RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 CALML6Q8TD86 181 aa7.24□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 SNF8Q96H20 258 aa7.24□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 MED18Q9BUE0 208 aa7.24□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 PRDM14Q9GZV8 571 aa7.24□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 PRM3Q9NNZ6 103 aa7.24□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 GALNT8Q9NY28 637 aa7.24□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 JKAMPQ9P055 326 aa7.24□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 AMFRQ9UKV5 643 aa7.24□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 DHRS7Q9Y394 339 aa7.24□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 A0A0G2JMM0 328 aa7.23□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 A0A1W2PPB8 328 aa7.23□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 A0A1W2PRS3 328 aa7.23□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 KIR3DP1A8MWS1 328 aa7.23□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 CTNSO60931 367 aa7.23□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 MFAP3LO75121 409 aa7.23□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 SNX4O95219 450 aa7.23□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 CCL3P10147 92 aa7.23□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 NPPBP16860 134 aa7.23□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 CHMP24386 653 aa7.23□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 RPL22P35268 128 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 CPOXP36551 454 aa7.23□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 PIGAP37287 484 aa7.23□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 MC3RP41968 323 aa7.23□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 MSH2P43246 934 aa7.23□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 SCTRP47872 440 aa7.23□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 TRPC1P48995 793 aa7.23□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 PCYT1AP49585 367 aa7.23□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 TMED10P49755 219 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 GDF10P55107 478 aa7.23□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 AP1S2P56377 157 aa7.23□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 BTN3A2P78410 334 aa7.23□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 CDK16Q00536 496 aa7.23□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 CUL1Q13616 776 aa7.23□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 TOMM20Q15388 145 aa7.23□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 NEPROQ6NW34 567 aa7.23□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 TRIM40Q6P9F5 258 aa7.23□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 ENPP6Q6UWR7 440 aa7.23□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 SEM1Q6ZVN7 128 aa7.23□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC29A4Q7RTT9 530 aa7.23□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 PEX26Q7Z412 305 aa7.23□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 MILR1Q7Z6M3 343 aa7.23□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 PACS2Q86VP3 889 aa7.23□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 CILP2Q8IUL8 1156 aa7.23□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 CCDC170Q8IYT3 715 aa7.23□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 TAGAPQ8N103 731 aa7.23□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM13CQ8NE31 585 aa7.23□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 OR4K1Q8NGD4 311 aa7.23□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 PAQR8Q8TEZ7 354 aa7.23□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC5A11Q8WWX8 675 aa7.23□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 GAL3ST3Q96A11 431 aa7.23□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 PIK3IP1Q96FE7 263 aa7.23□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 RUNDC3BQ96NL0 473 aa7.23□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 TIMP4Q99727 224 aa7.23□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC39A3Q9BRY0 314 aa7.23□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 KIFC1Q9BW19 673 aa7.23□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 SGPP1Q9BX95 441 aa7.23□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 ROGDIQ9GZN7 287 aa7.23□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC6A15Q9H2J7 730 aa7.23□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 PELI2Q9HAT8 420 aa7.23□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 FANCFQ9NPI8 374 aa7.23□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 ARL15Q9NXU5 204 aa7.23□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 VTI1BQ9UEU0 232 aa7.23□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 PACSIN3Q9UKS6 424 aa7.23□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa7.23□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 KCNE2Q9Y6J6 123 aa7.23□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 ARID1AO14497 2285 aa7.22□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 UQCRHLA0A096LP55 91 aa7.22□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 SYCE3A1L190 88 aa7.22□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 MAGEB16A2A368 324 aa7.22□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 ANKRD33BA6NCL7 494 aa7.22□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 C17orf105B2RV13 164 aa7.22□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 CTIFO43310 598 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 ACTL6AO96019 429 aa7.22□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 C1QAP02745 245 aa7.22□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 PAX1P15863 534 aa7.22□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 NMBRP28336 390 aa7.22□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 IDUAP35475 653 aa7.22□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 GRIA1P42261 906 aa7.22□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 ATP5J2P56134 94 aa7.22□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 BASP1P80723 227 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 ASPHQ12797 758 aa7.22□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 CTBP1Q13363 440 aa7.22□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 VEZF1Q14119 521 aa7.22□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 FGFBP1Q14512 234 aa7.22□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 PIGGQ5H8A4 983 aa7.22□□□□□ -1.25
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