RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000257290.9

PDGFRA-201, Transcript of platelet derived growth factor receptor alpha, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDGFRA, Length 6,576 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRA-201ENST00000257290 BMP7P18075 431 aa6.5□□□□□ -1.37
PDGFRA-201ENST00000257290 GPD1P21695 349 aa6.5□□□□□ -1.37
PDGFRA-201ENST00000257290 ASPAP45381 313 aa6.5□□□□□ -1.37
PDGFRA-201ENST00000257290 GCNT1Q02742 428 aa6.5□□□□□ -1.37
PDGFRA-201ENST00000257290 ZNF460Q14592 562 aa6.5□□□□□ -1.37
PDGFRA-201ENST00000257290 ATP6V1FQ16864 119 aa6.5□□□□□ -1.37
PDGFRA-201ENST00000257290 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PDGFRA-201ENST00000257290 OR6B2Q6IFH4 312 aa6.5□□□□□ -1.37
PDGFRA-201ENST00000257290 SLC25A24Q6NUK1 477 aa6.5□□□□□ -1.37
PDGFRA-201ENST00000257290 GK5Q6ZS86 529 aa6.5□□□□□ -1.37
PDGFRA-201ENST00000257290 OR9A2Q8NGT5 310 aa6.5□□□□□ -1.37
PDGFRA-201ENST00000257290 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PDGFRA-201ENST00000257290 ZBTB8AQ96BR9 441 aa6.5□□□□□ -1.37
PDGFRA-201ENST00000257290 ZNF354BQ96LW1 612 aa6.5□□□□□ -1.37
PDGFRA-201ENST00000257290 PCBD2Q9H0N5 130 aa6.5□□□□□ -1.37
PDGFRA-201ENST00000257290 AKIP1Q9NQ31 210 aa6.5□□□□□ -1.37
PDGFRA-201ENST00000257290 ABCC13Q9NSE7 274 aa6.5□□□□□ -1.37
PDGFRA-201ENST00000257290 SIRT5Q9NXA8 310 aa6.5□□□□□ -1.37
PDGFRA-201ENST00000257290 NHSL1Q5SYE7 1610 aa6.5□□□□□ -1.37
PDGFRA-201ENST00000257290 FAM220BPB1ANY3 271 aa6.5□□□□□ -1.37
PDGFRA-201ENST00000257290 FFAR3O14843 346 aa6.5□□□□□ -1.37
PDGFRA-201ENST00000257290 GPR42O15529 346 aa6.5□□□□□ -1.37
PDGFRA-201ENST00000257290 OR2T1O43869 369 aa6.5□□□□□ -1.37
PDGFRA-201ENST00000257290 SLC19A2O60779 497 aa6.5□□□□□ -1.37
PDGFRA-201ENST00000257290 F9P00740 461 aa6.5□□□□□ -1.37
PDGFRA-201ENST00000257290 GIMD1P0DJR0 217 aa6.5□□□□□ -1.37
PDGFRA-201ENST00000257290 IRS1P35568 1242 aa6.5□□□□□ -1.37
PDGFRA-201ENST00000257290 MMP12P39900 470 aa6.5□□□□□ -1.37
PDGFRA-201ENST00000257290 IDH3AP50213 366 aa6.5□□□□□ -1.37
PDGFRA-201ENST00000257290 FCGRTP55899 365 aa6.5□□□□□ -1.37
PDGFRA-201ENST00000257290 TPI1P60174 286 aa6.5□□□□□ -1.37
PDGFRA-201ENST00000257290 USP53Q70EK8 1073 aa6.5□□□□□ -1.37
PDGFRA-201ENST00000257290 BTN2A2Q8WVV5 523 aa6.5□□□□□ -1.37
PDGFRA-201ENST00000257290 SLC39A7Q92504 469 aa6.5□□□□□ -1.37
PDGFRA-201ENST00000257290 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PDGFRA-201ENST00000257290 TFAP2CQ92754 450 aa6.5□□□□□ -1.37
PDGFRA-201ENST00000257290 ECHDC3Q96DC8 303 aa6.5□□□□□ -1.37
PDGFRA-201ENST00000257290 SCMH1Q96GD3 660 aa6.5□□□□□ -1.37
PDGFRA-201ENST00000257290 SLC38A2Q96QD8 506 aa6.5□□□□□ -1.37
PDGFRA-201ENST00000257290 TAAR1Q96RJ0 339 aa6.5□□□□□ -1.37
PDGFRA-201ENST00000257290 PKP4Q99569 1192 aa6.5□□□□□ -1.37
PDGFRA-201ENST00000257290 OSGEPQ9NPF4 335 aa6.5□□□□□ -1.37
PDGFRA-201ENST00000257290 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PDGFRA-201ENST00000257290 FAM198AQ9UFP1 575 aa6.5□□□□□ -1.37
PDGFRA-201ENST00000257290 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PDGFRA-201ENST00000257290 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa6.5□□□□□ -1.37
PDGFRA-201ENST00000257290 H0Y8G0 127 aa6.5□□□□□ -1.37
PDGFRA-201ENST00000257290 UBE2Q2LH0YL09 131 aa6.5□□□□□ -1.37
PDGFRA-201ENST00000257290 MPZL2O60487 215 aa6.5□□□□□ -1.37
