RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 LRP10Q7Z4F1 713 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 DAW1Q8N136 415 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 LNX2Q8N448 690 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 TTYH2Q9BSA4 534 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 TPK1Q9H3S4 243 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 SIX2Q9NPC8 291 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 ASIC5Q9NY37 505 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 TAS2R3Q9NYW6 316 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 SCML2Q9UQR0 700 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 MED31Q9Y3C7 131 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 FBXO7Q9Y3I1 522 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 GBF1Q92538 1859 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 A6NIZ1 184 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 I3L521 148 aa4.73□□□□□ -1.65
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PTPRD-201ENST00000355233 CTSEP14091 401 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 CAPN3P20807 821 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 RAP1BP61224 184 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 RAP1AP62834 184 aa4.73□□□□□ -1.65
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PTPRD-201ENST00000355233 SCARB2Q14108 478 aa4.73□□□□□ -1.65
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PTPRD-201ENST00000355233 ZDHHC24Q6UX98 284 aa4.73□□□□□ -1.65
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PTPRD-201ENST00000355233 GLB1L2Q8IW92 636 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 KDM8Q8N371 416 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 KCNRGQ8N5I3 272 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 OR2T4Q8NH00 348 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 TTC9Q92623 222 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 MYRFLQ96LU7 910 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 AGAP4Q96P64 663 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
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PTPRD-201ENST00000355233 SMDT1Q9H4I9 107 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 REEP4Q9H6H4 257 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 PREBQ9HCU5 417 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 PRDM9Q9NQV7 894 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 FFAR2O15552 330 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 SEC14L5O43304 696 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 IFNA5P01569 189 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP4.73□□□□□ -1.65
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PTPRD-201ENST00000355233 PNMTP11086 282 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 KCNE1P15382 129 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 EPHA3P29320 983 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 FRRS1Q6ZNA5 592 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 USP49Q70CQ1 688 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 FAM131BQ86XD5 332 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 CNTN4Q8IWV2 1026 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 ZFAND1Q8TCF1 268 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF675Q8TD23 568 aa4.73□□□□□ -1.65
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PTPRD-201ENST00000355233 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 IL7RP16871 459 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF20P17024 532 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 EPORP19235 508 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 KITLGP21583 273 aa4.73□□□□□ -1.65
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PTPRD-201ENST00000355233 RPIAP49247 311 aa4.73□□□□□ -1.65
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PTPRD-201ENST00000355233 ARHGAP1Q07960 439 aa4.73□□□□□ -1.65
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PTPRD-201ENST00000355233 SCRN2Q96FV2 425 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
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PTPRD-201ENST00000355233 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 ITGB5P18084 799 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 SPCS2Q15005 226 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 LLGL1Q15334 1064 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 C4orf46Q504U0 113 aa4.73□□□□□ -1.65
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PTPRD-201ENST00000355233 CD276Q5ZPR3 534 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 TMEM53Q6P2H8 277 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 NDUFAF7Q7L592 441 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 SLC22A16Q86VW1 577 aa4.73□□□□□ -1.65
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