RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366197.9

ZNF548-202, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZNF548, Length 4,955 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-202ENST00000366197 AK1P00568 194 aa9.89□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 HTR1AP08908 422 aa9.89□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 IL1RNP18510 177 aa9.89□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 CBLP22681 906 aa9.89□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 CDH15P55291 814 aa9.89□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 CLDN8P56748 225 aa9.89□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 ZBED5Q49AG3 693 aa9.89□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 C1orf94Q6P1W5 598 aa9.89□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 OR8K5Q8NH50 307 aa9.89□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 NSMAFQ92636 917 aa9.89□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 BOCQ9BWV1 1114 aa9.89□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 ITPAQ9BY32 194 aa9.89□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 LAMP5Q9UJQ1 280 aa9.89□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 KNTC1P50748 2209 aa9.89□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa9.88□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 PRAMEF10O60809 474 aa9.88□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 SCGNO76038 276 aa9.88□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 F8A1P23610 371 aa9.88□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 MANEALQ5VSG8 457 aa9.88□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 MEDAGQ5VYS4 303 aa9.88□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 SLC27A4Q6P1M0 643 aa9.88□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa9.88□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 ISCA2Q86U28 154 aa9.88□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa9.88□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 C3orf58Q8NDZ4 430 aa9.88□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 OR51A7Q8NH64 312 aa9.88□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 FGF13Q92913 245 aa9.88□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 RTP4Q96DX8 246 aa9.88□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 DOHHQ9BU89 302 aa9.88□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 GPRC5BQ9NZH0 403 aa9.88□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa9.88□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 FEZF1A0PJY2 475 aa9.88□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 ZNF878C9JN71 531 aa9.88□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 KDM4BO94953 1096 aa9.88□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 MT-ND5P03915 603 aa9.88□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 TAS2R43P59537 309 aa9.88□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 ULK3Q6PHR2 472 aa9.88□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 ZSWIM9Q86XI8 627 aa9.88□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa9.88□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 ORAI3Q9BRQ5 295 aa9.88□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 SLC12A9Q9BXP2 914 aa9.88□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 OR51I1Q9H343 314 aa9.88□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa9.88□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 GNG8Q9UK08 70 aa9.88□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 MGAT4AQ9UM21 535 aa9.88□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa9.88□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 A0A1B0GVT2 93 aa9.88□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 PROS1P07225 676 aa9.88□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 HCKP08631 526 aa9.88□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 DSC1Q08554 894 aa9.88□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 ZNF234Q14588 700 aa9.88□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 TSTQ16762 297 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 MARCH8Q5T0T0 291 aa9.88□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 SLC36A4Q6YBV0 504 aa9.88□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 TREML1Q86YW5 311 aa9.88□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 OR2L8Q8NGY9 312 aa9.88□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 RDH12Q96NR8 316 aa9.88□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 TTYH2Q9BSA4 534 aa9.88□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 TMED9Q9BVK6 235 aa9.88□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 TOR3AQ9H497 397 aa9.88□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa9.88□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 SPO11Q9Y5K1 396 aa9.88□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 C11orf98E9PRG8 122 aa9.88□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 LATO43561 262 aa9.88□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 SDC3O75056 442 aa9.88□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 HTR1EP28566 365 aa9.88□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 DCDC1P59894 354 aa9.88□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 NSDHLQ15738 373 aa9.88□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 UGT3A2Q3SY77 523 aa9.88□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa9.88□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 TMEM130Q8N3G9 435 aa9.88□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa9.88□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 OR4C15Q8NGM1 316 aa9.88□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa9.88□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 SLC45A3Q96JT2 553 aa9.88□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 SLC46A2Q9BY10 475 aa9.88□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 ANKMY1Q9P2S6 941 aa9.88□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 MEMO1Q9Y316 297 aa9.88□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa9.88□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa9.88□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 A6NCN8 305 aa9.87□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 PTNP21246 168 aa9.87□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 OR4D1Q15615 310 aa9.87□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 OR4C11Q6IEV9 310 aa9.87□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 RTL10Q7L3V2 364 aa9.87□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 SLITRK4Q8IW52 837 aa9.87□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa9.87□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 OR6N2Q8NGY6 317 aa9.87□□□□□ -0.83
ZNF548-202ENST00000366197 OR52P1PQ8NH57 321 aa9.87□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.6 ms