RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295317.3

RNF149-201, Transcript of ring finger protein 149, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RNF149, Length 2,458 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF149-201ENST00000295317 NUDT13Q86X67 352 aa20.48■□□□□ 0.87
RNF149-201ENST00000295317 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
RNF149-201ENST00000295317 TANKQ92844 425 aa20.48■□□□□ 0.87
RNF149-201ENST00000295317 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
RNF149-201ENST00000295317 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
RNF149-201ENST00000295317 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
RNF149-201ENST00000295317 ERI3O43414 337 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
RNF149-201ENST00000295317 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
RNF149-201ENST00000295317 CTHP32929 405 aa20.47■□□□□ 0.87
RNF149-201ENST00000295317 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP20.47■□□□□ 0.87
RNF149-201ENST00000295317 OR4C11Q6IEV9 310 aa20.47■□□□□ 0.87
RNF149-201ENST00000295317 LGI4Q8N135 537 aa20.47■□□□□ 0.87
RNF149-201ENST00000295317 OR10G2Q8NGC3 310 aa20.47■□□□□ 0.87
RNF149-201ENST00000295317 GIPC3Q8TF64 312 aa20.47■□□□□ 0.87
RNF149-201ENST00000295317 FBLIM1Q8WUP2 373 aa20.47■□□□□ 0.87
RNF149-201ENST00000295317 TMEM19Q96HH6 336 aa20.47■□□□□ 0.87
RNF149-201ENST00000295317 EPYCQ99645 322 aa20.47■□□□□ 0.87
RNF149-201ENST00000295317 DOK1Q99704 481 aa20.47■□□□□ 0.87
RNF149-201ENST00000295317 FUNDC2Q9BWH2 189 aa20.47■□□□□ 0.87
RNF149-201ENST00000295317 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa20.47■□□□□ 0.87
RNF149-201ENST00000295317 SNX5Q9Y5X3 404 aa20.47■□□□□ 0.87
RNF149-201ENST00000295317 WBP4O75554 376 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
RNF149-201ENST00000295317 KRT75O95678 551 aa20.47■□□□□ 0.87
RNF149-201ENST00000295317 ALDH4A1P30038 563 aa20.47■□□□□ 0.87
RNF149-201ENST00000295317 PKLRP30613 574 aa20.47■□□□□ 0.87
RNF149-201ENST00000295317 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
RNF149-201ENST00000295317 LSM3P62310 102 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
RNF149-201ENST00000295317 DUSP2Q05923 314 aa20.47■□□□□ 0.87
RNF149-201ENST00000295317 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
RNF149-201ENST00000295317 AGERQ15109 404 aa20.47■□□□□ 0.87
RNF149-201ENST00000295317 UAP1L1Q3KQV9 507 aa20.47■□□□□ 0.87
RNF149-201ENST00000295317 ENPP7Q6UWV6 458 aa20.47■□□□□ 0.87
RNF149-201ENST00000295317 PAGE2Q7Z2X7 111 aa20.47■□□□□ 0.87
RNF149-201ENST00000295317 OR1E3Q8WZA6 343 aa20.47■□□□□ 0.87
RNF149-201ENST00000295317 KLHL25Q9H0H3 589 aa20.47■□□□□ 0.87
RNF149-201ENST00000295317 CLDND1Q9NY35 253 aa20.47■□□□□ 0.87
RNF149-201ENST00000295317 SPATA7Q9P0W8 599 aa20.47■□□□□ 0.87
RNF149-201ENST00000295317 FBXW2Q9UKT8 454 aa20.47■□□□□ 0.87
RNF149-201ENST00000295317 BLOC1S6Q9UL45 172 aa20.47■□□□□ 0.87
RNF149-201ENST00000295317 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa20.47■□□□□ 0.87
RNF149-201ENST00000295317 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa20.46■□□□□ 0.87
RNF149-201ENST00000295317 SEMA3DO95025 777 aa20.46■□□□□ 0.87
RNF149-201ENST00000295317 FADS2O95864 444 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
RNF149-201ENST00000295317 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
RNF149-201ENST00000295317 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
RNF149-201ENST00000295317 MVKQ03426 396 aa20.46■□□□□ 0.87
RNF149-201ENST00000295317 DMPKQ09013 629 aa20.46■□□□□ 0.87
