RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264896.7

SCARB2-201, Transcript of scavenger receptor class B member 2, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SCARB2, Length 4,792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2-201ENST00000264896 EPYCQ99645 322 aa16.87■□□□□ 0.29
SCARB2-201ENST00000264896 KXD1Q9BQD3 176 aa16.87■□□□□ 0.29
SCARB2-201ENST00000264896 DPH7Q9BTV6 452 aa16.87■□□□□ 0.29
SCARB2-201ENST00000264896 NTMT1Q9BV86 223 aa16.87■□□□□ 0.29
SCARB2-201ENST00000264896 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa16.87■□□□□ 0.29
SCARB2-201ENST00000264896 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
SCARB2-201ENST00000264896 MAP3K8P41279 467 aa16.87■□□□□ 0.29
SCARB2-201ENST00000264896 VLDLRP98155 873 aa16.87■□□□□ 0.29
SCARB2-201ENST00000264896 LIPKQ5VXJ0 399 aa16.87■□□□□ 0.29
SCARB2-201ENST00000264896 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP16.87■□□□□ 0.295e-8■■■■□ 23.5
SCARB2-201ENST00000264896 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
SCARB2-201ENST00000264896 CLDND1Q9NY35 253 aa16.87■□□□□ 0.29
SCARB2-201ENST00000264896 PHF24Q9UPV7 400 aa16.87■□□□□ 0.29
SCARB2-201ENST00000264896 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
SCARB2-201ENST00000264896 LRP5O75197 1615 aa16.87■□□□□ 0.29
SCARB2-201ENST00000264896 ISPDA4D126 451 aa16.86■□□□□ 0.29
SCARB2-201ENST00000264896 CD83Q01151 205 aa16.86■□□□□ 0.29
SCARB2-201ENST00000264896 DECR1Q16698 335 aa16.86■□□□□ 0.29
SCARB2-201ENST00000264896 PRRT3Q5FWE3 981 aa16.86■□□□□ 0.29
SCARB2-201ENST00000264896 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP16.86■□□□□ 0.29
SCARB2-201ENST00000264896 SUN3Q8TAQ9 357 aa16.86■□□□□ 0.29
SCARB2-201ENST00000264896 C15orf40Q8WUR7 153 aa16.86■□□□□ 0.29
SCARB2-201ENST00000264896 MAL2Q969L2 176 aa16.86■□□□□ 0.29
SCARB2-201ENST00000264896 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
SCARB2-201ENST00000264896 ACTL8Q9H568 366 aa16.86■□□□□ 0.29
SCARB2-201ENST00000264896 MVB12BQ9H7P6 319 aa16.86■□□□□ 0.29
SCARB2-201ENST00000264896 RPP14O95059 124 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
SCARB2-201ENST00000264896 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
SCARB2-201ENST00000264896 TSPAN5P62079 268 aa16.86■□□□□ 0.29
SCARB2-201ENST00000264896 EOGTQ5NDL2 527 aa16.86■□□□□ 0.29
SCARB2-201ENST00000264896 PRSS48Q7RTY5 328 aa16.86■□□□□ 0.29
SCARB2-201ENST00000264896 RELTQ969Z4 430 aa16.86■□□□□ 0.29
SCARB2-201ENST00000264896 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
SCARB2-201ENST00000264896 ENPP4Q9Y6X5 453 aa16.86■□□□□ 0.29
SCARB2-201ENST00000264896 PCDHGA12O60330 932 aa16.86■□□□□ 0.29
SCARB2-201ENST00000264896 SDC1P18827 310 aa16.86■□□□□ 0.29
SCARB2-201ENST00000264896 NRG3P56975 720 aa16.86■□□□□ 0.29
SCARB2-201ENST00000264896 UNC5DQ6UXZ4 953 aa16.86■□□□□ 0.29
SCARB2-201ENST00000264896 CEP68Q76N32 757 aa16.86■□□□□ 0.29
SCARB2-201ENST00000264896 SLC5A8Q8N695 610 aa16.86■□□□□ 0.29
SCARB2-201ENST00000264896 PSD4Q8NDX1 1056 aa16.86■□□□□ 0.29
SCARB2-201ENST00000264896 C16orf78Q8WTQ4 265 aa16.86■□□□□ 0.29
SCARB2-201ENST00000264896 PHOX2BQ99453 314 aa16.86■□□□□ 0.29
SCARB2-201ENST00000264896 FAM83CQ9BQN1 747 aa16.86■□□□□ 0.29
SCARB2-201ENST00000264896 CTSAP10619 480 aa16.86■□□□□ 0.29
SCARB2-201ENST00000264896 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
SCARB2-201ENST00000264896 VEZF1Q14119 521 aa16.86■□□□□ 0.29
SCARB2-201ENST00000264896 TMEM35AQ53FP2 167 aa16.86■□□□□ 0.29
