RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345425.6

GIPC1-201, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GIPC1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-201ENST00000345425 C21orf140B9A014 251 aa26.15■■□□□ 1.78
GIPC1-201ENST00000345425 ANKRD28O15084 1053 aa26.15■■□□□ 1.78
GIPC1-201ENST00000345425 AKAP10O43572 662 aa26.15■■□□□ 1.78
GIPC1-201ENST00000345425 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP26.15■■□□□ 1.78
GIPC1-201ENST00000345425 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP26.15■■□□□ 1.78
GIPC1-201ENST00000345425 PPP2R1BP30154 601 aa26.15■■□□□ 1.78
GIPC1-201ENST00000345425 HSD17B7P56937 341 aa26.15■■□□□ 1.78
GIPC1-201ENST00000345425 MC1RQ01726 317 aa26.15■■□□□ 1.78
GIPC1-201ENST00000345425 ERV3-1Q14264 604 aa26.15■■□□□ 1.78
GIPC1-201ENST00000345425 MINDY4Q4G0A6 757 aa26.15■■□□□ 1.78
GIPC1-201ENST00000345425 MFSD4BQ5TF39 518 aa26.15■■□□□ 1.78
GIPC1-201ENST00000345425 IL22RA1Q8N6P7 574 aa26.15■■□□□ 1.78
GIPC1-201ENST00000345425 ANKS4BQ8N8V4 417 aa26.15■■□□□ 1.78
GIPC1-201ENST00000345425 NKD1Q969G9 470 aa26.15■■□□□ 1.78
GIPC1-201ENST00000345425 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP26.15■■□□□ 1.78
GIPC1-201ENST00000345425 ACTL8Q9H568 366 aa26.15■■□□□ 1.78
GIPC1-201ENST00000345425 LANCL2Q9NS86 450 aa26.15■■□□□ 1.78
GIPC1-201ENST00000345425 NUP210LQ5VU65 1888 aa26.15■■□□□ 1.78
GIPC1-201ENST00000345425 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP26.15■■□□□ 1.78
GIPC1-201ENST00000345425 JRKO75564 520 aa26.15■■□□□ 1.78
GIPC1-201ENST00000345425 FURINP09958 794 aa26.15■■□□□ 1.78
GIPC1-201ENST00000345425 NME5P56597 212 aa26.15■■□□□ 1.78
GIPC1-201ENST00000345425 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP26.15■■□□□ 1.78
GIPC1-201ENST00000345425 SLC48A1Q6P1K1 146 aa26.15■■□□□ 1.78
GIPC1-201ENST00000345425 RIMKLAQ8IXN7 391 aa26.15■■□□□ 1.78
GIPC1-201ENST00000345425 MMP21Q8N119 569 aa26.15■■□□□ 1.78
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP26.15■■□□□ 1.78
GIPC1-201ENST00000345425 ZBTB18Q99592 522 aa26.15■■□□□ 1.78
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF385DQ9H6B1 395 aa26.15■■□□□ 1.78
GIPC1-201ENST00000345425 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa26.15■■□□□ 1.78
GIPC1-201ENST00000345425 CROTQ9UKG9 612 aa26.15■■□□□ 1.78
GIPC1-201ENST00000345425 MMACHCQ9Y4U1 282 aa26.15■■□□□ 1.78
GIPC1-201ENST00000345425 GLOD5A6NK44 160 aa26.14■■□□□ 1.78
GIPC1-201ENST00000345425 SLC22A3O75751 556 aa26.14■■□□□ 1.78
GIPC1-201ENST00000345425 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.78
GIPC1-201ENST00000345425 UFM1P61960 85 aa26.14■■□□□ 1.78
GIPC1-201ENST00000345425 RPS15P62841 145 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.78
GIPC1-201ENST00000345425 QSOX2Q6ZRP7 698 aa26.14■■□□□ 1.78
GIPC1-201ENST00000345425 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.78
GIPC1-201ENST00000345425 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa26.14■■□□□ 1.78
GIPC1-201ENST00000345425 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.78
GIPC1-201ENST00000345425 TMEM52Q8NDY8 209 aa26.14■■□□□ 1.78
GIPC1-201ENST00000345425 DNAJB14Q8TBM8 379 aa26.14■■□□□ 1.78
GIPC1-201ENST00000345425 SPSB2Q99619 263 aa26.14■■□□□ 1.78
GIPC1-201ENST00000345425 GPR87Q9BY21 358 aa26.14■■□□□ 1.78
GIPC1-201ENST00000345425 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.78
GIPC1-201ENST00000345425 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa26.14■■□□□ 1.77
