RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319359.7

ELL3-201, Transcript of elongation factor for RNA polymerase II 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ELL3, Length 2,352 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3-201ENST00000319359 PCM1Q15154 2024 aa20.69■□□□□ 0.9
ELL3-201ENST00000319359 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP20.68■□□□□ 0.9
ELL3-201ENST00000319359 A8MVJ9 347 aa20.68■□□□□ 0.9
ELL3-201ENST00000319359 TPST2O60704 377 aa20.68■□□□□ 0.9
ELL3-201ENST00000319359 AP2A2O94973 939 aa20.68■□□□□ 0.9
ELL3-201ENST00000319359 CKMP06732 381 aa20.68■□□□□ 0.9
ELL3-201ENST00000319359 CSF3P09919 207 aa20.68■□□□□ 0.9
ELL3-201ENST00000319359 MSL3P1P0C860 447 aa20.68■□□□□ 0.9
ELL3-201ENST00000319359 CAV3P56539 151 aa20.68■□□□□ 0.9
ELL3-201ENST00000319359 RBBP4Q09028 425 aa20.68■□□□□ 0.9
ELL3-201ENST00000319359 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP20.68■□□□□ 0.9
ELL3-201ENST00000319359 PHC2Q8IXK0 858 aa20.68■□□□□ 0.9
ELL3-201ENST00000319359 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa20.68■□□□□ 0.9
ELL3-201ENST00000319359 GPR32P1Q8NGA4 272 aa20.68■□□□□ 0.9
ELL3-201ENST00000319359 UBASH3BQ8TF42 649 aa20.68■□□□□ 0.9
ELL3-201ENST00000319359 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
ELL3-201ENST00000319359 TSSK6Q9BXA6 273 aa20.68■□□□□ 0.9
ELL3-201ENST00000319359 FAM83DQ9H4H8 585 aa20.68■□□□□ 0.9
ELL3-201ENST00000319359 STUB1Q9UNE7 303 aa20.68■□□□□ 0.9
ELL3-201ENST00000319359 CARD8Q9Y2G2 431 aa20.68■□□□□ 0.9
ELL3-201ENST00000319359 PPIL1Q9Y3C6 166 aa20.68■□□□□ 0.9
ELL3-201ENST00000319359 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP20.68■□□□□ 0.9
ELL3-201ENST00000319359 MYOFQ9NZM1 2061 aa20.68■□□□□ 0.9
ELL3-201ENST00000319359 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP20.68■□□□□ 0.9
ELL3-201ENST00000319359 A0A1W2PRB8 838 aa20.68■□□□□ 0.9
ELL3-201ENST00000319359 HMX3A6NHT5 357 aa20.68■□□□□ 0.9
ELL3-201ENST00000319359 HEPACAM2A8MVW5 462 aa20.68■□□□□ 0.9
ELL3-201ENST00000319359 OR10H3O60404 316 aa20.68■□□□□ 0.9
ELL3-201ENST00000319359 BCHEP06276 602 aa20.68■□□□□ 0.9
ELL3-201ENST00000319359 ARAFP10398 606 aa20.68■□□□□ 0.9
ELL3-201ENST00000319359 KCNC3Q14003 757 aa20.68■□□□□ 0.9
ELL3-201ENST00000319359 PAMR1Q6UXH9 720 aa20.68■□□□□ 0.9
ELL3-201ENST00000319359 RNF180Q86T96 592 aa20.68■□□□□ 0.9
ELL3-201ENST00000319359 SYT14Q8NB59 555 aa20.68■□□□□ 0.9
ELL3-201ENST00000319359 OR4D11Q8NGI4 311 aa20.68■□□□□ 0.9
ELL3-201ENST00000319359 OR56A3Q8NH54 315 aa20.68■□□□□ 0.9
ELL3-201ENST00000319359 RAB8BQ92930 207 aa20.68■□□□□ 0.9
ELL3-201ENST00000319359 TMEM159Q96B96 161 aa20.68■□□□□ 0.9
ELL3-201ENST00000319359 UCK2Q9BZX2 261 aa20.68■□□□□ 0.9
ELL3-201ENST00000319359 CXorf36Q9H7Y0 433 aa20.68■□□□□ 0.9
ELL3-201ENST00000319359 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa20.68■□□□□ 0.9
ELL3-201ENST00000319359 MAU2Q9Y6X3 613 aa20.68■□□□□ 0.9
ELL3-201ENST00000319359 HYKKA2RU49 373 aa20.67■□□□□ 0.9
ELL3-201ENST00000319359 IL3P08700 152 aa20.67■□□□□ 0.9
ELL3-201ENST00000319359 PIPP12273 146 aaPredicted RBP20.67■□□□□ 0.9
ELL3-201ENST00000319359 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP20.67■□□□□ 0.9
ELL3-201ENST00000319359 TBPL1P62380 186 aa20.67■□□□□ 0.9
ELL3-201ENST00000319359 GALK2Q01415 458 aa20.67■□□□□ 0.9
ELL3-201ENST00000319359 ZNF33BQ06732 778 aa20.67■□□□□ 0.9