SCARB2-201ENST00000264896 MPP7Q5T2T1 576 aa16.86■□□□□ 0.29
SCARB2-201ENST00000264896 BTN2A1Q7KYR7 527 aa16.86■□□□□ 0.29
SCARB2-201ENST00000264896 LSMEM2Q8N112 164 aa16.86■□□□□ 0.29
SCARB2-201ENST00000264896 WACQ9BTA9 647 aa16.86■□□□□ 0.29
SCARB2-201ENST00000264896 DPAGT1Q9H3H5 408 aa16.86■□□□□ 0.29
SCARB2-201ENST00000264896 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
SCARB2-201ENST00000264896 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa16.86■□□□□ 0.29
SCARB2-201ENST00000264896 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa16.85■□□□□ 0.29
SCARB2-201ENST00000264896 ZNF860A6NHJ4 632 aa16.85■□□□□ 0.29
SCARB2-201ENST00000264896 PRODHO43272 600 aa16.85■□□□□ 0.29
SCARB2-201ENST00000264896 ITIH1P19827 911 aa16.85■□□□□ 0.29
SCARB2-201ENST00000264896 UBXN2BQ14CS0 331 aa16.85■□□□□ 0.29
SCARB2-201ENST00000264896 AKIRIN2Q53H80 203 aa16.85■□□□□ 0.29
SCARB2-201ENST00000264896 QSOX2Q6ZRP7 698 aa16.85■□□□□ 0.29
SCARB2-201ENST00000264896 ASPGQ86U10 573 aa16.85■□□□□ 0.29
SCARB2-201ENST00000264896 GID4Q8IVV7 300 aa16.85■□□□□ 0.29
SCARB2-201ENST00000264896 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
SCARB2-201ENST00000264896 NKD1Q969G9 470 aa16.85■□□□□ 0.29
SCARB2-201ENST00000264896 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
SCARB2-201ENST00000264896 HRASLS2Q9NWW9 162 aa16.85■□□□□ 0.29
SCARB2-201ENST00000264896 KLHL42Q9P2K6 505 aa16.85■□□□□ 0.29
SCARB2-201ENST00000264896 GMEB1Q9Y692 573 aa16.85■□□□□ 0.29
SCARB2-201ENST00000264896 ADAP00813 363 aa16.85■□□□□ 0.29
SCARB2-201ENST00000264896 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
SCARB2-201ENST00000264896 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
SCARB2-201ENST00000264896 S100GP29377 79 aa16.85■□□□□ 0.29
SCARB2-201ENST00000264896 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
SCARB2-201ENST00000264896 PHC1P78364 1004 aa16.85■□□□□ 0.29
SCARB2-201ENST00000264896 NFE2L1Q14494 772 aa16.85■□□□□ 0.29
SCARB2-201ENST00000264896 RUNDC3AQ59EK9 446 aa16.85■□□□□ 0.29
SCARB2-201ENST00000264896 TRIM73Q86UV7 250 aa16.85■□□□□ 0.29
SCARB2-201ENST00000264896 NAGSQ8N159 534 aa16.85■□□□□ 0.29
SCARB2-201ENST00000264896 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
SCARB2-201ENST00000264896 OR2T33Q8NG76 320 aa16.85■□□□□ 0.29
SCARB2-201ENST00000264896 LHPPQ9H008 270 aa16.85■□□□□ 0.29
SCARB2-201ENST00000264896 DKK3Q9UBP4 350 aa16.85■□□□□ 0.29
SCARB2-201ENST00000264896 IGLON5A6NGN9 336 aa16.85■□□□□ 0.29
SCARB2-201ENST00000264896 APOL3O95236 402 aa16.85■□□□□ 0.29
SCARB2-201ENST00000264896 KAT7O95251 611 aa16.85■□□□□ 0.29
SCARB2-201ENST00000264896 TYRP1P17643 537 aa16.85■□□□□ 0.29
SCARB2-201ENST00000264896 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
SCARB2-201ENST00000264896 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
SCARB2-201ENST00000264896 RGNQ15493 299 aa16.85■□□□□ 0.29
SCARB2-201ENST00000264896 IER5LQ5T953 404 aa16.85■□□□□ 0.29
SCARB2-201ENST00000264896 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
SCARB2-201ENST00000264896 SLC22A15Q8IZD6 547 aa16.85■□□□□ 0.29
SCARB2-201ENST00000264896 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa16.85■□□□□ 0.29
SCARB2-201ENST00000264896 PROKR1Q8TCW9 393 aa16.85■□□□□ 0.29
SCARB2-201ENST00000264896 HAVCR1Q96D42 359 aa16.85■□□□□ 0.29
SCARB2-201ENST00000264896 TMEM19Q96HH6 336 aa16.85■□□□□ 0.29
SCARB2-201ENST00000264896 PRRG4Q9BZD6 226 aa16.85■□□□□ 0.29
SCARB2-201ENST00000264896 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.9 ms