RNF149-201ENST00000295317 HYAL2Q12891 473 aa20.46■□□□□ 0.87
RNF149-201ENST00000295317 MAPK11Q15759 364 aa20.46■□□□□ 0.87
RNF149-201ENST00000295317 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
RNF149-201ENST00000295317 ENTHD1Q8IYW4 607 aa20.46■□□□□ 0.87
RNF149-201ENST00000295317 SHISA5Q8N114 240 aa20.46■□□□□ 0.87
RNF149-201ENST00000295317 ZNF540Q8NDQ6 660 aa20.46■□□□□ 0.87
RNF149-201ENST00000295317 APH1BQ8WW43 257 aa20.46■□□□□ 0.87
RNF149-201ENST00000295317 PCBD2Q9H0N5 130 aa20.46■□□□□ 0.87
RNF149-201ENST00000295317 LMAN2LQ9H0V9 348 aa20.46■□□□□ 0.87
RNF149-201ENST00000295317 ATG4BQ9Y4P1 393 aa20.46■□□□□ 0.87
RNF149-201ENST00000295317 PRSS38A1L453 326 aa20.46■□□□□ 0.87
RNF149-201ENST00000295317 SEMA7AO75326 666 aa20.46■□□□□ 0.87
RNF149-201ENST00000295317 HSD17B2P37059 387 aa20.46■□□□□ 0.87
RNF149-201ENST00000295317 IDH2P48735 452 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
RNF149-201ENST00000295317 MASP1P48740 699 aa20.46■□□□□ 0.87
RNF149-201ENST00000295317 NUDT6P53370 316 aa20.46■□□□□ 0.87
RNF149-201ENST00000295317 LRRC32Q14392 662 aa20.46■□□□□ 0.87
RNF149-201ENST00000295317 TMEM236Q5W0B7 351 aa20.46■□□□□ 0.87
RNF149-201ENST00000295317 C18orf63Q68DL7 685 aa20.46■□□□□ 0.87
RNF149-201ENST00000295317 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
RNF149-201ENST00000295317 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa20.46■□□□□ 0.87
RNF149-201ENST00000295317 AHSA2Q719I0 299 aa20.46■□□□□ 0.87
RNF149-201ENST00000295317 TRIM73Q86UV7 250 aa20.46■□□□□ 0.87
RNF149-201ENST00000295317 SFTPA2Q8IWL1 248 aa20.46■□□□□ 0.87
RNF149-201ENST00000295317 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
RNF149-201ENST00000295317 LZICQ8WZA0 190 aa20.46■□□□□ 0.87
RNF149-201ENST00000295317 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
RNF149-201ENST00000295317 SIPA1Q96FS4 1042 aa20.46■□□□□ 0.87
RNF149-201ENST00000295317 TIMM29Q9BSF4 260 aa20.46■□□□□ 0.87
RNF149-201ENST00000295317 RAD21L1Q9H4I0 556 aa20.46■□□□□ 0.87
RNF149-201ENST00000295317 KCNK12Q9HB15 430 aa20.46■□□□□ 0.87
RNF149-201ENST00000295317 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa20.46■□□□□ 0.87
RNF149-201ENST00000295317 ISM1B1AKI9 464 aa20.45■□□□□ 0.86
RNF149-201ENST00000295317 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
RNF149-201ENST00000295317 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
RNF149-201ENST00000295317 LIM2P55344 173 aa20.45■□□□□ 0.86
RNF149-201ENST00000295317 NFATC3Q12968 1075 aa20.45■□□□□ 0.86
RNF149-201ENST00000295317 AQP6Q13520 282 aa20.45■□□□□ 0.86
RNF149-201ENST00000295317 KEAP1Q14145 624 aa20.45■□□□□ 0.86
RNF149-201ENST00000295317 GPR19Q15760 415 aa20.45■□□□□ 0.86
RNF149-201ENST00000295317 SYPL1Q16563 259 aa20.45■□□□□ 0.86
RNF149-201ENST00000295317 SAXO2Q658L1 398 aa20.45■□□□□ 0.86
RNF149-201ENST00000295317 COMTD1Q86VU5 262 aa20.45■□□□□ 0.86
RNF149-201ENST00000295317 OR2L3Q8NG85 312 aa20.45■□□□□ 0.86
RNF149-201ENST00000295317 OR4C15Q8NGM1 316 aa20.45■□□□□ 0.86
RNF149-201ENST00000295317 FAR1Q8WVX9 515 aa20.45■□□□□ 0.86
RNF149-201ENST00000295317 DNASE1L2Q92874 299 aa20.45■□□□□ 0.86
RNF149-201ENST00000295317 SELENONQ9NZV5 590 aa20.45■□□□□ 0.86
RNF149-201ENST00000295317 HMGN4O00479 90 aa20.45■□□□□ 0.86
RNF149-201ENST00000295317 FFAR1O14842 300 aa20.45■□□□□ 0.86
RNF149-201ENST00000295317 FAM20BO75063 409 aa20.45■□□□□ 0.86
RNF149-201ENST00000295317 MT-ND2P03891 347 aa20.45■□□□□ 0.86
RNF149-201ENST00000295317 OR12D1P0DN82 309 aa20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.4 ms