RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000382998.8

CTIF-202, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTIF, Length 4,407 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-202ENST00000382998 TUBAL3A6NHL2 446 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-202ENST00000382998 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
CTIF-202ENST00000382998 TLR5O60602 858 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-202ENST00000382998 SPDEFO95238 335 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-202ENST00000382998 ELK3P41970 407 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-202ENST00000382998 ZNF91Q05481 1191 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-202ENST00000382998 ODF4Q2M2E3 257 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-202ENST00000382998 DCAF12L1Q5VU92 463 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-202ENST00000382998 VASNQ6EMK4 673 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-202ENST00000382998 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-202ENST00000382998 TMEM108Q6UXF1 575 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-202ENST00000382998 RGL4Q8IZJ4 473 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-202ENST00000382998 HDDC3Q8N4P3 179 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-202ENST00000382998 FBXO27Q8NI29 283 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-202ENST00000382998 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
CTIF-202ENST00000382998 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
CTIF-202ENST00000382998 C16orf70Q9BSU1 422 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-202ENST00000382998 OR10A4Q9H209 315 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-202ENST00000382998 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP13.19□□□□□ -0.3
CTIF-202ENST00000382998 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP13.19□□□□□ -0.3
CTIF-202ENST00000382998 NRP1O14786 923 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-202ENST00000382998 EDIL3O43854 480 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-202ENST00000382998 NPHS1O60500 1241 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-202ENST00000382998 ZNF432O94892 652 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-202ENST00000382998 MLYCDO95822 493 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-202ENST00000382998 C8AP07357 584 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-202ENST00000382998 UCHL1P09936 223 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-202ENST00000382998 SPRP35270 261 aaPredicted RBP13.19□□□□□ -0.3
CTIF-202ENST00000382998 GCGRP47871 477 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-202ENST00000382998 ACTA2P62736 377 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-202ENST00000382998 ACTG2P63267 376 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-202ENST00000382998 ACTC1P68032 377 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-202ENST00000382998 ACTA1P68133 377 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-202ENST00000382998 LIPEQ05469 1076 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-202ENST00000382998 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
CTIF-202ENST00000382998 SLC10A6Q3KNW5 377 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-202ENST00000382998 STXBP5Q5T5C0 1151 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-202ENST00000382998 GPR153Q6NV75 609 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-202ENST00000382998 MTFR2Q6P444 385 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-202ENST00000382998 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP13.19□□□□□ -0.3
CTIF-202ENST00000382998 OR9A2Q8NGT5 310 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-202ENST00000382998 ZUFSPQ96AP4 578 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-202ENST00000382998 C12orf66Q96MD2 445 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-202ENST00000382998 EVA1AQ9H8M9 152 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-202ENST00000382998 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
CTIF-202ENST00000382998 PRRT4C9JH25 899 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-202ENST00000382998 NPIPA2E9PIF3 369 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-202ENST00000382998 NPIPA5E9PKD4 350 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-202ENST00000382998 NPIPA3F8WFD2 350 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-202ENST00000382998 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-202ENST00000382998 CTDSP2O14595 271 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-202ENST00000382998 UGT2B11O75310 529 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-202ENST00000382998 GAD2Q05329 585 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-202ENST00000382998 OR7E24Q6IFN5 339 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-202ENST00000382998 CDC73Q6P1J9 531 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-202ENST00000382998 ZDHHC24Q6UX98 284 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-202ENST00000382998 LINC00299Q6ZSB3 139 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-202ENST00000382998 C1orf127Q8N9H9 656 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-202ENST00000382998 KREMEN2Q8NCW0 462 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-202ENST00000382998 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP13.19□□□□□ -0.3
CTIF-202ENST00000382998 TIFAQ96CG3 184 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-202ENST00000382998 C14orf79Q96F83 325 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-202ENST00000382998 NPIPA1Q9UND3 350 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-202ENST00000382998 A0A0U1RQF3 1178 aa13.18□□□□□ -0.3
CTIF-202ENST00000382998 A0A1W2PPQ1 181 aa13.18□□□□□ -0.3
CTIF-202ENST00000382998 CYP11A1P05108 521 aa13.18□□□□□ -0.3
CTIF-202ENST00000382998 ALPLP05186 524 aa13.18□□□□□ -0.3
CTIF-202ENST00000382998 C5AR1P21730 350 aa13.18□□□□□ -0.3
CTIF-202ENST00000382998 SLC1A2P43004 574 aa13.18□□□□□ -0.3
CTIF-202ENST00000382998 LILRA4P59901 499 aa13.18□□□□□ -0.3
CTIF-202ENST00000382998 TAF10Q12962 218 aa13.18□□□□□ -0.3
CTIF-202ENST00000382998 SCGB2A2Q13296 93 aa13.18□□□□□ -0.3
CTIF-202ENST00000382998 DAG1Q14118 895 aa13.18□□□□□ -0.3
CTIF-202ENST00000382998 HKDC1Q2TB90 917 aa13.18□□□□□ -0.3
CTIF-202ENST00000382998 IQCCQ4KMZ1 466 aa13.18□□□□□ -0.3
CTIF-202ENST00000382998 CLLU1Q5K131 121 aa13.18□□□□□ -0.3
CTIF-202ENST00000382998 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa13.18□□□□□ -0.3
CTIF-202ENST00000382998 TMEM192Q8IY95 271 aa13.18□□□□□ -0.3
CTIF-202ENST00000382998 FAM185AQ8N0U4 392 aa13.18□□□□□ -0.3
CTIF-202ENST00000382998 BPIFCQ8NFQ6 507 aa13.18□□□□□ -0.3
CTIF-202ENST00000382998 LRRN4Q8WUT4 740 aa13.18□□□□□ -0.3
CTIF-202ENST00000382998 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP13.18□□□□□ -0.3
CTIF-202ENST00000382998 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa13.18□□□□□ -0.3
CTIF-202ENST00000382998 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP13.18□□□□□ -0.3
CTIF-202ENST00000382998 SMCO4Q9NRQ5 59 aa13.18□□□□□ -0.3
CTIF-202ENST00000382998 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa13.18□□□□□ -0.3
CTIF-202ENST00000382998 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP13.18□□□□□ -0.3
CTIF-202ENST00000382998 TRIM77I1YAP6 450 aa13.18□□□□□ -0.3
CTIF-202ENST00000382998 JCHAINP01591 159 aa13.18□□□□□ -0.3
CTIF-202ENST00000382998 DLDP09622 509 aaKnown RBP13.18□□□□□ -0.3
CTIF-202ENST00000382998 PPP3CBP16298 524 aa13.18□□□□□ -0.3
CTIF-202ENST00000382998 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP13.18□□□□□ -0.3
CTIF-202ENST00000382998 FAM35AQ86V20 835 aa13.18□□□□□ -0.3
CTIF-202ENST00000382998 FJX1Q86VR8 437 aa13.18□□□□□ -0.3
CTIF-202ENST00000382998 DENND1CQ8IV53 801 aa13.18□□□□□ -0.3
CTIF-202ENST00000382998 LRIG1Q96JA1 1093 aa13.18□□□□□ -0.3
CTIF-202ENST00000382998 OR14A2Q96R54 314 aa13.18□□□□□ -0.3
CTIF-202ENST00000382998 FZD8Q9H461 694 aa13.18□□□□□ -0.3
CTIF-202ENST00000382998 CALML5Q9NZT1 146 aa13.18□□□□□ -0.3
CTIF-202ENST00000382998 SLC23A1Q9UHI7 598 aa13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.2 ms