RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318988.10

CTDNEP1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-201ENST00000318988 GID8Q9NWU2 228 aa25.88■■□□□ 1.73
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CTDNEP1-201ENST00000318988 NPPAP01160 153 aa25.83■■□□□ 1.73
CTDNEP1-201ENST00000318988 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.73
CTDNEP1-201ENST00000318988 MANFP55145 182 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
CTDNEP1-201ENST00000318988 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.73
CTDNEP1-201ENST00000318988 SPRED3Q2MJR0 410 aa25.83■■□□□ 1.73
CTDNEP1-201ENST00000318988 DHDDSQ86SQ9 333 aa25.83■■□□□ 1.73
CTDNEP1-201ENST00000318988 GALNT15Q8N3T1 639 aa25.83■■□□□ 1.73
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