RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372616.1

CTPS1-201, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTPS1, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-201ENST00000372616 GFOD2Q3B7J2 385 aa6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 DDI2Q5TDH0 399 aa6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 LCN1P1Q5VSP4 162 aa6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 TAS1R1Q7RTX1 841 aa6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 ATAD1Q8NBU5 361 aa6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 PSMG2Q969U7 264 aa6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 B3GALT6Q96L58 329 aa6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 CENPOQ9BU64 300 aa6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 MND1Q9BWT6 205 aa6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 VN1R3Q9BXE9 311 aa6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 CD244Q9BZW8 370 aa6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 SERHLQ9NQF3 203 aa6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 ERVK13-1Q9NX77 482 aa6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 DUSP12Q9UNI6 340 aa6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 SSR3Q9UNL2 185 aa6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 ABCG2Q9UNQ0 655 aa6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 MED16Q9Y2X0 877 aa6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 SPEF1Q9Y4P9 236 aa6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 GREB1Q4ZG55 1949 aa6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 A0A1W2PQ72 361 aa6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 OR6C70A6NIJ9 312 aa6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 MAGEB17A8MXT2 336 aa6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 J3KR12 359 aa6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 CBX4O00257 560 aa6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 CLIC1O00299 241 aa6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 TNFRSF11BO00300 401 aa6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 MANBAO00462 879 aa6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 ORC5O43913 435 aa6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 CYP7B1O75881 506 aa6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 CLDN9O95484 217 aa6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP6.88□□□□□ -1.314e-7■■■□□ 15.2
CTPS1-201ENST00000372616 ITGB7P26010 798 aa6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 HTR6P50406 440 aa6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 C21orf58P58505 322 aa6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 CACNG1Q06432 222 aa6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 MTAPQ13126 283 aa6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 MAB21L1Q13394 359 aa6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 MED22Q15528 200 aa6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 TAF12Q16514 161 aa6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 HKDC1Q2TB90 917 aa6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 IQCCQ4KMZ1 466 aa6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 DOK6Q6PKX4 331 aa6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 SLC30A8Q8IWU4 369 aa6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 NLGN4XQ8N0W4 816 aa6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 C19orf18Q8NEA5 215 aa6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 OR13C4Q8NGS5 318 aa6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 FBXO32Q969P5 355 aa6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 CMTM7Q96FZ5 175 aa6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 MGME1Q9BQP7 344 aa6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 TTYH2Q9BSA4 534 aa6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 DOHHQ9BU89 302 aa6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 TAPBPLQ9BX59 468 aa6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 ASPNQ9BXN1 380 aa6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 SRRQ9GZT4 340 aa6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 ZBP1Q9H171 429 aa6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 OR51E2Q9H255 320 aa6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 MS4A5Q9H3V2 200 aa6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 C14orf119Q9NWQ9 140 aa6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 VNN3Q9NY84 501 aa6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 WWOXQ9NZC7 414 aa6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 FBXO10Q9UK96 956 aa6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 ASB4Q9Y574 426 aa6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 IRAK3Q9Y616 596 aa6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 DRGXA6NNA5 263 aa6.87□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 CCL22O00626 93 aa6.87□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 TEX28O15482 410 aa6.87□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 OR2B3O76000 313 aa6.87□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 CCNB2O95067 398 aa6.87□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 HLA-DQB1P01920 261 aa6.87□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 CD3EP07766 207 aa6.87□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 GSTM1P09488 218 aa6.87□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 HSMCR30P0CW71 290 aa6.87□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 CBSLP0DN79 551 aa6.87□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 CKMT1AP12532 417 aa6.87□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 IFNGR1P15260 489 aa6.87□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 SYN1P17600 705 aa6.87□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 MAGP20916 626 aa6.87□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 MC4RP32245 332 aa6.87□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 CTNNB1P35222 781 aa6.87□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 CBSP35520 551 aa6.87□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 RFX2P48378 723 aa6.87□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 HK3P52790 923 aa6.87□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 EPHB3P54753 998 aa6.87□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 RBBP4Q09028 425 aa6.87□□□□□ -1.31
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