ELL3-201ENST00000319359 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP20.67■□□□□ 0.9
ELL3-201ENST00000319359 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP20.67■□□□□ 0.9
ELL3-201ENST00000319359 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP20.67■□□□□ 0.9
ELL3-201ENST00000319359 HMGN2P46Q86SG4 172 aa20.67■□□□□ 0.9
ELL3-201ENST00000319359 CAMKK1Q8N5S9 505 aa20.67■□□□□ 0.9
ELL3-201ENST00000319359 SLC7A6Q92536 515 aa20.67■□□□□ 0.9
ELL3-201ENST00000319359 SLC6A16Q9GZN6 736 aa20.67■□□□□ 0.9
ELL3-201ENST00000319359 ABCG4Q9H172 646 aa20.67■□□□□ 0.9
ELL3-201ENST00000319359 NDUFB11Q9NX14 153 aa20.67■□□□□ 0.9
ELL3-201ENST00000319359 NOTOA8MTQ0 251 aa20.67■□□□□ 0.9
ELL3-201ENST00000319359 MPZL2O60487 215 aa20.67■□□□□ 0.9
ELL3-201ENST00000319359 OSMP13725 252 aa20.67■□□□□ 0.9
ELL3-201ENST00000319359 TNNI3P19429 210 aa20.67■□□□□ 0.9
ELL3-201ENST00000319359 RUNX1T1Q06455 604 aa20.67■□□□□ 0.9
ELL3-201ENST00000319359 CCDC58Q4VC31 144 aa20.67■□□□□ 0.9
ELL3-201ENST00000319359 LYPD8Q6UX82 237 aa20.67■□□□□ 0.9
ELL3-201ENST00000319359 DEF8Q6ZN54 512 aa20.67■□□□□ 0.9
ELL3-201ENST00000319359 OLIG3Q7RTU3 272 aa20.67■□□□□ 0.9
ELL3-201ENST00000319359 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP20.67■□□□□ 0.9
ELL3-201ENST00000319359 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP20.67■□□□□ 0.9
ELL3-201ENST00000319359 HORMAD2Q8N7B1 307 aa20.67■□□□□ 0.9
ELL3-201ENST00000319359 NANOGP1Q8N7R0 232 aa20.67■□□□□ 0.9
ELL3-201ENST00000319359 FIBINQ8TAL6 211 aa20.67■□□□□ 0.9
ELL3-201ENST00000319359 ZNF480Q8WV37 535 aa20.67■□□□□ 0.9
ELL3-201ENST00000319359 IL21Q9HBE4 155 aa20.67■□□□□ 0.9
ELL3-201ENST00000319359 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP20.67■□□□□ 0.9
ELL3-201ENST00000319359 SEC14L4Q9UDX3 406 aa20.67■□□□□ 0.9
ELL3-201ENST00000319359 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP20.67■□□□□ 0.9
ELL3-201ENST00000319359 ANGPT4Q9Y264 503 aa20.67■□□□□ 0.9
ELL3-201ENST00000319359 BACE2Q9Y5Z0 518 aa20.67■□□□□ 0.9
ELL3-201ENST00000319359 B4DXG7 233 aa20.66■□□□□ 0.9
ELL3-201ENST00000319359 DSTNP60981 165 aa20.66■□□□□ 0.9
ELL3-201ENST00000319359 MPPE1Q53F39 396 aa20.66■□□□□ 0.9
ELL3-201ENST00000319359 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
ELL3-201ENST00000319359 DIRAS2Q96HU8 199 aa20.66■□□□□ 0.9
ELL3-201ENST00000319359 LINC00597Q9H2U6 94 aa20.66■□□□□ 0.9
ELL3-201ENST00000319359 MTG2Q9H4K7 406 aa20.66■□□□□ 0.9
ELL3-201ENST00000319359 TVP23BQ9NYZ1 205 aa20.66■□□□□ 0.9
ELL3-201ENST00000319359 C5AR2Q9P296 337 aa20.66■□□□□ 0.9
ELL3-201ENST00000319359 KCND3Q9UK17 655 aa20.66■□□□□ 0.9
ELL3-201ENST00000319359 PRKYO43930 277 aa20.66■□□□□ 0.9
ELL3-201ENST00000319359 LATS1O95835 1130 aa20.66■□□□□ 0.9
ELL3-201ENST00000319359 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
ELL3-201ENST00000319359 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
ELL3-201ENST00000319359 ETV5P41161 510 aa20.66■□□□□ 0.9
ELL3-201ENST00000319359 KIR2DL3P43628 341 aa20.66■□□□□ 0.9
ELL3-201ENST00000319359 ETV1P50549 477 aa20.66■□□□□ 0.9
ELL3-201ENST00000319359 PDE7AQ13946 482 aa20.66■□□□□ 0.9
ELL3-201ENST00000319359 GPAT3Q53EU6 434 aa20.66■□□□□ 0.9
ELL3-201ENST00000319359 FAM71E1Q6IPT2 247 aa20.66■□□□□ 0.9
ELL3-201ENST00000319359 TCTN3Q6NUS6 607 aa20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.8 ms