RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325599.12

SHQ1-201, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SHQ1, Length 2,879 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-201ENST00000325599 TAS2R16Q9NYV7 291 aa15.59■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 CKAP5Q14008 2032 aa15.59■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 REV3LO60673 3130 aa15.59■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 HEPACAM2A8MVW5 462 aa15.59■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 KMOO15229 486 aa15.59■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 PI15O43692 258 aa15.59■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 ANXA8P13928 327 aa15.59■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 GRK5P34947 590 aa15.59■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 ELP6Q0PNE2 266 aa15.59■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 ANKRD53Q8N9V6 530 aa15.59■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa15.59■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 UCN3Q969E3 161 aa15.59■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa15.59■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 POLE4Q9NR33 117 aa15.59■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 POFUT2Q9Y2G5 429 aa15.59■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa15.59■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 MYO10Q9HD67 2058 aa15.59■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 CLCA1A8K7I4 914 aa15.58■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 ADH1CP00326 375 aa15.58■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 ARAFP10398 606 aa15.58■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 GABRB1P18505 474 aa15.58■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 GADD45AP24522 165 aa15.58■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF234Q14588 700 aa15.58■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP15.58■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 GAB4Q2WGN9 574 aa15.58■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 CEACAM20Q6UY09 585 aa15.58■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 PLD3Q8IV08 490 aa15.58■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 NATD1Q8N6N6 113 aa15.58■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 RAB8BQ92930 207 aa15.58■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 SLC38A4Q969I6 547 aa15.58■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 PIP5K1AQ99755 562 aa15.58■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 DPEP2Q9H4A9 486 aa15.58■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 RNF167Q9H6Y7 350 aa15.58■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 SNX11Q9Y5W9 270 aa15.58■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa15.58■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 DNAH14Q0VDD8 3507 aa15.58■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa15.58■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 FGBP02675 491 aa15.58■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 CDK1P06493 297 aa15.58■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 ADRA2AP08913 450 aa15.58■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 IFNA8P32881 189 aa15.58■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 VASPP50552 380 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 DSTNP60981 165 aa15.58■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 TIGD6Q17RP2 521 aa15.58■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 HORMAD2Q8N7B1 307 aa15.58■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 TMIEQ8NEW7 156 aa15.58■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 RAD51AP1Q96B01 352 aa15.58■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 EPS8L2Q9H6S3 715 aa15.58■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 TAF4O00268 1085 aa15.58■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 CCRL2O00421 344 aa15.58■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 TLL1O43897 1013 aa15.58■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 GADD45GO95257 159 aa15.58■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 GASTP01350 101 aa15.58■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 CLK1P49759 484 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 DPTQ07507 201 aa15.58■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 AQP11Q8NBQ7 271 aa15.58■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 MROQ9BYG7 248 aa15.58■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 DCSTAMPQ9H295 470 aa15.58■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 FBXO8Q9NRD0 319 aa15.58■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 OSGIN1Q9UJX0 560 aa15.58■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 GPR34Q9UPC5 381 aa15.58■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 ATG2BQ96BY7 2078 aa15.57■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa15.57■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 ANKDD1BA6NHY2 528 aa15.57■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 CLDN24A6NM45 220 aa15.57■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 FFAR1O14842 300 aa15.57■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 AIREO43918 545 aa15.57■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 PTHP01270 115 aa15.57■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 RPL3P39023 403 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 LIMS1P48059 325 aa15.57■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 PXNP49023 591 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 LIM2P55344 173 aa15.57■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 CSNK2BP67870 215 aa15.57■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 MAPK11Q15759 364 aa15.57■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 INAVAQ3KP66 663 aa15.57■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 PRR23CQ6ZRP0 262 aa15.57■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF765Q7L2R6 523 aa15.57■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF605Q86T29 641 aa15.57■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 HEATR4Q86WZ0 1026 aa15.57■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 SLC38A5Q8WUX1 472 aa15.57■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa15.57■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 FKBP14Q9NWM8 211 aa15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.1 ms