RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 C2CD3Q4AC94 2353 aa22.78■■□□□ 1.24
CAPNS1-216ENST00000628306 SERTM1A2A2V5 107 aa22.77■■□□□ 1.24
CAPNS1-216ENST00000628306 OR4F21O95013 312 aa22.77■■□□□ 1.24
CAPNS1-216ENST00000628306 CLDN9O95484 217 aa22.77■■□□□ 1.24
CAPNS1-216ENST00000628306 PCSK2P16519 638 aa22.77■■□□□ 1.24
CAPNS1-216ENST00000628306 EPORP19235 508 aa22.77■■□□□ 1.24
CAPNS1-216ENST00000628306 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
CAPNS1-216ENST00000628306 CASP2P42575 452 aa22.77■■□□□ 1.24
CAPNS1-216ENST00000628306 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
CAPNS1-216ENST00000628306 E2F2Q14209 437 aa22.77■■□□□ 1.24
CAPNS1-216ENST00000628306 SPRED3Q2MJR0 410 aa22.77■■□□□ 1.24
CAPNS1-216ENST00000628306 SMU1Q2TAY7 513 aa22.77■■□□□ 1.24
CAPNS1-216ENST00000628306 XKR7Q5GH72 579 aa22.77■■□□□ 1.24
CAPNS1-216ENST00000628306 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
CAPNS1-216ENST00000628306 LETMD1Q6P1Q0 360 aa22.77■■□□□ 1.24
CAPNS1-216ENST00000628306 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa22.77■■□□□ 1.24
CAPNS1-216ENST00000628306 ASRGL1Q7L266 308 aa22.77■■□□□ 1.24
CAPNS1-216ENST00000628306 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa22.77■■□□□ 1.24
CAPNS1-216ENST00000628306 RIC8BQ9NVN3 520 aa22.77■■□□□ 1.24
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM45AQ9NWC5 275 aa22.77■■□□□ 1.24
CAPNS1-216ENST00000628306 TAGLN3Q9UI15 199 aa22.77■■□□□ 1.24
CAPNS1-216ENST00000628306 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
CAPNS1-216ENST00000628306 HIVEP1P15822 2718 aa22.77■■□□□ 1.24
CAPNS1-216ENST00000628306 A0A1B0GUH1 482 aa22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 PRSS44E7EML9 344 aa22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 E9PBE3 544 aa22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 PCDH17O14917 1159 aa22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 PIP5K1BO14986 540 aa22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 NRP2O60462 931 aa22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 JRKO75564 520 aa22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 PRR35P0CG20 571 aa22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 CCND1P24385 295 aa22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 IMPA1P29218 277 aa22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 SOX11P35716 441 aa22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 KCNK10P57789 538 aa22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 NCALDP61601 193 aa22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 GRM7Q14831 915 aa22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 LIPJQ5W064 366 aa22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 ATG9BQ674R7 924 aa22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 OR2L8Q8NGY9 312 aa22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 CMTM5Q96DZ9 223 aa22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 PHF12Q96QT6 1004 aa22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 OLAHQ9NV23 265 aa22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 ARL8BQ9NVJ2 186 aa22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 CAPN7Q9Y6W3 813 aa22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 MAU2Q9Y6X3 613 aa22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 PKDREJQ9NTG1 2253 aa22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 CFAP73A6NFT4 308 aa22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF839A8K0R7 811 aa22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC16A8O95907 504 aa22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 HPP00738 406 aa22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 ERGP11308 486 aa22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 NXNQ6DKJ4 435 aa22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM180AQ6UWF9 173 aa22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 TRIM46Q7Z4K8 759 aa22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 SPATA19Q7Z5L4 167 aa22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 TREML1Q86YW5 311 aa22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 BCORP1Q8N888 145 aa22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 CDYL2Q8N8U2 506 aa22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 SGPP1Q9BX95 441 aa22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 LRMDAQ9H2I8 198 aa22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 AKTIPQ9H8T0 292 aa22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 SPATA7Q9P0W8 599 aa22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 ARMCX1Q9P291 453 aa22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC22A14Q9Y267 594 aa22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 KLK4Q9Y5K2 254 aa22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 ZFHX3Q15911 3703 aa22.75■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 UBDO15205 165 aa22.75■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 WFS1O76024 890 aa22.75■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 LBPP18428 481 aa22.75■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 KLC1Q07866 573 aa22.75■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 KLF10Q13118 480 aa22.75■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 HERC3Q15034 1050 aa22.75■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 TCTE1Q5JU00 501 aa22.75■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 FRMPD2BQ6IN97 320 aa22.75■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 AMER2Q8N7J2 671 aa22.75■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 STT3BQ8TCJ2 826 aa22.75■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF480Q8WV37 535 aa22.75■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 C8orf44Q96CB5 159 aa22.75■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 C3orf30Q96M34 536 aa22.75■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 KCNA7Q96RP8 456 aa22.75■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 MIPEPQ99797 713 aa22.75■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF160Q9HCG1 818 aa22.75■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 FIS1Q9Y3D6 152 aa22.75■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 TIMM22Q9Y584 194 aa22.75■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 NPIPB8E9PQR5 432 aa22.74■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 KRT6AP02538 564 aa22.74■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 KRT6BP04259 564 aa22.74■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 HMOX2P30519 316 aa22.74■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 BDKRB1P46663 353 aa22.74■■□□□ 1.23
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