GIPC1-201ENST00000345425 PGRMC2O15173 223 aa26.13■■□□□ 1.77
GIPC1-201ENST00000345425 COX7A2P14406 83 aa26.13■■□□□ 1.77
GIPC1-201ENST00000345425 SLC13A2Q13183 592 aa26.13■■□□□ 1.77
GIPC1-201ENST00000345425 PDE7AQ13946 482 aa26.13■■□□□ 1.77
GIPC1-201ENST00000345425 DPY19L1Q2PZI1 675 aa26.13■■□□□ 1.77
GIPC1-201ENST00000345425 TICAM1Q8IUC6 712 aa26.13■■□□□ 1.77
GIPC1-201ENST00000345425 PRSS58Q8IYP2 241 aa26.13■■□□□ 1.77
GIPC1-201ENST00000345425 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
GIPC1-201ENST00000345425 PPCDCQ96CD2 204 aa26.13■■□□□ 1.77
GIPC1-201ENST00000345425 NMUR2Q9GZQ4 415 aa26.13■■□□□ 1.77
GIPC1-201ENST00000345425 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
GIPC1-201ENST00000345425 SAR1AQ9NR31 198 aa26.13■■□□□ 1.77
GIPC1-201ENST00000345425 TMEM45AQ9NWC5 275 aa26.13■■□□□ 1.77
GIPC1-201ENST00000345425 ATP6V1HQ9UI12 483 aa26.13■■□□□ 1.77
GIPC1-201ENST00000345425 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa26.13■■□□□ 1.77
GIPC1-201ENST00000345425 MKL2Q9ULH7 1088 aa26.13■■□□□ 1.77
GIPC1-201ENST00000345425 TBX19O60806 448 aa26.12■■□□□ 1.77
GIPC1-201ENST00000345425 CTNSO60931 367 aa26.12■■□□□ 1.77
GIPC1-201ENST00000345425 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
GIPC1-201ENST00000345425 CYC1P08574 325 aa26.12■■□□□ 1.77
GIPC1-201ENST00000345425 GPX3P22352 226 aa26.12■■□□□ 1.77
GIPC1-201ENST00000345425 DLSTP36957 453 aa26.12■■□□□ 1.77
GIPC1-201ENST00000345425 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
GIPC1-201ENST00000345425 DNASE1L3Q13609 305 aa26.12■■□□□ 1.77
GIPC1-201ENST00000345425 C7orf57Q8NEG2 295 aa26.12■■□□□ 1.77
GIPC1-201ENST00000345425 TESCQ96BS2 214 aa26.12■■□□□ 1.77
GIPC1-201ENST00000345425 CLMPQ9H6B4 373 aa26.12■■□□□ 1.77
GIPC1-201ENST00000345425 ATAD3AQ9NVI7 634 aa26.12■■□□□ 1.77
GIPC1-201ENST00000345425 KCND3Q9UK17 655 aa26.12■■□□□ 1.77
GIPC1-201ENST00000345425 UTS2RQ9UKP6 389 aa26.12■■□□□ 1.77
GIPC1-201ENST00000345425 CES1P1Q9UKY3 287 aa26.12■■□□□ 1.77
GIPC1-201ENST00000345425 SCN2AQ99250 2005 aa26.12■■□□□ 1.77
GIPC1-201ENST00000345425 DCTN3O75935 186 aa26.12■■□□□ 1.77
GIPC1-201ENST00000345425 PAOXQ6QHF9 649 aa26.12■■□□□ 1.77
GIPC1-201ENST00000345425 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
GIPC1-201ENST00000345425 SCUBE1Q8IWY4 988 aa26.12■■□□□ 1.77
GIPC1-201ENST00000345425 UCN3Q969E3 161 aa26.12■■□□□ 1.77
GIPC1-201ENST00000345425 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
GIPC1-201ENST00000345425 KLHL29Q96CT2 875 aa26.12■■□□□ 1.77
GIPC1-201ENST00000345425 TAS2R7Q9NYW3 318 aa26.12■■□□□ 1.77
GIPC1-201ENST00000345425 SH3BP4Q9P0V3 963 aa26.12■■□□□ 1.77
GIPC1-201ENST00000345425 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
GIPC1-201ENST00000345425 GABRR3A8MPY1 467 aa26.11■■□□□ 1.77
GIPC1-201ENST00000345425 HEXBP07686 556 aa26.11■■□□□ 1.77
GIPC1-201ENST00000345425 PIK3R1P27986 724 aa26.11■■□□□ 1.77
GIPC1-201ENST00000345425 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
GIPC1-201ENST00000345425 UGT8Q16880 541 aa26.11■■□□□ 1.77
GIPC1-201ENST00000345425 CPTPQ5TA50 214 aa26.11■■□□□ 1.77
GIPC1-201ENST00000345425 LAPTM4BQ86VI4 370 aa26.11■■□□□ 1.77
GIPC1-201ENST00000345425 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
GIPC1-201ENST00000345425 OR4K14Q8NGD5 310 aa26.11■■□□□ 1.77
GIPC1-201ENST00000345425 OR2Y1Q8NGV0 311 aa26.11■■□□□ 1.77
GIPC1-201ENST00000345425 FGF11Q92914 225 aa26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.4 ms