RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296098.4

TRIM54-201, Transcript of tripartite motif containing 54, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRIM54, Length 2,027 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54-201ENST00000296098 C17orf62Q9BQA9 187 aa22.77■■□□□ 1.24
TRIM54-201ENST00000296098 RHNO1Q9BSD3 238 aa22.77■■□□□ 1.24
TRIM54-201ENST00000296098 APOOQ9BUR5 198 aa22.77■■□□□ 1.24
TRIM54-201ENST00000296098 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
TRIM54-201ENST00000296098 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
TRIM54-201ENST00000296098 RLIMQ9NVW2 624 aa22.77■■□□□ 1.24
TRIM54-201ENST00000296098 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 MAP2K4P45985 399 aa22.76■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 UAP1L1Q3KQV9 507 aa22.76■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 TMEM35AQ53FP2 167 aa22.76■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 TMEM196Q5HYL7 178 aa22.76■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 C6orf120Q7Z4R8 191 aa22.76■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 ZNF605Q86T29 641 aa22.76■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa22.76■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 UBE2FQ969M7 185 aa22.76■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 RNF6Q9Y252 685 aa22.76■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 LRIT2A6NDA9 550 aa22.75■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 CD6P30203 668 aa22.75■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 GRK3P35626 688 aa22.75■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 BCL6P41182 706 aa22.75■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 GSSP48637 474 aa22.75■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 MASP1P48740 699 aa22.75■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 SDE2Q6IQ49 451 aa22.75■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 AMER3Q8N944 861 aa22.75■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 TANKQ92844 425 aa22.75■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 TMEM19Q96HH6 336 aa22.75■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 GABRG3Q99928 467 aa22.75■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 AICDAQ9GZX7 198 aa22.75■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 SLC6A20Q9NP91 592 aa22.75■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 SNX11Q9Y5W9 270 aa22.75■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 MAN1A2O60476 641 aa22.75■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 GADD45GO95257 159 aa22.75■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 RHCEP18577 417 aa22.75■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 LIMS1P48059 325 aa22.75■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 CSNK2BP67870 215 aa22.75■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 MVKQ03426 396 aa22.75■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 KCNC4Q03721 635 aa22.75■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 CCDC81Q6ZN84 652 aa22.75■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 CROCCP3Q8IVE0 287 aa22.75■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 FAM81AQ8TBF8 368 aa22.75■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa22.75■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 PSD2Q9BQI7 771 aa22.75■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 DPH7Q9BTV6 452 aa22.75■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 PRDM8Q9NQV8 689 aa22.75■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 ACER3Q9NUN7 267 aa22.75■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa22.75■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 PPM1DO15297 605 aa22.74■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 B4GALT2O60909 372 aa22.74■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 FADS2O95864 444 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 RECKO95980 971 aa22.74■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 DRD2P14416 443 aa22.74■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 MLC1Q15049 377 aa22.74■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 RPE65Q16518 533 aa22.74■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 DUSP7Q16829 419 aa22.74■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa22.74■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 ZNF793Q6ZN11 406 aa22.74■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 PRSS48Q7RTY5 328 aa22.74■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 FAM20CQ8IXL6 584 aa22.74■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 OR9Q2Q8NGE9 314 aa22.74■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 PSMA8Q8TAA3 256 aa22.74■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 ZNF556Q9HAH1 456 aa22.74■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 FBRSQ9HAH7 460 aa22.74■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 TAS2R7Q9NYW3 318 aa22.74■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa22.74■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa22.74■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 TBC1D3EA0A087X179 549 aa22.74■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa22.74■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 TBC1D3LB9A6J9 549 aa22.74■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 PDE9AO76083 593 aa22.74■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 CCNB2O95067 398 aa22.74■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 VIPP01282 170 aa22.74■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 TBC1D3HP0C7X1 549 aa22.74■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 ABATP80404 500 aa22.74■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 AQP6Q13520 282 aa22.74■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 TP53BP2Q13625 1128 aa22.74■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 GANABQ14697 944 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 ZIC1Q15915 447 aa22.74■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa22.74■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa22.74■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 AHSA2Q719I0 299 aa22.74■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 P3H2Q8IVL5 708 aa22.74■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 RAB8BQ92930 207 aa22.74■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 FAIM2Q9BWQ8 316 aa22.74■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 MCOLN1Q9GZU1 580 aa22.74■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 FGF22Q9HCT0 170 aa22.74■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 EHD3Q9NZN3 535 aa22.74■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 HMGN4O00479 90 aa22.73■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 HAT1O14929 419 aa22.73■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 SCAMP1O15126 338 aa22.73■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 STATHP02808 62 aa22.73■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 TFPTP0C1Z6 253 aa22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.4 ms