RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384085.1

RNU6-38P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 38, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-38P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-38P-201ENST00000384085 EZRP15311 586 aaKnown RBP2.19□□□□□ -2.06
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RNU6-38P-201ENST00000384085 FHITP49789 147 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-38P-201ENST00000384085 PSMD6Q15008 389 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-38P-201ENST00000384085 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP2.19□□□□□ -2.06
RNU6-38P-201ENST00000384085 PAMR1Q6UXH9 720 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-38P-201ENST00000384085 Q6ZVH6 145 aa2.19□□□□□ -2.06
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RNU6-38P-201ENST00000384085 AP1M1Q9BXS5 423 aa2.19□□□□□ -2.06
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RNU6-38P-201ENST00000384085 RNF24Q9Y225 148 aa2.17□□□□□ -2.06
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RNU6-38P-201ENST00000384085 RNF212BA8MTL3 300 aa2.16□□□□□ -2.06
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RNU6-38P-201ENST00000384085 TNFSF11O14788 317 aa2.16□□□□□ -2.06
RNU6-38P-201ENST00000384085 WDR46O15213 610 aaKnown RBP2.16□□□□□ -2.06
RNU6-38P-201ENST00000384085 KIAA0513O60268 411 aa2.16□□□□□ -2.06
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RNU6-38P-201ENST00000384085 FCGR3AP08637 254 aa2.16□□□□□ -2.06
RNU6-38P-201ENST00000384085 GSTA2P09210 222 aa2.16□□□□□ -2.06
RNU6-38P-201ENST00000384085 ODC1P11926 461 aa2.16□□□□□ -2.06
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RNU6-38P-201ENST00000384085 IER3P46695 156 aa2.16□□□□□ -2.06
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