RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384114.1

RNU6-409P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 409, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-409P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-409P-201ENST00000384114 NUP107P57740 925 aa-0.06□□□□□ -2.42
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RNU6-409P-201ENST00000384114 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP-0.08□□□□□ -2.42
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