RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000297157.7

RP9-201, Transcript of RP9, pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene RP9, Length 1,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RP9-201ENST00000297157 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
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RP9-201ENST00000297157 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP23.86■■□□□ 1.41
RP9-201ENST00000297157 UNC50Q53HI1 259 aa23.86■■□□□ 1.41
RP9-201ENST00000297157 ZNF766Q5HY98 468 aa23.86■■□□□ 1.41
RP9-201ENST00000297157 ZNF678Q5SXM1 525 aa23.86■■□□□ 1.41
RP9-201ENST00000297157 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
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RP9-201ENST00000297157 ZNF595Q8IYB9 648 aa23.86■■□□□ 1.41
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RP9-201ENST00000297157 ETHE1O95571 254 aa23.85■■□□□ 1.41
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RP9-201ENST00000297157 OR4F6Q8NGB9 312 aa23.84■■□□□ 1.41
RP9-201ENST00000297157 RGMAQ96B86 450 aa23.84■■□□□ 1.41
RP9-201ENST00000297157 ZNF354BQ96LW1 612 aa23.84■■□□□ 1.41
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RP9-201ENST00000297157 A8MUI8 341 aa23.82■■□□□ 1.4
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RP9-201ENST00000297157 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP23.82■■□□□ 1.4
RP9-201ENST00000297157 ATP6V1E2Q96A05 226 aa23.82■■□□□ 1.4
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RP9-201ENST00000297157 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa23.82■■□□□ 1.4
RP9-201ENST00000297157 ZNF382Q96SR6 550 aa23.82■■□□□ 1.4
RP9-201ENST00000297157 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP23.82■■□□□ 1.4
RP9-201ENST00000297157 PARD6BQ9BYG5 372 aa23.82■■□□□ 1.4
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