RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000228918.8

LTBR-201, Transcript of lymphotoxin beta receptor, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene LTBR, Length 2,260 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBR-201ENST00000228918 HAT1O14929 419 aa15.5■□□□□ 0.07
LTBR-201ENST00000228918 DLGAP3O95886 979 aa15.5■□□□□ 0.07
LTBR-201ENST00000228918 ACADLP28330 430 aa15.5■□□□□ 0.07
LTBR-201ENST00000228918 VASPP50552 380 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
LTBR-201ENST00000228918 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
LTBR-201ENST00000228918 SAXO2Q658L1 398 aa15.5■□□□□ 0.07
LTBR-201ENST00000228918 HEATR4Q86WZ0 1026 aa15.5■□□□□ 0.07
LTBR-201ENST00000228918 HORMAD2Q8N7B1 307 aa15.5■□□□□ 0.07
LTBR-201ENST00000228918 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
LTBR-201ENST00000228918 NEURL3Q96EH8 262 aa15.5■□□□□ 0.07
LTBR-201ENST00000228918 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
LTBR-201ENST00000228918 IL17FQ96PD4 163 aa15.5■□□□□ 0.07
LTBR-201ENST00000228918 TAPBPLQ9BX59 468 aa15.5■□□□□ 0.07
LTBR-201ENST00000228918 SLAMF7Q9NQ25 335 aa15.5■□□□□ 0.07
LTBR-201ENST00000228918 SAGE1Q9NXZ1 904 aa15.5■□□□□ 0.07
LTBR-201ENST00000228918 NOX1Q9Y5S8 564 aa15.5■□□□□ 0.07
LTBR-201ENST00000228918 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
LTBR-201ENST00000228918 ARHGAP33O14559 1287 aa15.49■□□□□ 0.07
LTBR-201ENST00000228918 PI15O43692 258 aa15.49■□□□□ 0.07
LTBR-201ENST00000228918 ADAP00813 363 aa15.49■□□□□ 0.07
LTBR-201ENST00000228918 BCHEP06276 602 aa15.49■□□□□ 0.07
LTBR-201ENST00000228918 SPNP16150 400 aa15.49■□□□□ 0.07
LTBR-201ENST00000228918 POU1F1P28069 291 aa15.49■□□□□ 0.07
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LTBR-201ENST00000228918 DGKEP52429 567 aa15.49■□□□□ 0.07
LTBR-201ENST00000228918 RPS26P62854 115 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
LTBR-201ENST00000228918 NFE2L1Q14494 772 aa15.49■□□□□ 0.07
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LTBR-201ENST00000228918 RAET1GQ6H3X3 334 aa15.49■□□□□ 0.07
LTBR-201ENST00000228918 LCTLQ6UWM7 567 aa15.49■□□□□ 0.07
LTBR-201ENST00000228918 FAM129CQ86XR2 697 aa15.49■□□□□ 0.07
LTBR-201ENST00000228918 GPR32P1Q8NGA4 272 aa15.49■□□□□ 0.07
LTBR-201ENST00000228918 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
LTBR-201ENST00000228918 NUS1Q96E22 293 aa15.49■□□□□ 0.07
LTBR-201ENST00000228918 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa15.49■□□□□ 0.07
LTBR-201ENST00000228918 DPEP2Q9H4A9 486 aa15.49■□□□□ 0.07
LTBR-201ENST00000228918 SLC25A19Q9HC21 320 aa15.49■□□□□ 0.07
LTBR-201ENST00000228918 A4GALTQ9NPC4 353 aa15.49■□□□□ 0.07
LTBR-201ENST00000228918 FZD3Q9NPG1 666 aa15.49■□□□□ 0.07
LTBR-201ENST00000228918 C11orf16Q9NQ32 467 aa15.49■□□□□ 0.07
LTBR-201ENST00000228918 POU2F3Q9UKI9 436 aa15.49■□□□□ 0.07
LTBR-201ENST00000228918 CFL2Q9Y281 166 aa15.49■□□□□ 0.07
LTBR-201ENST00000228918 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa15.49■□□□□ 0.07
LTBR-201ENST00000228918 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa15.49■□□□□ 0.07
LTBR-201ENST00000228918 PLPP1O14494 284 aa15.48■□□□□ 0.07
LTBR-201ENST00000228918 PAPLNO95428 1278 aa15.48■□□□□ 0.07
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LTBR-201ENST00000228918 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
