RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000255476.2

RFXAP-201, Transcript of regulatory factor X associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RFXAP, Length 2,304 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAP-201ENST00000255476 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa20.02■□□□□ 0.79
RFXAP-201ENST00000255476 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.79
RFXAP-201ENST00000255476 PRKD3O94806 890 aa20.02■□□□□ 0.79
RFXAP-201ENST00000255476 GSTM5P46439 218 aa20.02■□□□□ 0.79
RFXAP-201ENST00000255476 CAPZBP47756 277 aa20.02■□□□□ 0.79
RFXAP-201ENST00000255476 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.79
RFXAP-201ENST00000255476 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa20.02■□□□□ 0.79
RFXAP-201ENST00000255476 OGFOD3Q6PK18 319 aa20.02■□□□□ 0.79
RFXAP-201ENST00000255476 PRSS41Q7RTY9 318 aa20.02■□□□□ 0.79
RFXAP-201ENST00000255476 RNF130Q86XS8 419 aa20.02■□□□□ 0.79
RFXAP-201ENST00000255476 GALNT4Q8N4A0 578 aa20.02■□□□□ 0.79
RFXAP-201ENST00000255476 TRIML2Q8N7C3 387 aa20.02■□□□□ 0.79
RFXAP-201ENST00000255476 AVL9Q8NBF6 648 aa20.02■□□□□ 0.79
RFXAP-201ENST00000255476 CAMKVQ8NCB2 501 aa20.02■□□□□ 0.79
RFXAP-201ENST00000255476 EDAQ92838 391 aa20.02■□□□□ 0.79
RFXAP-201ENST00000255476 EME1Q96AY2 570 aa20.02■□□□□ 0.79
RFXAP-201ENST00000255476 MAP3K3Q99759 626 aa20.02■□□□□ 0.79
RFXAP-201ENST00000255476 CIB1Q99828 191 aa20.02■□□□□ 0.79
RFXAP-201ENST00000255476 VCX3BQ9H321 246 aa20.02■□□□□ 0.79
RFXAP-201ENST00000255476 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa20.02■□□□□ 0.79
RFXAP-201ENST00000255476 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.79
RFXAP-201ENST00000255476 UNC13CQ8NB66 2214 aa20.01■□□□□ 0.79
RFXAP-201ENST00000255476 ZNF860A6NHJ4 632 aa20.01■□□□□ 0.79
RFXAP-201ENST00000255476 CKMT2P17540 419 aa20.01■□□□□ 0.79
RFXAP-201ENST00000255476 CDK9P50750 372 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
RFXAP-201ENST00000255476 ARFIP1P53367 373 aa20.01■□□□□ 0.79
RFXAP-201ENST00000255476 OLR1P78380 273 aa20.01■□□□□ 0.79
RFXAP-201ENST00000255476 TGM3Q08188 693 aa20.01■□□□□ 0.79
RFXAP-201ENST00000255476 CNPY1Q3B7I2 92 aa20.01■□□□□ 0.79
RFXAP-201ENST00000255476 C14orf28Q4W4Y0 310 aa20.01■□□□□ 0.79
RFXAP-201ENST00000255476 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa20.01■□□□□ 0.79
RFXAP-201ENST00000255476 NKAIN2Q5VXU1 208 aa20.01■□□□□ 0.79
RFXAP-201ENST00000255476 TMEM126BQ8IUX1 230 aa20.01■□□□□ 0.79
RFXAP-201ENST00000255476 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
RFXAP-201ENST00000255476 VCX3AQ9NNX9 186 aa20.01■□□□□ 0.79
RFXAP-201ENST00000255476 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa20.01■□□□□ 0.79
RFXAP-201ENST00000255476 FSCN3Q9NQT6 498 aa20.01■□□□□ 0.79
RFXAP-201ENST00000255476 PROM1O43490 865 aa20.01■□□□□ 0.79
RFXAP-201ENST00000255476 PEX1O43933 1283 aa20.01■□□□□ 0.79
RFXAP-201ENST00000255476 C8orf89P0DMQ9 161 aa20.01■□□□□ 0.79
RFXAP-201ENST00000255476 SMIM10L1P0DMW3 83 aa20.01■□□□□ 0.79
RFXAP-201ENST00000255476 ALPPL2P10696 532 aa20.01■□□□□ 0.79
RFXAP-201ENST00000255476 PPIBP23284 216 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
RFXAP-201ENST00000255476 FASP25445 335 aa20.01■□□□□ 0.79
RFXAP-201ENST00000255476 ALDH4A1P30038 563 aa20.01■□□□□ 0.79
RFXAP-201ENST00000255476 FRKP42685 505 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
RFXAP-201ENST00000255476 CTSKP43235 329 aa20.01■□□□□ 0.79
