RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000248121.6

SYNGR3-201, Transcript of synaptogyrin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYNGR3, Length 2,051 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3-201ENST00000248121 OR8K5Q8NH50 307 aa22.13■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 OR5P2Q8WZ92 322 aa22.13■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 KLHL25Q9H0H3 589 aa22.13■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 CXorf56Q9H5V9 222 aa22.13■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 FSCN3Q9NQT6 498 aa22.13■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 GSAPA4D1B5 854 aa22.13■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 PGM3O95394 542 aa22.13■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 UQCRC2P22695 453 aa22.13■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 PPP2R2BQ00005 443 aa22.13■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 ELOCQ15369 112 aa22.13■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 IQCCQ4KMZ1 466 aa22.13■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 WDR45BQ5MNZ6 344 aa22.13■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 GCNT6Q5T4J0 391 aa22.13■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa22.13■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 PMS2CLQ68D20 193 aa22.13■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 KRT80Q6KB66 452 aa22.13■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 ZNF438Q7Z4V0 828 aa22.13■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 VN1R4Q7Z5H5 301 aa22.13■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 SVOPLQ8N434 492 aa22.13■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 OSBPL10Q9BXB5 764 aa22.13■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 PNPLA3Q9NST1 481 aa22.13■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 EVA1BQ9NVM1 165 aa22.13■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 PRAMEF10O60809 474 aa22.12■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 B4GALT2O60909 372 aa22.12■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 UGT2B7P16662 529 aa22.12■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 LSSP48449 732 aa22.12■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 APOFQ13790 326 aa22.12■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 LYSMD4Q5XG99 296 aa22.12■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 SPESP1Q6UW49 350 aa22.12■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 USP51Q70EK9 711 aa22.12■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 OR2L5Q8NG80 312 aa22.12■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 TMEM38AQ9H6F2 299 aa22.12■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 TAS2R7Q9NYW3 318 aa22.12■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 ASB4Q9Y574 426 aa22.12■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 SNX8Q9Y5X2 465 aa22.12■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 U3KQV3 271 aa22.12■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 FRYLO94915 3013 aa22.12■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 PCDH15Q96QU1 1955 aa22.12■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 hCG_2039718K7EN88 272 aa22.11■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 AQP9O43315 295 aa22.11■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 HRO43593 1189 aa22.11■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 NOBOXO60393 691 aa22.11■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 MANFP55145 182 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 C21orf59P57076 290 aa22.11■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 KIR2DS3Q14952 304 aa22.11■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 TEAD4Q15561 434 aa22.11■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 TMEM26Q6ZUK4 368 aa22.11■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 ACOT4Q8N9L9 421 aa22.11■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 OR5K1Q8NHB7 308 aa22.11■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 RSC1A1Q92681 617 aa22.11■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 ACTR10Q9NZ32 417 aa22.11■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 OR5K4A6NMS3 321 aa22.11■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 PIAS2O75928 621 aa22.11■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 DIRAS1O95057 198 aa22.11■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 HPRP00739 348 aa22.11■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 TFAP2AP05549 437 aa22.11■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 MAGP20916 626 aa22.11■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 PRKACGP22612 351 aa22.11■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 KCNJ10P78508 379 aa22.11■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 SLAMF1Q13291 335 aa22.11■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 SCARB2Q14108 478 aa22.11■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 TJAP1Q5JTD0 557 aa22.11■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 FBXO42Q6P3S6 717 aa22.11■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 TRIM40Q6P9F5 258 aa22.11■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 TBC1D19Q8N5T2 526 aa22.11■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 NATD1Q8N6N6 113 aa22.11■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 NFKBIDQ8NI38 313 aa22.11■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 KCNC2Q96PR1 638 aa22.11■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 USE1Q9NZ43 259 aa22.11■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa22.11■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 OR2A25A4D2G3 310 aa22.1■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 H3BNH8 94 aa22.1■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 H6PDO95479 791 aa22.1■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 KRT75O95678 551 aa22.1■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 PVRP15151 417 aa22.1■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 TYRP1P17643 537 aa22.1■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 CDK9P50750 372 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 RAB8AP61006 207 aa22.1■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 RBBP4Q09028 425 aa22.1■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 BNIP3Q12983 259 aa22.1■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 HSPB3Q12988 150 aa22.1■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 MYBPC3Q14896 1274 aa22.1■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 SAXO2Q658L1 398 aa22.1■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa22.1■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 OFCC1Q8IZS5 231 aa22.1■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 GAB3Q8WWW8 586 aa22.1■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 SLC22A18Q96BI1 424 aa22.1■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 TBC1D20Q96BZ9 403 aa22.1■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 TPD52L3Q96J77 140 aa22.1■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 C7orf34Q96L11 122 aa22.1■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.4 ms