LTBR-201ENST00000228918 DNTTP04053 509 aa15.48■□□□□ 0.07
LTBR-201ENST00000228918 LINC00271P0C7V0 271 aa15.48■□□□□ 0.07
LTBR-201ENST00000228918 ALOX12P18054 663 aa15.48■□□□□ 0.07
LTBR-201ENST00000228918 DDCP20711 480 aa15.48■□□□□ 0.07
LTBR-201ENST00000228918 RCVRNP35243 200 aa15.48■□□□□ 0.07
LTBR-201ENST00000228918 GPR1P46091 355 aa15.48■□□□□ 0.07
LTBR-201ENST00000228918 DEFB115Q30KQ5 88 aa15.48■□□□□ 0.07
LTBR-201ENST00000228918 LEXMQ3ZCV2 418 aa15.48■□□□□ 0.07
LTBR-201ENST00000228918 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
LTBR-201ENST00000228918 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa15.48■□□□□ 0.07
LTBR-201ENST00000228918 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
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LTBR-201ENST00000228918 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
LTBR-201ENST00000228918 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
LTBR-201ENST00000228918 SIAEQ9HAT2 523 aa15.48■□□□□ 0.07
LTBR-201ENST00000228918 TMEM39AQ9NV64 488 aa15.48■□□□□ 0.07
LTBR-201ENST00000228918 REV1Q9UBZ9 1251 aa15.48■□□□□ 0.07
LTBR-201ENST00000228918 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
LTBR-201ENST00000228918 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
LTBR-201ENST00000228918 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa15.48■□□□□ 0.07
LTBR-201ENST00000228918 C5orf58C9J3I9 102 aa15.48■□□□□ 0.07
LTBR-201ENST00000228918 TLR4O00206 839 aa15.48■□□□□ 0.07
LTBR-201ENST00000228918 FKTNO75072 461 aa15.48■□□□□ 0.07
LTBR-201ENST00000228918 POP7O75817 140 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
LTBR-201ENST00000228918 RHOP08100 348 aa15.48■□□□□ 0.07
LTBR-201ENST00000228918 OSMP13725 252 aa15.48■□□□□ 0.07
LTBR-201ENST00000228918 ALDH9A1P49189 494 aa15.48■□□□□ 0.07
LTBR-201ENST00000228918 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP15.48■□□□□ 0.071e-8■■■■■ 29.1
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LTBR-201ENST00000228918 ZNF765Q7L2R6 523 aa15.48■□□□□ 0.07
LTBR-201ENST00000228918 CCDC190Q86UF4 302 aa15.48■□□□□ 0.07
LTBR-201ENST00000228918 KRT78Q8N1N4 520 aa15.48■□□□□ 0.07
LTBR-201ENST00000228918 OR5P2Q8WZ92 322 aa15.48■□□□□ 0.07
LTBR-201ENST00000228918 OTUB2Q96DC9 234 aa15.48■□□□□ 0.07
LTBR-201ENST00000228918 OPALINQ96PE5 141 aa15.48■□□□□ 0.07
LTBR-201ENST00000228918 NDOR1Q9UHB4 597 aa15.48■□□□□ 0.07
LTBR-201ENST00000228918 MKLN1Q9UL63 735 aa15.48■□□□□ 0.07
LTBR-201ENST00000228918 PLAGL1Q9UM63 463 aa15.48■□□□□ 0.07
LTBR-201ENST00000228918 SNPHO15079 494 aa15.47■□□□□ 0.07
LTBR-201ENST00000228918 SEMA7AO75326 666 aa15.47■□□□□ 0.07
LTBR-201ENST00000228918 ENTPD6O75354 484 aa15.47■□□□□ 0.07
LTBR-201ENST00000228918 MFN2O95140 757 aa15.47■□□□□ 0.07
LTBR-201ENST00000228918 SNX4O95219 450 aa15.47■□□□□ 0.07
LTBR-201ENST00000228918 RB1P06400 928 aa15.47■□□□□ 0.07
LTBR-201ENST00000228918 CISD3P0C7P0 127 aa15.47■□□□□ 0.07
LTBR-201ENST00000228918 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
LTBR-201ENST00000228918 DGKGP49619 791 aa15.47■□□□□ 0.07
LTBR-201ENST00000228918 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
LTBR-201ENST00000228918 TP53BP2Q13625 1128 aa15.47■□□□□ 0.07
LTBR-201ENST00000228918 SEC23BQ15437 767 aa15.47■□□□□ 0.07
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