8TBM8 379 aa21.96■■□□□ 1.11
CNN3-202ENST00000394202 ROPN1LQ96C74 230 aa21.96■■□□□ 1.11
CNN3-202ENST00000394202 NDC1Q9BTX1 674 aa21.96■■□□□ 1.11
CNN3-202ENST00000394202 THTPAQ9BU02 230 aa21.96■■□□□ 1.11
CNN3-202ENST00000394202 RBCK1Q9BYM8 510 aa21.96■■□□□ 1.11
CNN3-202ENST00000394202 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
CNN3-202ENST00000394202 ATAD3AQ9NVI7 634 aa21.96■■□□□ 1.11
CNN3-202ENST00000394202 TAS2R7Q9NYW3 318 aa21.96■■□□□ 1.11
CNN3-202ENST00000394202 VAPAQ9P0L0 249 aa21.96■■□□□ 1.11
CNN3-202ENST00000394202 NDOR1Q9UHB4 597 aa21.96■■□□□ 1.11
CNN3-202ENST00000394202 PHF11Q9UIL8 331 aa21.96■■□□□ 1.11
CNN3-202ENST00000394202 CROTQ9UKG9 612 aa21.96■■□□□ 1.11
CNN3-202ENST00000394202 E2F1Q01094 437 aa21.96■■□□□ 1.11
CNN3-202ENST00000394202 C1orf189Q5VU69 101 aa21.96■■□□□ 1.11
CNN3-202ENST00000394202 PGAM4Q8N0Y7 254 aa21.96■■□□□ 1.11
CNN3-202ENST00000394202 ITCHQ96J02 903 aa21.96■■□□□ 1.11
CNN3-202ENST00000394202 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
CNN3-202ENST00000394202 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
CNN3-202ENST00000394202 EHD3Q9NZN3 535 aa21.96■■□□□ 1.11
CNN3-202ENST00000394202 RARRES3Q9UL19 164 aa21.96■■□□□ 1.11
CNN3-202ENST00000394202 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa21.96■■□□□ 1.11
CNN3-202ENST00000394202 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 C8orf89P0DMQ9 161 aa21.95■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 CCKBRP32239 447 aa21.95■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 DUSP2Q05923 314 aa21.95■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 CDCP2Q5VXM1 449 aa21.95■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 OR4N5Q8IXE1 308 aa21.95■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 PMEPA1Q969W9 287 aa21.95■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 CDRT15Q96T59 188 aa21.95■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 RMND5AQ9H871 391 aa21.95■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa21.95■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 CLCA2Q9UQC9 943 aa21.95■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa21.95■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 C6orf47O95873 294 aa21.94■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 SLC6A2P23975 617 aa21.94■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 PTGER1P34995 402 aa21.94■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 HBA1P69905 142 aa21.94■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 ERV3-1Q14264 604 aa21.94■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 DNAL1Q4LDG9 190 aa21.94■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 C16orf89Q6UX73 402 aa21.94■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa21.94■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 GLRX5Q86SX6 157 aa21.94■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 PEX11GQ96HA9 241 aa21.94■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 CCDC115Q96NT0 180 aa21.94■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 GID8Q9NWU2 228 aa21.94■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 MS4A12Q9NXJ0 267 aa21.94■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa21.94■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 PMS2P1A4D2B8 440 aa21.94■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 OR2W5A6NFC9 320 aa21.94■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 RFXANKO14593 260 aa21.94■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 KCNH1O95259 989 aa21.94■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 PGM1P36871 562 aa21.94■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 AVPR1BP47901 424 aa21.94■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 RABL3Q5HYI8 236 aa21.94■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 ANXA8L1Q5VT79 327 aa21.94■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 CLEC4FQ8N1N0 589 aa21.94■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 PANX1Q96RD7 426 aa21.94■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 CGREF1Q99674 301 aa21.94■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa21.94■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 CEP250Q9BV73 2442 aa21.93■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa21.93■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 A0A1W2PRB8 838 aa21.93■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 H0YIG0 161 aa21.93■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 NTRK1P04629 796 aa21.93■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 FEN1P39748 380 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 RAB38P57729 211 aa21.93■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 SELPLGQ14242 412 aa21.93■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 ISXQ2M1V0 245 aa21.93■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 LRIF1Q5T3J3 769 aa21.93■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 NANOGP8Q6NSW7 305 aa21.93■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 TMEM126BQ8IUX1 230 aa21.93■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 RNF148Q8N7C7 305 aa21.93■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 OR51Q1Q8NH59 317 aa21.93■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 TRIM4Q9C037 500 aa21.93■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 IKZF5Q9H5V7 419 aa21.93■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 NANOGQ9H9S0 305 aa21.93■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 BTNL2Q9UIR0 455 aa21.93■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 FER1L5A0AVI2 2057 aa21.92■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 A0A096LPI6 279 aa21.92■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa21.92■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 DSCR3O14972 297 aa21.92■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 PDPK1O15530 556 aa21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.9 ms