PDGFRA-201ENST00000257290 CRYABP02511 175 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PDGFRA-201ENST00000257290 DLDP09622 509 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PDGFRA-201ENST00000257290 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PDGFRA-201ENST00000257290 BMPR1AP36894 532 aa6.5□□□□□ -1.37
PDGFRA-201ENST00000257290 BIDP55957 195 aa6.5□□□□□ -1.37
PDGFRA-201ENST00000257290 SELENOVP59797 346 aa6.5□□□□□ -1.37
PDGFRA-201ENST00000257290 NTRK2Q16620 822 aa6.5□□□□□ -1.37
PDGFRA-201ENST00000257290 DPY19L1Q2PZI1 675 aa6.5□□□□□ -1.37
PDGFRA-201ENST00000257290 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PDGFRA-201ENST00000257290 HSDL2Q6YN16 418 aa6.5□□□□□ -1.37
PDGFRA-201ENST00000257290 VTCN1Q7Z7D3 282 aa6.5□□□□□ -1.37
PDGFRA-201ENST00000257290 FAM156AQ8NDB6 213 aa6.5□□□□□ -1.37
PDGFRA-201ENST00000257290 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa6.5□□□□□ -1.37
PDGFRA-201ENST00000257290 MYLIPQ8WY64 445 aa6.5□□□□□ -1.37
PDGFRA-201ENST00000257290 OTUB2Q96DC9 234 aa6.5□□□□□ -1.37
PDGFRA-201ENST00000257290 FAHD2AQ96GK7 314 aa6.5□□□□□ -1.37
PDGFRA-201ENST00000257290 FEM1CQ96JP0 617 aa6.5□□□□□ -1.37
PDGFRA-201ENST00000257290 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PDGFRA-201ENST00000257290 YIPF4Q9BSR8 244 aa6.5□□□□□ -1.37
PDGFRA-201ENST00000257290 MECRQ9BV79 373 aa6.5□□□□□ -1.37
PDGFRA-201ENST00000257290 ASPNQ9BXN1 380 aa6.5□□□□□ -1.37
PDGFRA-201ENST00000257290 ABCG5Q9H222 651 aa6.5□□□□□ -1.37
PDGFRA-201ENST00000257290 BRF2Q9HAW0 419 aa6.5□□□□□ -1.37
PDGFRA-201ENST00000257290 PRDM9Q9NQV7 894 aa6.5□□□□□ -1.37
PDGFRA-201ENST00000257290 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PDGFRA-201ENST00000257290 STARD10Q9Y365 291 aa6.5□□□□□ -1.37
PDGFRA-201ENST00000257290 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa6.5□□□□□ -1.37
PDGFRA-201ENST00000257290 CYB5BO43169 146 aa6.49□□□□□ -1.37
PDGFRA-201ENST00000257290 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PDGFRA-201ENST00000257290 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PDGFRA-201ENST00000257290 PRAF2O60831 178 aa6.49□□□□□ -1.37
PDGFRA-201ENST00000257290 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP6.49□□□□□ -1.37
PDGFRA-201ENST00000257290 ABLIM3O94929 683 aa6.49□□□□□ -1.37
PDGFRA-201ENST00000257290 F2P00734 622 aa6.49□□□□□ -1.37
PDGFRA-201ENST00000257290 TXNP10599 105 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PDGFRA-201ENST00000257290 ADH6P28332 368 aa6.49□□□□□ -1.37
PDGFRA-201ENST00000257290 CTHP32929 405 aa6.49□□□□□ -1.37
PDGFRA-201ENST00000257290 ELK3P41970 407 aa6.49□□□□□ -1.37
PDGFRA-201ENST00000257290 S100A10P60903 97 aa6.49□□□□□ -1.37
PDGFRA-201ENST00000257290 P2RY14Q15391 338 aa6.49□□□□□ -1.37
PDGFRA-201ENST00000257290 COQ5Q5HYK3 327 aa6.49□□□□□ -1.37
PDGFRA-201ENST00000257290 PARGQ86W56 976 aa6.49□□□□□ -1.37
PDGFRA-201ENST00000257290 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PDGFRA-201ENST00000257290 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PDGFRA-201ENST00000257290 SMPDL3AQ92484 453 aa6.49□□□□□ -1.37
PDGFRA-201ENST00000257290 TPT1P8Q9HAU6 139 aa6.49□□□□□ -1.37
PDGFRA-201ENST00000257290 RHOFQ9HBH0 211 aa6.49□□□□□ -1.37
PDGFRA-201ENST00000257290 PDE7BQ9NP56 450 aa6.49□□□□□ -1.37
PDGFRA-201ENST00000257290 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PDGFRA-201ENST00000257290 FZD3Q9NPG1 666 aa6.49□□□□□ -1.37
PDGFRA-201ENST00000257290 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa6.49□□□□□ -1.37
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