RFXAP-201ENST00000255476 TSFMP43897 325 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
RFXAP-201ENST00000255476 GFERP55789 205 aa20.01■□□□□ 0.79
RFXAP-201ENST00000255476 PMS2CLQ68D20 193 aa20.01■□□□□ 0.79
RFXAP-201ENST00000255476 ADCY4Q8NFM4 1077 aa20.01■□□□□ 0.79
RFXAP-201ENST00000255476 OR5P2Q8WZ92 322 aa20.01■□□□□ 0.79
RFXAP-201ENST00000255476 SMIM10Q96HG1 83 aa20.01■□□□□ 0.79
RFXAP-201ENST00000255476 TAS2R7Q9NYW3 318 aa20.01■□□□□ 0.79
RFXAP-201ENST00000255476 GMEB1Q9Y692 573 aa20.01■□□□□ 0.79
RFXAP-201ENST00000255476 RP1P56715 2156 aa20.01■□□□□ 0.79
RFXAP-201ENST00000255476 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
RFXAP-201ENST00000255476 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa20■□□□□ 0.79
RFXAP-201ENST00000255476 FKBP9O95302 570 aa20■□□□□ 0.79
RFXAP-201ENST00000255476 CAPNS1P04632 268 aa20■□□□□ 0.79
RFXAP-201ENST00000255476 DUSP2Q05923 314 aa20■□□□□ 0.79
RFXAP-201ENST00000255476 TEAD4Q15561 434 aa20■□□□□ 0.79
RFXAP-201ENST00000255476 WDR5BQ86VZ2 330 aa20■□□□□ 0.79
RFXAP-201ENST00000255476 THAP11Q96EK4 314 aa20■□□□□ 0.79
RFXAP-201ENST00000255476 GLIPR2Q9H4G4 154 aa20■□□□□ 0.79
RFXAP-201ENST00000255476 COQ10BQ9H8M1 238 aa20■□□□□ 0.79
RFXAP-201ENST00000255476 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
RFXAP-201ENST00000255476 RNF215Q9Y6U7 377 aa20■□□□□ 0.79
RFXAP-201ENST00000255476 LILRA5A6NI73 299 aa19.99■□□□□ 0.79
RFXAP-201ENST00000255476 SAC3D1A6NKF1 404 aa19.99■□□□□ 0.79
RFXAP-201ENST00000255476 RETP07949 1114 aa19.99■□□□□ 0.79
RFXAP-201ENST00000255476 AQP1P29972 269 aa19.99■□□□□ 0.79
RFXAP-201ENST00000255476 RPS26P62854 115 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
RFXAP-201ENST00000255476 RELAQ04206 551 aa19.99■□□□□ 0.79
RFXAP-201ENST00000255476 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
RFXAP-201ENST00000255476 SHBQ15464 509 aa19.99■□□□□ 0.79
RFXAP-201ENST00000255476 KLHL35Q6PF15 583 aa19.99■□□□□ 0.79
RFXAP-201ENST00000255476 CSNK1A1LQ8N752 337 aa19.99■□□□□ 0.79
RFXAP-201ENST00000255476 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
RFXAP-201ENST00000255476 OR52N2Q8NGI0 321 aa19.99■□□□□ 0.79
RFXAP-201ENST00000255476 KLHL6Q8WZ60 621 aa19.99■□□□□ 0.79
RFXAP-201ENST00000255476 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
RFXAP-201ENST00000255476 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
RFXAP-201ENST00000255476 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
RFXAP-201ENST00000255476 EHD3Q9NZN3 535 aa19.99■□□□□ 0.79
RFXAP-201ENST00000255476 BLOC1S6Q9UL45 172 aa19.99■□□□□ 0.79
RFXAP-201ENST00000255476 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
RFXAP-201ENST00000255476 CORO2BQ9UQ03 480 aa19.99■□□□□ 0.79
RFXAP-201ENST00000255476 A0A1B0GTW7 788 aa19.99■□□□□ 0.79
RFXAP-201ENST00000255476 B4GALT2O60909 372 aa19.99■□□□□ 0.79
RFXAP-201ENST00000255476 GIMD1P0DJR0 217 aa19.99■□□□□ 0.79
RFXAP-201ENST00000255476 UQCRC2P22695 453 aa19.99■□□□□ 0.79
RFXAP-201ENST00000255476 RUNX2Q13950 521 aa19.99■□□□□ 0.79
RFXAP-201ENST00000255476 NRF1Q16656 503 aa19.99■□□□□ 0.79
RFXAP-201ENST00000255476 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
RFXAP-201ENST00000255476 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
RFXAP-201ENST00000255476 AMDHD1Q96NU7 426 aa19.99■□□□□ 0.79
RFXAP-201ENST00000255476 TGM7Q96PF1 710 aa19.99■□□□□ 0.79
RFXAP-201ENST00000255476 SLC29A1Q99808 456 aa19.99■□□□□ 0.79
RFXAP-201ENST00000255476 CCDC3Q9BQI4 270 aa19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.8 ms